| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 插图索引 | 第9-10页 |
| 附表索引 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-15页 |
| ·项目来源 | 第11页 |
| ·研究背景和意义 | 第11-12页 |
| ·研究现状 | 第12-14页 |
| ·论文主要工作与结构安排 | 第14页 |
| ·小结 | 第14-15页 |
| 第2章 RNA的二级结构与预测方法 | 第15-30页 |
| ·RNA二级结构 | 第15-17页 |
| ·RNA二级结构的简单子结构 | 第16页 |
| ·假结 | 第16-17页 |
| ·RNA二级结构的形式化描述 | 第17页 |
| ·RNA二级结构预测方法 | 第17-29页 |
| ·比较序列分析方法和SCFG模型 | 第17-19页 |
| ·动态规划方法 | 第19-24页 |
| ·智能优化方法 | 第24-29页 |
| ·小结 | 第29-30页 |
| 第3章 基于混合优化算法的RNA二级结构预测算法 | 第30-42页 |
| ·引言 | 第30页 |
| ·基础知识 | 第30-31页 |
| ·茎区自由共存 | 第30-31页 |
| ·独立集 | 第31页 |
| ·方法 | 第31-36页 |
| ·能量模型 | 第31-32页 |
| ·茎区池的构建与优化 | 第32-33页 |
| ·无向图的构建 | 第33-34页 |
| ·HTSACO算法求解无向图的极大独立集 | 第34-36页 |
| ·假结的寻找 | 第36页 |
| ·实验与结论 | 第36-41页 |
| ·实验 | 第36-41页 |
| ·结论 | 第41页 |
| ·小结 | 第41-42页 |
| 第4章 基于拟序集求解茎区组合的RNA二级结构预测算法 | 第42-50页 |
| ·引言 | 第42-43页 |
| ·基础知识 | 第43页 |
| ·方法 | 第43-46页 |
| ·有向图的构建 | 第43-44页 |
| ·基于拟序集求解极大链 | 第44-45页 |
| ·假结预测 | 第45-46页 |
| ·实验与结论 | 第46-49页 |
| ·茎区池构建分析 | 第46-47页 |
| ·结果分析 | 第47-48页 |
| ·算法效率 | 第48页 |
| ·结论 | 第48-49页 |
| ·小结 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录A 攻读硕士期间发表的论文和参与的项目 | 第58页 |