| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 前言 | 第15-37页 |
| 1.1 亲缘地理学 | 第15-23页 |
| 1.1.1 亲缘地理学的发展历史 | 第15页 |
| 1.1.2 亲缘地理学解析的科学问题及其理论依据 | 第15-18页 |
| 1.1.3 亲缘地理学研究中常用的分子标记 | 第18-21页 |
| 1.1.4 亲缘地理学研究中的统计软件 | 第21-23页 |
| 1.1.5 亲缘地理学发展趋势 | 第23页 |
| 1.2 东亚植物亲缘地理学研究现状和存在的问题 | 第23-34页 |
| 1.2.1 与欧洲和北美的亲缘地理学研究的比较 | 第24页 |
| 1.2.2 东亚东部地区地质历史背景 | 第24-25页 |
| 1.2.3 东亚植物亲缘地理学研究现状 | 第25-27页 |
| 1.2.4 存在的问题 | 第27-29页 |
| 1.2.5 蛛网萼属的分类学特性 | 第29-33页 |
| 1.2.6 蛛网萼属研究现状 | 第33-34页 |
| 1.2.7 研究中存在的问题 | 第34页 |
| 1.3 研究目的,拟解决的主要问题 | 第34-37页 |
| 1.3.1 研究目的 | 第34页 |
| 1.3.2 拟解决的主要问题 | 第34-35页 |
| 1.3.3 研究意义 | 第35-36页 |
| 1.3.4 实验设计流程图 | 第36-37页 |
| 第2章 野外调查及材料采集 | 第37-46页 |
| 2.1 中国—日本植物地理区系 | 第37页 |
| 2.2 野外调查和取样方法 | 第37-38页 |
| 2.3 野外调查结果小结 | 第38-45页 |
| 2.3.1 中国群体野外生境 | 第38-40页 |
| 2.3.2 野外采样信息总结 | 第40-42页 |
| 2.3.3 生境现状 | 第42-45页 |
| 2.4 总基因组DNA的提取 | 第45-46页 |
| 第3章 基于叶绿体DNA的群体遗传多样性与谱系地理结构研究 | 第46-66页 |
| 3.1 材料与方法 | 第46-53页 |
| 3.1.1 cpDNA引物筛选,PCR扩增及序列测定 | 第46-47页 |
| 3.1.2 序列的拼接和群体遗传学分析 | 第47-48页 |
| 3.1.3 cpDNA系统发育分析和分歧时间估计 | 第48-50页 |
| 3.1.4 群体失配分布分析 | 第50-53页 |
| 3.1 结果 | 第53-60页 |
| 3.1.1 cpDNA单倍型分布与群体内遗传多样性 | 第53页 |
| 3.1.2 cpDNA群体遗传结构 | 第53-57页 |
| 3.1.3 cpDNA单倍型的系统发生与谱系关系 | 第57页 |
| 3.1.4 分子钟估算和群体历史 | 第57-60页 |
| 3.2 讨论 | 第60-64页 |
| 3.2.1 cpDNA核苷酸多态性与群体结构 | 第60-61页 |
| 3.2.2 蛛网萼的cpDNA亲缘地理学分析 | 第61-62页 |
| 3.2.3 蛛网萼群体的扩张事件 | 第62-63页 |
| 3.2.4 中国和日本蛛网萼不同的群体分化历史 | 第63-64页 |
| 3.3 本章小结 | 第64-66页 |
| 第4章 基于nrDNA ITS和单拷贝核基因Tpi的研究 | 第66-80页 |
| 4.1 实验和分析方法 | 第66-68页 |
| 4.1.1 nrDNA ITS片段的扩增和测序 | 第66页 |
| 4.1.2 单拷贝核基因Tpi的PCR扩增及测序 | 第66-67页 |
| 4.1.3 对nrDNA ITS和单拷贝核基因Tpi杂合子的检测 | 第67页 |
| 4.1.4 序列分析 | 第67-68页 |
| 4.2 结果 | 第68-80页 |
| 4.2.1 核基因的序列特征及中型检测 | 第68-73页 |
| 4.2.2 ITS和Tpi揭示的遗传多样性、系统关系与谱系地理结构 | 第73-80页 |
| 第5章 基于微卫星标记(nSSRs)的群体遗传学研究 | 第80-97页 |
| 5.1 蛛网萼特异的微卫星引物开发 | 第80-87页 |
| 5.1.1 方法 | 第80-87页 |
| 5.2 基于7个微卫星引物的蛛网萼群体遗传学研究 | 第87-97页 |
| 5.2.1 研究方法 | 第87-89页 |
| 5.2.2 研究结果 | 第89-97页 |
| 第6章 基于多位点的分化群体遗传学分析 | 第97-103页 |
| 6.1 方法原理 | 第97页 |
| 6.2 分析方法 | 第97-98页 |
| 6.3 研究结果 | 第98-103页 |
| 第7章 基于生态位模型(ENM)的研究 | 第103-109页 |
| 7.1 原理介绍 | 第103-104页 |
| 7.2 分析方法 | 第104-105页 |
| 7.3 研究结果 | 第105-108页 |
| 小结 | 第108-109页 |
| 第8章 保护遗传学意义 | 第109-113页 |
| 8.1 保护遗传学简介及其意义 | 第109-110页 |
| 8.2 保护遗传学的研究方法 | 第110页 |
| 8.3 蛛网萼的保护策略 | 第110-113页 |
| 8.3.1 群体遗传结构及进化显著单元的确立 | 第110-111页 |
| 8.3.2 有效群体大小的评估 | 第111页 |
| 8.3.3 生境的保护 | 第111-113页 |
| 第9章 讨论、总结和展望 | 第113-124页 |
| 9.1 讨论 | 第113-121页 |
| 9.1.1 蛛网萼两个变种的地位 | 第113-115页 |
| 9.1.2 中国东海(East China Sea)的生态作用：过滤器(Filter)还是生态走廊(Corri dor)? | 第115-116页 |
| 9.1.3 蛛网萼群体的冰期避难所和群体动态历史 | 第116-117页 |
| 9.1.4 第四纪冰后期日本群体的二次接触和中国群体的不完全谱系分选 | 第117-121页 |
| 9.2 总结 | 第121-122页 |
| 9.3 展望 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-147页 |
| 攻读博士学位期间主要的研究成果 | 第147-148页 |
| 致谢 | 第148-149页 |
