| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 1 绪论 | 第11-15页 |
| 1.1 生物计算的背景 | 第11-12页 |
| 1.2 DNA计算基本思想 | 第12-14页 |
| 1.3 本文结构 | 第14-15页 |
| 2 DNA生物计算 | 第15-26页 |
| 2.1 DNA分子结构 | 第15-16页 |
| 2.2 DNA分子操作 | 第16-20页 |
| 2.2.1 DNA分子的变性与复性 | 第16-17页 |
| 2.2.2 DNA链的自我复制 | 第17-18页 |
| 2.2.3 DNA链的内切和外切 | 第18-19页 |
| 2.2.4 DNA分子的连接 | 第19-20页 |
| 2.3 DNA分子的编码 | 第20-26页 |
| 2.3.1 DNA编码问题 | 第20-21页 |
| 2.3.2 DNA编码的约束条件 | 第21-23页 |
| 2.3.3 DNA编码方法 | 第23-26页 |
| 3 DNA计算模型 | 第26-32页 |
| 3.1 DNA粘贴模型 | 第26页 |
| 3.2 DNA剪接模型 | 第26-27页 |
| 3.3 质粒DNA模型 | 第27-28页 |
| 3.4 分子信标 | 第28-30页 |
| 3.5 DNA自组装模型 | 第30-32页 |
| 4 基本理论介绍 | 第32-34页 |
| 4.1 最小顶点覆盖问题 | 第32页 |
| 4.2 可满足性问题 | 第32-33页 |
| 4.3 0-1规划问题 | 第33-34页 |
| 5 最小顶点覆盖问题的DNA自组装算法研究 | 第34-38页 |
| 5.1 最小顶点覆盖问题的转化 | 第34页 |
| 5.2 最小顶点覆盖的DNA自组装算法 | 第34-35页 |
| 5.2.1 可满足性问题基本算法 | 第34-35页 |
| 5.2.2 生物操作步骤 | 第35页 |
| 5.3 实例分析 | 第35-37页 |
| 5.4 本章小结 | 第37-38页 |
| 6 基于质粒DNA模型的MVCP研究 | 第38-42页 |
| 6.1 MVCP的质粒DNA算法 | 第38-39页 |
| 6.1.1 将最小顶点覆盖问题转化成0-1规划问题 | 第38页 |
| 6.1.2 算法设计 | 第38-39页 |
| 6.2 实例分析 | 第39-40页 |
| 6.3 本章小结 | 第40-42页 |
| 总结和展望 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 作者简介及读研期间主要科研成果 | 第47页 |