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基于3D-QSAR和分子对接的PCBs迁移和生物降解特性研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第11-24页
    1.1 选题背景及其意义第11-14页
        1.1.1 PCBs的性质、污染及危害第11-12页
        1.1.2 PCBs的全球迁移第12-13页
        1.1.3 PCBs的生物降解第13-14页
    1.2 国内外研究动态第14-22页
        1.2.1 定量构效关系的国内外研究动态第14-16页
        1.2.2 3D-QSAR模型国内外研究简介第16-17页
        1.2.3 PCBs迁移能力研究简介第17-20页
        1.2.4 分子对接技术研究简介第20-21页
        1.2.5 PCBs的微生物降解酶研究简介第21-22页
    1.3 存在的问题第22页
    1.4 本文的主要研究内容和意义第22-24页
第2章 计算软件与研究方法第24-32页
    2.1 SYBYL软件简介第24页
    2.2 3D-QSAR方法简介第24-28页
        2.2.1 模型数据收集第24页
        2.2.2 模型分子的构建及其能量优化第24-25页
        2.2.3 分子模建第25-26页
        2.2.4 模型稳定性和可靠性评价第26-28页
        2.2.5 模型解译第28页
    2.3 分子对接方法简介第28-32页
        2.3.1 分子对接原理第28-29页
        2.3.2 分子对接方法分类第29页
        2.3.3 分子对接数据来源第29-30页
        2.3.4 分子对接的过程第30-31页
        2.3.5 打分函数简介第31-32页
第3章 基于 3D-QSAR模型的PCBs KOA预测第32-51页
    3.1 模型数据来源第32页
    3.2 3D-QSAR模型的构建第32-33页
        3.2.1 分子构象优化及叠合第32页
        3.2.2 Co MFA与Co MSIA力场分析第32-33页
        3.2.3 偏最小二乘法分析第33页
    3.3 PCBs迁移能力(KOA值)的预测第33-41页
    3.4 Co MFA和Co MSIA模型解译第41-45页
        3.4.1 基于预测PCBs KOA值的Co MFA模型解译第41-42页
        3.4.2 基于预测PCBs KOA值的Co MSIA模型解译第42-45页
    3.5 Co MFA和Co MSIA模型的三维等势图分析第45-48页
        3.5.1 Co MFA模型的三维等势图分析第45-47页
        3.5.2 Co MSIA模型的三维等势图分析第47-48页
    3.6 Co MFA和Co MSIA模型差异性分析第48页
    3.7 PCBs环境迁移能力分析第48-50页
    3.8 本章小结第50-51页
第4章 基于分子对接PCBs与Bph A的降解研究第51-64页
    4.1 蛋白质受体结构来源第51页
    4.2 分子对接的参数确定第51-52页
    4.3 PCBs POPs特性的皮尔森相关性分析第52页
    4.4 基于PCBs结合能的 3D-QSAR构建第52-53页
        4.4.1 Co MFA和Co MSIA力场分析第52页
        4.4.2 偏最小二乘法分析第52-53页
    4.5 Bph A活性位点结合能的计算第53-56页
    4.6 Bph A与PCBs结合能之间的比较分析第56-57页
    4.7 结合能与PCBs分子量及POPs特性分析第57-58页
    4.8 基于PCBs结合能的三维等势图分析第58-63页
    4.9 本章小结第63-64页
第5章 结论与展望第64-66页
    5.1 结论第64-65页
    5.2 本文创新点第65页
    5.3 研究工作展望第65-66页
参考文献第66-79页
攻读硕士学位期间发表的论文第79-80页
致谢第80页

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