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陆地棉重要经济性状全基因组关联分析及优异位点挖掘

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略语表第11-12页
第一章 文献综述第12-36页
    1.1 我国棉花种质资源研究现状第12-15页
        1.1.1 棉花在农业生产中的重要地位第12-13页
        1.1.2 棉花的种属分类第13-14页
        1.1.3 我国陆地棉资源研究的重要性第14-15页
    1.2 陆地棉种植资源遗传特征研究第15-24页
        1.2.1 我国棉花品种改良的研究进展第15-18页
        1.2.2 陆地棉遗传多样性的研究第18-19页
        1.2.3 陆地棉数量性状的研究第19-24页
    1.3 植物全基因组关联分析研究进展第24-35页
        1.3.1 关联分析的概述第25-26页
        1.3.2 关联分析的原理第26-30页
        1.3.3 关联分析的统计和分析第30-31页
        1.3.4 关联分析策略第31-33页
        1.3.5 关联分析的应用第33-35页
    1.4 本研究的目的和意义第35-36页
第二章 陆地棉遗传多样性和群体结构的分析第36-49页
    2.1 前言第36-37页
    2.2 材料和方法第37-39页
        2.2.1 实验材料和DNA提取第37页
        2.2.2 SSR标记基因型和遗传多样性统计分析第37-38页
        2.2.3 群体结构分析方法第38页
        2.2.4 连锁不平衡(LD)和LD衰减分析方法第38-39页
    2.3 结果与分析第39-45页
        2.3.1 遗传多样性第39-40页
        2.3.2 群体结构分析第40-43页
        2.3.3 连锁不平衡分析第43-45页
    2.4 讨论第45-49页
        2.4.1 关联分析自然群体的构成第45-46页
        2.4.2 分子遗传多样性的评价第46页
        2.4.3 关联分析中群体结构的评价第46-47页
        2.4.4 关联分析中连锁不平衡分析第47-49页
第三章 陆地棉品质和产量性状的表型分析第49-65页
    3.1 前言第49-50页
    3.2 材料和方法第50-51页
        3.2.1 田间试验和表型数据的调查第50-51页
        3.2.2 表型数据的分析第51页
    3.3 结果与分析第51-64页
        3.3.1 纤维品质和产量性状表型变异和遗传力的分析第51-57页
        3.3.2 纤维品质和产量性状间相关性的分析第57-58页
        3.3.3 纤维品质和产量性状在多环境的变化趋势第58-61页
        3.3.4 纤维品质和产量性状环境间的相关性分析第61-64页
    3.4 讨论第64-65页
        3.4.1 纤维品质性状的表型变异分析第64页
        3.4.2 产量性状的表型变异分析第64-65页
第四章 陆地棉品质和产量性状的关联分析第65-96页
    4.1 前言第65-66页
    4.2 材料和方法第66-67页
        4.2.1 关联分析模型的选择第66页
        4.2.2 纤维品质性状和不同育种阶段产量性状表型效应的统计分析第66-67页
        4.2.3 挖掘优异等位基因及相关功能基因注释第67页
    4.3 结果与分析第67-86页
        4.3.1 纤维品质性状的关联分析第67-73页
        4.3.2 产量性状的关联分析第73-86页
    4.4 讨论第86-96页
        4.4.1 与纤维品质和产量性状关联的QTL第86-94页
        4.4.2 育种中应用第94-96页
参考文献第96-118页
附录第118-149页
    附录1 503份种质资源的系谱信息第118-143页
    附录2 与纤维品质性状关联的优异等位基因位点在亚洲棉基因组比对结果第143-145页
    附录3 与纤维品质性状关联的优异等位基因位点在雷蒙德氏棉基因组比对结果第145-147页
    附录4 与纤维品质性状关联的优异等位基因位点在陆地棉基因组比对结果第147-149页
攻读学位期间发表论文情况第149-150页
致谢第150-151页

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