细菌sRNA靶标数据库3.0构建及其功能注释研究
| 缩略词表 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 前言 | 第12-24页 |
| 1 研究背景 | 第12-16页 |
| 1.1 细菌sRNA调控机制 | 第12-14页 |
| 1.2 细菌sRNA的识别 | 第14-15页 |
| 1.3 细菌sRNA靶标的预测和验证 | 第15-16页 |
| 2 国内外研究现状 | 第16-22页 |
| 2.1 RegulonDB数据库 | 第16-17页 |
| 2.2 Rfam数据库 | 第17页 |
| 2.3 NPInter数据库 | 第17-18页 |
| 2.4 sRNAMap数据库 | 第18-19页 |
| 2.5 sRNAdb数据库 | 第19-20页 |
| 2.6 BSRD数据库 | 第20-21页 |
| 2.7 sRNATarBase数据库 | 第21-22页 |
| 3 研究内容 | 第22-23页 |
| 3.1 细菌sRNA靶标数据库 3.0 构建 | 第22页 |
| 3.2 细菌sRNA功能注释研究 | 第22-23页 |
| 4 课题意义 | 第23-24页 |
| 第一部分 细菌sRNA靶标数据库 3.0 构建 | 第24-41页 |
| 1 数据结构 | 第24-27页 |
| 1.1 sRNA靶标相关数据 | 第25-26页 |
| 1.2 功能注释数据 | 第26-27页 |
| 1.3 服务器数据 | 第27页 |
| 2 数据收集 | 第27-28页 |
| 2.1 sRNATarBase2.0 | 第27页 |
| 2.2 文献阅读 | 第27-28页 |
| 2.3 已知数据集比对 | 第28页 |
| 3 数据统计 | 第28-30页 |
| 4 数据库网站 | 第30-39页 |
| 4.1 数据库检索 | 第30-34页 |
| 4.2 RNA二级结构动态显示 | 第34-36页 |
| 4.3 NCBI序列展示 | 第36-37页 |
| 4.4 sRNA调控网络 | 第37-38页 |
| 4.5 预测靶标及其注释 | 第38页 |
| 4.6 进化分析 | 第38页 |
| 4.7 其他功能 | 第38-39页 |
| 5 总结与讨论 | 第39-41页 |
| 5.1 总结 | 第39-40页 |
| 5.2 讨论 | 第40页 |
| 5.3 未来的展望 | 第40-41页 |
| 第二部分 细菌sRNA功能注释研究 | 第41-47页 |
| 1 研究背景 | 第41页 |
| 2 研究内容 | 第41页 |
| 3 技术路线 | 第41-42页 |
| 4 材料与方法 | 第42-43页 |
| 4.1 数据来源 | 第42页 |
| 4.2 靶标预测 | 第42页 |
| 4.3 统计学分析 | 第42-43页 |
| 5 CosTar服务器 | 第43-45页 |
| 5.1 sRNA2Gene | 第43-44页 |
| 5.2 Gene2sRNA | 第44-45页 |
| 6 总结与讨论 | 第45-47页 |
| 6.1 总结 | 第45页 |
| 6.2 讨论 | 第45页 |
| 6.3 未来的展望 | 第45-47页 |
| 总结 | 第47-48页 |
| 图片索引 | 第48-49页 |
| 表格索引 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-53页 |
| 附录 | 第53-74页 |
| 1 预测靶标处理程序 | 第53-56页 |
| 2 数据库网站的统计图表 | 第56-58页 |
| 3 BSRD中sRNA统计表 | 第58-61页 |
| 4 Cos Tar批量靶标预测流程 | 第61-68页 |
| 5 进化分析结果 | 第68-74页 |
| 个人简历 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
