摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
第一章 文献综述 | 第13-33页 |
1 花生产业现状及发展前景 | 第13页 |
2 种子的休眠与萌发 | 第13-28页 |
2.1 种子休眠与萌发的定义 | 第14-15页 |
2.2 种子休眠性分类 | 第15页 |
2.3 种子休眠的影响因素 | 第15-18页 |
2.4 种子休眠萌发的分子调控机制 | 第18-28页 |
3 转录组测序 | 第28-30页 |
4 花生种子休眠性研究 | 第30-31页 |
5 本研究目的意义 | 第31-33页 |
第二章 花生种子休眠性的影响因素 | 第33-39页 |
1 材料与方法 | 第33-34页 |
1.1 供试材料 | 第33页 |
1.2 方法 | 第33-34页 |
1.3 数据分析 | 第34页 |
2 结果与分析 | 第34-38页 |
2.1 品种种子休眠性差异 | 第34-35页 |
2.2 种子休眠性与成熟度的关系 | 第35页 |
2.3 种子休眠性与贮藏温度的关系 | 第35-36页 |
2.4 种子休眠萌发过程中内源激素变化 | 第36-38页 |
3 讨论 | 第38-39页 |
3.1 花生品种休眠性的差异 | 第38页 |
3.2 影响花生种子休眠的因素 | 第38-39页 |
第三章 花生种子休眠解除转录组及验证分析 | 第39-57页 |
1 材料与方法 | 第39-45页 |
1.1 供试材料 | 第39页 |
1.2 试剂 | 第39-40页 |
1.3 RNA的提取和质量检测 | 第40页 |
1.4 Illumina/Solexa转录组文库的构建与测序 | 第40-42页 |
1.5 转录组结果验证分析 | 第42-44页 |
1.6 数据处理 | 第44-45页 |
2 结果与分析 | 第45-54页 |
2.1 高质量RNA的提取和转录组文库的高效构建 | 第45-47页 |
2.2 RNA-seq序列分析和拼接组装 | 第47-48页 |
2.3 序列功能注释与功能分类 | 第48-51页 |
2.4 差异表达unigenes分析 | 第51-53页 |
2.5 花生种子转录组差异表达基因的验证 | 第53-54页 |
3 讨论 | 第54-57页 |
3.1 花生种子休眠解除转录组文库的构建 | 第54-55页 |
3.2 花生种子休眠解除过程相关基因的变化 | 第55-57页 |
第四章 花生种子休眠解除过程差异基因的分析 | 第57-89页 |
第一节 花生生长素抑制蛋白基因AhARP的表达分析 | 第57-64页 |
1 材料与方法 | 第58页 |
1.1 供试材料 | 第58页 |
1.2 花生总RNA的提取及cDNA的合成 | 第58页 |
1.3 荧光定量PCR | 第58页 |
1.4 花生AhARP基因生物信息学分析 | 第58页 |
2 结果与分析 | 第58-62页 |
2.1 花生AhARP基因的cDNA全长序列分析 | 第58-59页 |
2.2 AhARP氨基酸组成与分析 | 第59-60页 |
2.3 AhARP蛋白结构分析 | 第60页 |
2.4 花生AhARP与其它物种的同源比对及系统进化树分析 | 第60-61页 |
2.5 AhARP基因在种子吸胀萌发过程表达的差异性 | 第61-62页 |
3 讨论 | 第62-64页 |
第二节 花生种子休眠解除过程与激素相关基因的表达分析 | 第64-81页 |
1 材料与方法 | 第64-65页 |
1.1 供试材料 | 第64页 |
1.2 主要试剂与仪器 | 第64-65页 |
1.3 试验方法 | 第65页 |
1.4 差异表达分析 | 第65页 |
1.5 目的基因片段生物信息学分析 | 第65页 |
2 结果与分析 | 第65-77页 |
2.1 与ABA、GA、ETH、auxin相关的unigenes表达差异显著性 | 第65-66页 |
2.2 ABA相关基因的表达分析 | 第66-67页 |
2.3 GA相关基因的表达分析 | 第67页 |
2.4 ETH相关基因的表达分析 | 第67-69页 |
2.5 auxin相关基因表达变化分析 | 第69-70页 |
2.6 花生AhNCED2基因片段的cDNA序列和表达分析 | 第70-71页 |
2.7 花生AhCYP707A1基因片段的cDNA序列和表达分析 | 第71-73页 |
2.8 花生AhACO1基因的cDNA序列和表达分析 | 第73-77页 |
3 讨论 | 第77-81页 |
3.1 ABA合成代谢信号转导关键基因的表达分析 | 第77-78页 |
3.2 GA合成代谢关键基因的表达分析 | 第78页 |
3.3 乙烯合成代谢关键基因的表达分析 | 第78-79页 |
3.4 生长素合成代谢关键基因的表达分析 | 第79页 |
3.5 花生种子休眠解除过程中激素间的交互作用 | 第79-80页 |
3.6 AhNCED2和AhCYP707A1的表达分析 | 第80页 |
3.7 AhACO1的表达分析 | 第80-81页 |
第三节 花生种子萌发基因AhSGR的表达分析 | 第81-89页 |
1 材料与方法 | 第81-82页 |
1.1 供试材料 | 第81页 |
1.2 试验方法 | 第81-82页 |
1.3 引物设计 | 第82页 |
1.4 荧光定量PCR的表达量计算 | 第82页 |
1.5 花生目的基因生物信息学分析 | 第82页 |
2 结果与分析 | 第82-87页 |
2.1 花生AhSGR基因全长cDNA的序列分析 | 第82-83页 |
2.2 花生AhSGR推导的氨基酸序列同源性 | 第83-84页 |
2.3 花生AhSGR编码蛋白的生物信息学分析 | 第84-85页 |
2.4 花生AhSGR基因的表达差异 | 第85-86页 |
2.5 花生不同组织AhSGR基因的荧光定量表达 | 第86-87页 |
3 讨论 | 第87-89页 |
第五章 全文总结 | 第89-91页 |
1 全文结论 | 第89-90页 |
1.1 花生种子休眠性的影响因素 | 第89页 |
1.2 花生种子休眠解除转录组及验证分析 | 第89页 |
1.3 花生种子休眠解除过程差异基因的分析 | 第89-90页 |
2 本研究的创新之处 | 第90-91页 |
参考文献 | 第91-105页 |
附录 | 第105-113页 |
在读期间发表和投稿论文 | 第113-115页 |
致谢 | 第115页 |