| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 引言 | 第10页 |
| 1.2 数据库 | 第10-11页 |
| 1.3 虚拟筛选 | 第11-17页 |
| 1.3.1 分子对接 | 第11-12页 |
| 1.3.2 自由能计算和分子力场 | 第12-14页 |
| 1.3.3 药效团模型 | 第14-16页 |
| 1.3.4 定量构效关系 | 第16页 |
| 1.3.5 分子动力学模拟 | 第16-17页 |
| 1.4 结语 | 第17-18页 |
| 第二章 MORT：用于计算生物学与CADD的基础库 | 第18-30页 |
| 2.1 引言 | 第18页 |
| 2.2 数据结构和其基本特征 | 第18-23页 |
| 2.2.1 关系模型 | 第18-20页 |
| 2.2.2 分子构成 | 第20-22页 |
| 2.2.3 分子对象的使用 | 第22页 |
| 2.2.4 分子对象的迭代 | 第22-23页 |
| 2.3 MORT各块的功能 | 第23-28页 |
| 2.3.1 对象相关的函数 | 第24-27页 |
| 2.3.2 性质相关的函数 | 第27-28页 |
| 2.4 结论 | 第28-30页 |
| 第三章 基于规则的键型判别算法 | 第30-47页 |
| 3.1 引言 | 第30-32页 |
| 3.2 材料和方法 | 第32-40页 |
| 3.2.1 连接的识别 | 第32-33页 |
| 3.2.2 过连接的纠正 | 第33-34页 |
| 3.2.3 硬规则 | 第34-36页 |
| 3.2.4 长度规则 | 第36-37页 |
| 3.2.5 共轭规则 | 第37-39页 |
| 3.2.6 修复错误的键 | 第39-40页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第40-45页 |
| 3.4 结论 | 第45-47页 |
| 第四章 论文总结 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-64页 |
| 攻读学位期间本人出版或公开发表的论著、论文 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |