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高效的基因靶向修饰技术的建立及其应用研究

摘要第3-7页
Abstract第7-9页
目录第10-15页
图表索引第15-18页
缩略词表第18-22页
第1章 绪论第22-44页
    1.1 遗传性疾病研究现状第22页
    1.2 靶向基因组修饰技术第22-26页
    1.3 锌指核酸酶介导的高效率的靶向基因组修饰技术第26-32页
    1.4 锌指核酸酶技术的应用研究第32-36页
        1.4.1 ZFN技术在基础研究中的应用第32-34页
        1.4.2 ZFN技术在特殊细胞模型建立中的应用第34页
        1.4.3 ZFN技术在基因打靶动、植物建立的应用第34-35页
        1.4.4 ZFN技术在基因治疗中的应用第35-36页
    1.5 锌指核酸酶介导的靶向基因组修饰技术存在的问题第36-37页
    1.6 转录激活因子样效应物核酸酶(Transcription activator-like effectornucleases,TALENs)和RNA引导的核酸酶(RNA-guided nucleases,RGNs)介导的靶向基因组修饰技术第37-44页
第2章 高灵敏度锌指核酸酶筛选方法的建立第44-68页
    2.1 研究背景第44-46页
    2.2 实验材料第46-53页
        2.2.1 细胞株、菌株及动物模型第46页
        2.2.2 质粒及病毒载体第46-48页
        2.2.3 实验中所用引物列表第48-51页
        2.2.4 主要试剂及试剂盒第51-52页
        2.2.5 常用溶液配方第52页
        2.2.6 实验所需主要设备第52-53页
    2.3 实验方法第53-58页
        2.3.1 细胞系的建立第53-54页
        2.3.2 质粒、病毒载体的构建第54-56页
        2.3.3 常规实验方法第56页
        2.3.4 锌指核酸酶生物活性检测实验第56页
        2.3.5 锌指蛋白的组装第56-58页
        2.3.6 锌指蛋白的筛选第58页
        2.3.7 报告基因纠正实验第58页
    2.4 结果和讨论第58-68页
        2.4.1 锌指蛋白的结合力检测第58-62页
        2.4.2 锌指核酸酶活力的检测第62-67页
        2.4.3 小结与讨论第67-68页
第3章 同时携带锌指核酸酶和供体DNA的腺病毒载体的构建及其在体内外的打靶效率研究第68-92页
    3.1 研究背景第68-69页
    3.2 实验材料第69-76页
        3.2.1 细胞株、菌株及动物模型第69-70页
        3.2.2 质粒及病毒载体第70-71页
        3.2.3 实验中所用引物列表第71-72页
        3.2.4 主要试剂及试剂盒第72-74页
        3.2.5 常用溶液配方第74页
        3.2.6 实验所需主要设备第74-76页
    3.3 实验方法第76-80页
        3.3.1 细胞系的建立第76页
        3.3.2 质粒、病毒载体的构建第76-77页
        3.3.3 常规实验方法第77页
        3.3.4 报告基因纠正实验第77-78页
        3.3.5 锌指核酸酶毒性检测实验(免疫染色、流式)第78页
        3.3.6 体外基因打靶效率检测第78页
        3.3.7 体内基因打靶效率检测第78-79页
        3.3.8 锌指核酸酶切割效率和同源重组效率检测第79页
        3.3.9 病毒包装效率检测第79页
        3.3.10 Southern blot第79-80页
    3.4 结果和讨论第80-92页
        3.4.1 严谨型Tet-on调控系统的构建及测试第80-85页
        3.4.2 携带锌指核酸酶和供体DNA的腺病毒在体外靶向纠正的效率研究第85-88页
        3.4.3 携带锌指核酸酶和供体DNA的腺病毒在体内靶向纠正的效率研究第88-89页
        3.4.4 小结与讨论第89-92页
第4章 携带多个可线性化供体DNA片段的载体在体外的打靶效率研究第92-112页
    4.1 研究背景第92-93页
    4.2 实验材料第93-99页
        4.2.1 细胞株、菌株及动物模型第93页
        4.2.2 质粒及病毒载体第93-95页
        4.2.3 实验中所用引物列表第95-96页
        4.2.4 主要试剂及试剂盒第96-98页
        4.2.5 常用溶液配方第98页
        4.2.6 实验所需主要设备第98-99页
    4.3 实验方法第99-104页
        4.3.1 细胞系的建立第99-100页
        4.3.2 质粒、病毒载体的构建第100-101页
        4.3.3 常规实验方法第101-102页
        4.3.4 报告基因纠正实验第102页
        4.3.5 体外基因打靶效率检测第102页
        4.3.6 锌指核酸酶切割效率和同源重组效率检测第102-103页
        4.3.7 供体DNA细胞内释放效率检测第103页
        4.3.8 Southern blot第103-104页
    4.4 结果和讨论第104-112页
        4.4.1 携带多个可线性化供体DNA片段的质粒载体在体外的打靶效率研究第104-108页
        4.4.2 携带多个可线性化供体DNA片段的腺病毒载体在体外的打靶效率研究第108-109页
        4.4.3 小结与讨论第109-112页
第5章 高效的基因靶向修饰技术在溶酶体储积症致病基因GUS的纠正中的应用研究第112-140页
    5.1 研究背景第112-114页
    5.2 实验材料第114-122页
        5.2.1 细胞株、菌株及动物模型第114页
        5.2.2 质粒及病毒载体第114-116页
        5.2.3 实验中所用引物列表第116-119页
        5.2.4 主要试剂及试剂盒第119-120页
        5.2.5 常用溶液配方第120页
        5.2.6 实验所需主要设备第120-122页
    5.3 实验方法第122-132页
        5.3.1 细胞系的建立第122-123页
        5.3.2 质粒、病毒载体的构建第123-129页
        5.3.3 常规实验方法第129页
        5.3.4 GUS TALENs和GUS sgRNA切割效率的检测第129-131页
        5.3.5 GUS TALENs和Cas9-GUS sgRNA对C57 MEF GUS~(-/-)中突变的GUS基因的纠正效果检测 第131-132页
    5.4 结果和讨论第132-140页
        5.4.1 GUS缺失的MEF细胞系的建立第132页
        5.4.2 TALEN介导的靶向基因组编辑技术在GUS突变的疾病模型中的治疗研究第132-134页
        5.4.3 Cas9-sgRNA介导的靶向基因组编辑技术在GUS突变的疾病模型中的治疗研究第134-137页
        5.4.4 小结和讨论第137-140页
结论第140-142页
参考文献第142-160页
附录第160-222页
    附录一 常用试剂配方第160-166页
    附录二 常规实验流程第166-168页
    附录三 研究生期间构建载体列表第168-222页
致谢第222-226页
攻读学位期间的研究成果第226-228页

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