摘要 | 第3-4页 |
abstract | 第4页 |
第一章 前言 | 第8-15页 |
1.1 神经干细胞 | 第8-10页 |
1.1.1 神经干细胞简介 | 第8页 |
1.1.2 神经干细胞在中枢神经系统再生中的作用 | 第8-9页 |
1.1.3 CD133阳性细胞简介 | 第9-10页 |
1.2 单细胞转录组测序 | 第10-13页 |
1.2.1 单细胞分离技术 | 第10-11页 |
1.2.2 Smart-seq2技术进行单细胞转录组扩增 | 第11-13页 |
1.3 脊髓损伤类疾病简介 | 第13-14页 |
1.4 本论文研究意义 | 第14-15页 |
第二章 实验设备与试剂耗材 | 第15-17页 |
2.1 实验设备 | 第15-16页 |
2.2 试剂耗材 | 第16-17页 |
第三章 实验方法 | 第17-28页 |
3.1 小鼠脊髓中央管单细胞获取 | 第17-18页 |
3.1.1 主要试剂 | 第17页 |
3.1.2 单细胞获取方法 | 第17-18页 |
3.2 单细胞RNA逆转录 | 第18-19页 |
3.2.1 主要试剂 | 第18页 |
3.2.2 逆转录方法 | 第18-19页 |
3.2.3 反转录合成cDNA | 第19页 |
3.3 PCR扩增 | 第19-20页 |
3.3.1 主要试剂 | 第19页 |
3.3.2 PCR扩增方法 | 第19-20页 |
3.4 纯化 | 第20-21页 |
3.4.1 主要试剂 | 第20页 |
3.4.2 纯化方法 | 第20-21页 |
3.5 2100检测 | 第21-22页 |
3.5.1 主要试剂 | 第21页 |
3.5.2 检测方法 | 第21-22页 |
3.6 cDNA建库 | 第22-25页 |
3.6.1 主要试剂 | 第22页 |
3.6.2 cDNA片段化 | 第22-23页 |
3.6.3 cDNAPCR富集 | 第23-24页 |
3.6.4 扩增产物长度分选 | 第24-25页 |
3.7 Qubit检测 | 第25-26页 |
3.7.1 Qubit标定(Qubit3.0) | 第25页 |
3.7.2 Qubit定量检测 | 第25-26页 |
3.8 生物信息学分析方法 | 第26-28页 |
3.8.1 基因丰度估计 | 第26页 |
3.8.2 类型划分 | 第26页 |
3.8.3 样本相关性分析 | 第26页 |
3.8.4 markergenes相关性分析 | 第26-27页 |
3.8.5 主成分分析 | 第27页 |
3.8.6 WGCNA | 第27-28页 |
第四章 实验结果 | 第28-44页 |
4.1 流式分选结果 | 第28-29页 |
4.2 2100检测结果 | 第29-30页 |
4.3 Qubit标定结果 | 第30-31页 |
4.4 QPCR结果 | 第31-33页 |
4.4.1 CD133阳性细胞QPCR | 第31-32页 |
4.4.2 CD133阴性细胞QPCR结果 | 第32-33页 |
4.5 cDNA文库片段检测结果 | 第33-34页 |
4.6 测序结果分析 | 第34-44页 |
4.6.1 无监督聚类结果 | 第34-35页 |
4.6.2 PCA分类结果 | 第35-36页 |
4.6.3 基因表达热图 | 第36-37页 |
4.6.4 筛选软阈值结果 | 第37-40页 |
4.6.5 WGCNA基因功能分析 | 第40-44页 |
第五章 总结与讨论 | 第44-45页 |
致谢 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-49页 |