肉鸭空肠组织饲料转化率及胸肌组织发育相关基因的富集与分析
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1. 文献综述 | 第11-24页 |
| 1.1 中国肉鸭育种研究进展 | 第11-17页 |
| 1.1.1 我国鸭品种概况 | 第11页 |
| 1.1.2 肉鸭育种 | 第11-16页 |
| 1.1.3 北京鸭和枫叶鸭品种简介 | 第16-17页 |
| 1.2 转录组测序技术 | 第17-22页 |
| 1.2.1 第一代测序技术 | 第17-18页 |
| 1.2.2 第二代测序技术 | 第18-20页 |
| 1.2.3 第三代测序技术 | 第20-21页 |
| 1.2.4 转录组测序技术的应用 | 第21-22页 |
| 1.3 本研究目的及意义 | 第22-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-30页 |
| 2.1 试验材料 | 第24-25页 |
| 2.2 总RNA提取 | 第25-26页 |
| 2.2.1 主要试剂及试剂盒 | 第25页 |
| 2.2.2 试验步骤 | 第25-26页 |
| 2.3 文库构建与测序 | 第26-27页 |
| 2.4 测序数据的质量控制 | 第27页 |
| 2.5 参考转录组的拼接 | 第27页 |
| 2.6 转录子的注释 | 第27-28页 |
| 2.7 比对与表达量统计 | 第28页 |
| 2.8 差异表达基因分析 | 第28页 |
| 2.9 GO和KEGG pathway分析 | 第28-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-59页 |
| 3.1 表型统计结果 | 第30-31页 |
| 3.2 测序结果以及质量控制 | 第31-34页 |
| 3.3 序列拼接结果 | 第34-36页 |
| 3.4 拼接转录子的注释 | 第36-37页 |
| 3.5 读数比对结果 | 第37-39页 |
| 3.6 表达量统计 | 第39页 |
| 3.7 差异基因结果 | 第39-49页 |
| 3.8 GO功能注释富集结果 | 第49-55页 |
| 3.9 KEGG pathway分析 | 第55-59页 |
| 4. 讨论 | 第59-63页 |
| 4.1 不同品系和相同品系肉鸭的对比 | 第59页 |
| 4.2 从头拼接转录组的策略 | 第59-60页 |
| 4.3 转录子注释的策略 | 第60-61页 |
| 4.4 空肠组织免疫功能相关基因的差异表达 | 第61页 |
| 4.5 胸肌组织脂肪代谢相关基因的差异表达 | 第61-63页 |
| 5 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 攻读期间发表论文 | 第70页 |
