| CHINESE ABSTRACT | 第8-25页 |
| ABSTRACT | 第25-44页 |
| DENOTATION | 第45-46页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第46-56页 |
| 1.1 SYSTEMS EPIDEMIOLOGY: THE TWO WORLDS OF TRADITIONAL EPIDEMIOLOGYAND OMICS PLATFORM MEETING AND STAYING TOGETHER | 第47-51页 |
| 1.2 DESIGNS IN SYSTEMS EPIDEMIOLOGY: KEEPING SYSTEMS THINKING IN MIND | 第51-52页 |
| 1.3 STATISTICAL STRATEGY IN SYSTEMS EPIDEMIOLOGY: PUTING THINGS AT THE NETWORK LEVEL | 第52-54页 |
| 1.4 OUTLINE OF THE DISSERTATION | 第54-56页 |
| CHAPTER 2 STATISTICAL INFERENCE FOR IDENTIFICATION AND EFFECT ESTIMATION OF DISEASE-RELATED PATHWAY | 第56-69页 |
| 2.1 BACKGROUND | 第56-57页 |
| 2.2 METHODS | 第57-62页 |
| 2.2.1 Pathway effect and PEM-statistics | 第57-59页 |
| 2.2.2 Non-parametric bootstrap test | 第59页 |
| 2.2.3 Asymptotic normal distribution statistic | 第59-60页 |
| 2.2.4 Simulation | 第60-61页 |
| 2.2.5 Application | 第61-62页 |
| 2.3 RESULTS | 第62-66页 |
| 2.3.1 Simulation results | 第62-65页 |
| 2.3.2 Application results | 第65-66页 |
| 2.4 DISCUSSION | 第66-69页 |
| CHAPTER 3 HYPOTHESIS TEST FOR GROUP DIFFERENCES BETWEEN UNDIRECTED NETWORKS | 第69-90页 |
| 3.1 BACKGROUND | 第69-72页 |
| 3.2 METHODS | 第72-79页 |
| 3.2.1 Statistical model | 第72-75页 |
| 3.2.2 Simulation studies | 第75-77页 |
| 3.2.3 Application | 第77-79页 |
| 3.3 RESULTS | 第79-85页 |
| 3.3.1 Simulation results | 第79-84页 |
| 3.3.2 Application results | 第84-85页 |
| 3.4 DISCUSSION | 第85-90页 |
| CHAPTER 4 HYPOTHESIS TEST FOR GROUP DIFFERENCES BETWEEN DIRECTED NETWORKS | 第90-112页 |
| 4.1 BACKGROUND | 第90-93页 |
| 4.2 METHODS | 第93-101页 |
| 4.2.1 Statistical model | 第93-97页 |
| 4.2.2 Simulation studies | 第97-99页 |
| 4.2.3 Application | 第99-101页 |
| 4.3 RESULTS | 第101-106页 |
| 4.3.1 Simulation results | 第101-105页 |
| 4.3.2 Application results | 第105-106页 |
| 4.4 DISCUSSION | 第106-112页 |
| CHAPTER 5 SCREENING STRATEGY FOR DISEASE-RELATED INTERACTION NETWORK AND ASSESSMENT FOR ITS PREDICTIVE PERFORMANCE | 第112-131页 |
| 5.1 BACKGROUND | 第112-115页 |
| 5.2 METHODS | 第115-121页 |
| 5.2.1 Statistical model | 第115-118页 |
| 5.2.2 Simulation studies | 第118-121页 |
| 5.2.3 Application | 第121页 |
| 5.3 RESULTS | 第121-128页 |
| 5.3.1 Simulation results | 第121-124页 |
| 5.3.2 Application results | 第124-128页 |
| 5.4 DISCUSSION | 第128-131页 |
| CHAPTER 6 CONCLUSIONS | 第131-136页 |
| 6.1 INNOVATIONS | 第133-134页 |
| 6.2 LIMITATIONS | 第134-136页 |
| REFERENCES | 第136-143页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第143-144页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第144-145页 |
| 附表 | 第145-146页 |
| 附件 | 第146-173页 |
