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猪和甲型流感病毒microRNA预测软件系统

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-12页
第一章 文献综述第12-33页
   ·关于miRNA 基因第12-19页
     ·miRNA 的发现第12-14页
     ·miRNA 的加工调控第14-17页
     ·miRNA 的作用机制第17-18页
     ·miRNA 和siRNA 的区别第18页
     ·miRNA 的功能第18-19页
   ·数据挖掘与支持向量机(Support Vector Machine,SVM)第19-21页
     ·生物信息学中的特征提取(Feature Select, FS)第20页
     ·支持向量机(SVM)第20-21页
   ·生物信息与计算机语言第21-24页
     ·生物信息中的Java第21-22页
     ·生物信息中的Perl第22-23页
     ·miRNA 的数据库第23-24页
   ·miRNA 的计算识别第24-28页
     ·同源片段搜索方法第24-26页
     ·基于比较基因组学的预测miRNA第26页
     ·序列和结构特征打分的预测方法第26-27页
     ·通过机器学习方法的预测miRNA第27页
     ·miRNA 预测方法比较第27-28页
   ·猪miRNA 的研究现状第28-32页
     ·猪基因组第28-30页
     ·猪miRNA 的研究现状第30-32页
   ·猪源性甲型H1N1 流感病毒第32页
   ·本研究的目的与意义第32-33页
第二章 基于支持向量机识别猪pre-miRNA第33-41页
   ·研究背景第33-34页
   ·材料和方法第34-36页
     ·相关的数据第34页
     ·开发环境和开发工具第34-35页
     ·特征向量的提取第35页
     ·SVM 训练过程第35-36页
   ·结果第36-40页
   ·讨论第40-41页
第三章 从猪小RNA 文库中搜索非保守的miRNA第41-46页
   ·研究背景第41页
   ·材料和方法第41-43页
     ·相关的数据第41页
     ·相关的工具和环境第41页
     ·利用SusMiRPred 对小RNA 库进行再分析第41-43页
   ·结果第43-44页
   ·讨论第44-46页
第四章 基于同源搜索方法预测猪pre-miRNA第46-52页
   ·研究背景第46页
   ·材料与方法第46-47页
     ·相关的数据第46页
     ·相关工具和环境第46页
     ·猪miRNA 的预测第46-47页
   ·结果与讨论第47-52页
第五章 甲型H1N1 流感病毒miRNA 预测第52-57页
   ·研究背景第52页
   ·材料和方法第52-54页
     ·相关数据的获得第52页
     ·使用的软件和开发环境第52页
     ·病毒miRNA 的预测第52-54页
   ·结果和讨论第54-57页
第六章 结论第57-58页
参考文献第58-64页
致谢第64-65页
作者简介第65页

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