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C57小鼠脊髓中央管CD133阳性神经干细胞转录组测序及其谱系研究

摘要第3-4页
abstract第4页
第一章 前言第8-15页
    1.1 神经干细胞第8-10页
        1.1.1 神经干细胞简介第8页
        1.1.2 神经干细胞在中枢神经系统再生中的作用第8-9页
        1.1.3 CD133阳性细胞简介第9-10页
    1.2 单细胞转录组测序第10-13页
        1.2.1 单细胞分离技术第10-11页
        1.2.2 Smart-seq2技术进行单细胞转录组扩增第11-13页
    1.3 脊髓损伤类疾病简介第13-14页
    1.4 本论文研究意义第14-15页
第二章 实验设备与试剂耗材第15-17页
    2.1 实验设备第15-16页
    2.2 试剂耗材第16-17页
第三章 实验方法第17-28页
    3.1 小鼠脊髓中央管单细胞获取第17-18页
        3.1.1 主要试剂第17页
        3.1.2 单细胞获取方法第17-18页
    3.2 单细胞RNA逆转录第18-19页
        3.2.1 主要试剂第18页
        3.2.2 逆转录方法第18-19页
        3.2.3 反转录合成cDNA第19页
    3.3 PCR扩增第19-20页
        3.3.1 主要试剂第19页
        3.3.2 PCR扩增方法第19-20页
    3.4 纯化第20-21页
        3.4.1 主要试剂第20页
        3.4.2 纯化方法第20-21页
    3.5 2100检测第21-22页
        3.5.1 主要试剂第21页
        3.5.2 检测方法第21-22页
    3.6 cDNA建库第22-25页
        3.6.1 主要试剂第22页
        3.6.2 cDNA片段化第22-23页
        3.6.3 cDNAPCR富集第23-24页
        3.6.4 扩增产物长度分选第24-25页
    3.7 Qubit检测第25-26页
        3.7.1 Qubit标定(Qubit3.0)第25页
        3.7.2 Qubit定量检测第25-26页
    3.8 生物信息学分析方法第26-28页
        3.8.1 基因丰度估计第26页
        3.8.2 类型划分第26页
        3.8.3 样本相关性分析第26页
        3.8.4 markergenes相关性分析第26-27页
        3.8.5 主成分分析第27页
        3.8.6 WGCNA第27-28页
第四章 实验结果第28-44页
    4.1 流式分选结果第28-29页
    4.2 2100检测结果第29-30页
    4.3 Qubit标定结果第30-31页
    4.4 QPCR结果第31-33页
        4.4.1 CD133阳性细胞QPCR第31-32页
        4.4.2 CD133阴性细胞QPCR结果第32-33页
    4.5 cDNA文库片段检测结果第33-34页
    4.6 测序结果分析第34-44页
        4.6.1 无监督聚类结果第34-35页
        4.6.2 PCA分类结果第35-36页
        4.6.3 基因表达热图第36-37页
        4.6.4 筛选软阈值结果第37-40页
        4.6.5 WGCNA基因功能分析第40-44页
第五章 总结与讨论第44-45页
致谢第45-46页
参考文献第46-49页

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