ALK5抑制剂的分子设计和分子动力学模拟
| 中文摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-13页 |
| 1.1 转化生长因子Β的功能简介 | 第10-11页 |
| 1.2 TGF-ΒS受体和信号传导通路 | 第11-12页 |
| 1.3 ALK5抑制剂的研究进展 | 第12-13页 |
| 第2章 理论基础与计算方法 | 第13-31页 |
| 2.1 定量构效关系 | 第13-15页 |
| 2.2 分子对接 | 第15-17页 |
| 2.2.1 分子对接机制 | 第16页 |
| 2.2.2 分子对接步骤 | 第16-17页 |
| 2.3 分子力学 | 第17-22页 |
| 2.3.1 分子力场 | 第18-22页 |
| 2.3.2 分子力学 | 第22页 |
| 2.4 分子动力学模拟 | 第22-28页 |
| 2.4.1 积分算法 | 第23-27页 |
| 2.4.2 分子动力学模拟的步骤 | 第27-28页 |
| 2.5 结合自由能的计算 | 第28-31页 |
| 2.5.1 MM/PBSA和MM/GBSA的原理 | 第29-31页 |
| 第3章 ALK5抑制剂的分子模拟研究 | 第31-49页 |
| 3.1 引言 | 第31页 |
| 3.2 理论方法 | 第31-38页 |
| 3.2.1 定量构效关系 | 第31-36页 |
| 3.2.2 分子对接 | 第36-37页 |
| 3.2.3 分子动力学模拟 | 第37-38页 |
| 3.2.4 结合自由能的计算 | 第38页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第38-49页 |
| 3.3.1 定量构效关系 | 第38-40页 |
| 3.3.2 分子对接 | 第40-42页 |
| 3.3.3 分子动力学模拟分析 | 第42-44页 |
| 3.3.4 结合自由能的计算和分析 | 第44-49页 |
| 第4章 结论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-58页 |
| 个人简介及攻读学位期间发表论文 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
