| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略语 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-13页 |
| 研究现状、成果 | 第11-12页 |
| 研究目的、方法 | 第12-13页 |
| 对象和方法 | 第13-25页 |
| 1.1 实验对象 | 第13-20页 |
| 1.1.1 诊断标准 | 第13-14页 |
| 1.1.2 临床问诊及口腔检查的质量控制 | 第14页 |
| 1.1.3 口腔检查和分组 | 第14-20页 |
| 1.2 腐质提取 | 第20-21页 |
| 1.3 腐质处理 | 第21页 |
| 1.4 患牙的治疗 | 第21-22页 |
| 1.4.1 正常牙髓深龋患牙的治疗 | 第21页 |
| 1.4.2 可复性牙髓炎患牙的治疗 | 第21页 |
| 1.4.3 有症状不可复性牙髓炎患牙的治疗 | 第21-22页 |
| 1.5 b16S rDNA测序 | 第22页 |
| 1.5.1 基因组DNA提取 | 第22页 |
| 1.5.2 扩增子生成 | 第22页 |
| 1.5.3 PCR产品定量和鉴定 | 第22页 |
| 1.5.4 PCR产物混合和纯化 | 第22页 |
| 1.5.5 文库制备和测序 | 第22页 |
| 1.6 物种注释 | 第22-23页 |
| 1.6.1 数据拆分 | 第22页 |
| 1.6.2 序列组装 | 第22-23页 |
| 1.6.3 数据过滤 | 第23页 |
| 1.6.4 嵌合体去除 | 第23页 |
| 1.6.5 OTUs产生 | 第23页 |
| 1.6.6 物种注释 | 第23页 |
| 1.6.7 统发育关系 | 第23页 |
| 1.6.8 数据规范化 | 第23页 |
| 1.7 数据分析 | 第23-25页 |
| 1.7.1 阿尔法多样性 | 第23-25页 |
| 1.7.2 Beta多样性 | 第25页 |
| 1.7.3 冗余分析（Redundancy Analysis，RDA 分析） | 第25页 |
| 结果 | 第25-39页 |
| 2.1 牙髓敏感测试临床检查指标分析 | 第25-28页 |
| 2.2 OTUs分析 | 第28-31页 |
| 2.2.1 样本间菌种OTUs分析 | 第28-29页 |
| 2.2.2 组间OUTs分析 | 第29-31页 |
| 2.3 Alpha多样性分析 | 第31-33页 |
| 2.3.1 观测物种 | 第31-32页 |
| 2.3.2 香农指数 | 第32-33页 |
| 2.4 Beta多样性分析 | 第33-39页 |
| 2.4.1 主坐标分析（PCoA分析） | 第34页 |
| 2.4.2 非度量多维尺度分析(non-metric multi-dimensional scaling, NMDS) | 第34-35页 |
| 2.4.3 LEfSe分析（ linear discriminant analysis (LDA) effect size） | 第35-38页 |
| 2.4.4 线性模型冗余分析（Redundancy Analysis，RDA 分析） | 第38-39页 |
| 讨论 | 第39-46页 |
| 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-51页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第51-52页 |
| 综述 深龋患牙诊断治疗文献回顾 | 第52-62页 |
| 综述参考文献 | 第57-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 个人简历 | 第63页 |
