| 中文摘要 | 第5-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 第一章 绪论 | 第16-29页 |
| 1.1 NF-κB信号通路组成 | 第16-17页 |
| 1.2 NF-κB信号通路激活 | 第17-19页 |
| 1.3 NF-κB的靶miRNA | 第19-23页 |
| 1.3.1 miRNA的生物起源 | 第19-20页 |
| 1.3.2 NF-κB靶miRNA的分子病理功能 | 第20-23页 |
| 1.4 NF-κB的靶基因 | 第23-27页 |
| 1.4.1 NF-κB的靶基因与炎症 | 第23页 |
| 1.4.2 NF-κB的靶基因与肿瘤 | 第23-27页 |
| 1.5 研究意义和内容 | 第27-29页 |
| 第二章 TNFα诱导HeLa细胞中NF-κB调控的miRNA | 第29-47页 |
| 2.1 引言 | 第29-30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-34页 |
| 2.2.1 主要实验材料及仪器 | 第30-31页 |
| 2.2.2 细胞培养及转染 | 第31页 |
| 2.2.3 miRNA-测序和qPCR检测 | 第31页 |
| 2.2.4 核蛋白提取和Western blot检测 | 第31-32页 |
| 2.2.5 ChIP-Seq和qPCR检测 | 第32-33页 |
| 2.2.6 miRNA靶基因预测 | 第33-34页 |
| 2.2.7 基因芯片数据分析 | 第34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-43页 |
| 2.3.1 NF-κB调控的miRNA的鉴定 | 第34-35页 |
| 2.3.2 NF-κB结合的miRNA的鉴定 | 第35-37页 |
| 2.3.3 NF-κB靶miRNA的鉴定 | 第37-39页 |
| 2.3.4 NF-κB靶miRNA调控的基因鉴定 | 第39-41页 |
| 2.3.5 miR-125b-1为NF-κB通路中的“信号传递中心” | 第41-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-45页 |
| 2.5 本章总结 | 第45-47页 |
| 第三章 NF-κB与其靶miR1276共调控CASP9基因 | 第47-64页 |
| 3.1 引言 | 第47-48页 |
| 3.2 材料与方法 | 第48-51页 |
| 3.2.1 主要试剂材料及仪器 | 第48页 |
| 3.2.2 细胞培养及转染 | 第48页 |
| 3.2.3 细胞凋亡检测 | 第48-49页 |
| 3.2.4 qPCR检测基因表达 | 第49页 |
| 3.2.5 ChIP-Seq数据和qPCR检测 | 第49-50页 |
| 3.2.6 报告基因质粒构建和检测 | 第50页 |
| 3.2.7 蛋白提取和Western blot检测 | 第50-51页 |
| 3.2.8 CASP9 mRNA上的miR1276结合位点预测 | 第51页 |
| 3.3 结果与分析 | 第51-60页 |
| 3.3.1 TNFα诱导NF-κB结合CASP9基因 | 第51-53页 |
| 3.3.2 TNFα诱导NF-κB转录调控CASP9基因 | 第53-55页 |
| 3.3.3 NF-κB间接调控CASP9基因 | 第55-59页 |
| 3.3.4 NF-κB上调CASP9对TNFα促进阿霉素诱导细胞凋亡的影响 | 第59-60页 |
| 3.4 讨论 | 第60-63页 |
| 3.5 本章总结 | 第63-64页 |
| 第四章 癌症相关NF-κB靶基因的鉴定 | 第64-79页 |
| 4.1 引言 | 第64-65页 |
| 4.2 材料与方法 | 第65-67页 |
| 4.2.1 主要试剂材料及仪器 | 第65页 |
| 4.2.2 高通量数据及分析 | 第65-66页 |
| 4.2.3 细胞培养及转染 | 第66页 |
| 4.2.4 ChIP-qPCR检测 | 第66页 |
| 4.2.5 报告基因质粒构建和检测 | 第66页 |
| 4.2.6 RNA抽提和qPCR检测 | 第66-67页 |
| 4.2.7 蛋白抽提和Western blot检测 | 第67页 |
| 4.3 结果与分析 | 第67-75页 |
| 4.3.1 癌症相关的NF-κB潜在靶基因的发现 | 第67-69页 |
| 4.3.2 NF-κB对CYCS、MITF、FZD1、FZD8和PIAS1的结合情况 | 第69-73页 |
| 4.3.3 NF-κB对CYCS、MITF、FZD1、FZD8和PIAS1的调控情况 | 第73-75页 |
| 4.4 讨论 | 第75-77页 |
| 4.5 本章总结 | 第77-79页 |
| 第五章 NF-κB调控三羧酸循环关键酶基因 | 第79-92页 |
| 5.1 引言 | 第79-80页 |
| 5.2 材料与方法 | 第80-83页 |
| 5.2.1 主要试剂材料及仪器 | 第80页 |
| 5.2.2 ChIP-Seq数据及分析 | 第80-81页 |
| 5.2.3 细胞培养及转染 | 第81页 |
| 5.2.4 ChIP-qPCR检测 | 第81页 |
| 5.2.5 报告基因质粒构建和检测 | 第81页 |
| 5.2.6 RNA抽提和qPCR检测 | 第81-82页 |
| 5.2.7 蛋白抽提和Western blot检测 | 第82页 |
| 5.2.8 代谢活力测定 | 第82-83页 |
| 5.3 结果与分析 | 第83-90页 |
| 5.3.1 NF-κB对TCA循环关键酶基因的结合情况 | 第83-86页 |
| 5.3.2 NF-κB对TCA循环关键酶基因的调控情况 | 第86-88页 |
| 5.3.3 NF-κB对代谢活力的影响 | 第88-90页 |
| 5.4 讨论 | 第90-91页 |
| 5.5 本章总结 | 第91-92页 |
| 第六章 NF-κB调控神经母细胞瘤基因NBPF | 第92-110页 |
| 6.1 引言 | 第92-93页 |
| 6.2 材料与方法 | 第93-95页 |
| 6.2.1 主要试剂材料及仪器 | 第93页 |
| 6.2.2 ChIP-Seq数据及分析 | 第93页 |
| 6.2.3 细胞培养及处理 | 第93-94页 |
| 6.2.4 RNA抽提和qPCR检测 | 第94页 |
| 6.2.5 蛋白抽提和Western blot检测 | 第94页 |
| 6.2.6 免疫荧光检测 | 第94页 |
| 6.2.7 生物信息学方法 | 第94-95页 |
| 6.3 结果与分析 | 第95-104页 |
| 6.3.1 NBPF基因区中NF-κB结合峰 | 第95-97页 |
| 6.3.2 NF-κB对NBPF的调控情况 | 第97-100页 |
| 6.3.3 NBPF蛋白的细胞核定位检测 | 第100-101页 |
| 6.3.4 NBPF蛋白的核定位信号预测 | 第101-102页 |
| 6.3.5 NBPF蛋白的3D结构预测 | 第102-104页 |
| 6.4 讨论 | 第104-105页 |
| 6.5 本章总结 | 第105-110页 |
| 第七章 总结与展望 | 第110-113页 |
| 参考文献 | 第113-126页 |
| 作者简介 | 第126-128页 |
| 致谢 | 第128页 |
