| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-24页 |
| 1.1 毒理基因组学在药物安全性评价中的研究进展 | 第13-20页 |
| 1.1.1 毒理基因组学的概念 | 第13-14页 |
| 1.1.2 毒理基因组学的技术平台 | 第14页 |
| 1.1.3 毒理基因组学的安全性预测评价方法 | 第14-18页 |
| 1.1.4 毒理基因组学在药物安全性评价中的应用 | 第18-19页 |
| 1.1.5 毒理基因组学的问题与展望 | 第19-20页 |
| 1.2 药物毒性相关蛋白研究概况 | 第20-22页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第22-24页 |
| 第二章 基于毒理基因组学的潜在肝毒性连通图构建 | 第24-38页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 实验部分 | 第25-29页 |
| 2.2.1 数据准备 | 第25-27页 |
| 2.2.1.1 基因表达谱参考库数据集 | 第25-26页 |
| 2.2.1.2 外部验证数据集 | 第26-27页 |
| 2.2.2 实验数据预处理 | 第27-29页 |
| 2.3 方法 | 第29-33页 |
| 2.3.1 Kolmogorov-Smirnov检验 | 第29-30页 |
| 2.3.2 秩排序算法 | 第30-32页 |
| 2.3.3 计算P-value的随机扰动算法 | 第32-33页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第33-36页 |
| 2.4.1 算法的可靠性验证 | 第33-34页 |
| 2.4.2 外部数据分析 | 第34-36页 |
| 2.5 本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基于毒理基因组学的潜在肝毒性分析平台-LTMap的实现与使用 | 第38-48页 |
| 3.1 引言 | 第38-39页 |
| 3.2 需求概述 | 第39-43页 |
| 3.2.1 功能需求 | 第39页 |
| 3.2.2 体系结构 | 第39-40页 |
| 3.2.3 开发工具 | 第40-43页 |
| 3.3 平台的功能实现 | 第43-46页 |
| 3.3.1 分析模块 | 第43-46页 |
| 3.3.2 其他功能 | 第46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-48页 |
| 第四章 基于药物-靶点-副作用关联的药物副作用评价方法的构建 | 第48-56页 |
| 4.1 引言 | 第48-49页 |
| 4.2 实验部分 | 第49-50页 |
| 4.2.1 数据准备 | 第49页 |
| 4.2.2 数据处理 | 第49-50页 |
| 4.3 方法 | 第50-53页 |
| 4.3.1 SEA(similarityensemble approach)算法 | 第50-52页 |
| 4.3.2 Enrichment Factor(EF)算法 | 第52-53页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第53-54页 |
| 4.5 本章小结 | 第54-56页 |
| 第五章 基于药物-靶点-副作用关联的药物副作用预测平台的开发 | 第56-66页 |
| 5.1 引言 | 第56页 |
| 5.2 需求概述 | 第56-59页 |
| 5.2.1 功能需求 | 第56-57页 |
| 5.2.2 体系结构 | 第57页 |
| 5.2.3 开发工具 | 第57-59页 |
| 5.3 平台的功能实现 | 第59-65页 |
| 5.3.1 Analysis模块 | 第60-62页 |
| 5.3.2 Browser模块 | 第62-63页 |
| 5.3.3 Network模块 | 第63-65页 |
| 5.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 第六章 总结与展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-78页 |
| 作者简历 | 第78页 |
