| 符号说明 | 第1-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 1 前言 | 第14-31页 |
| ·水稻黑条矮缩病 | 第14-15页 |
| ·水稻黑条矮缩病的危害 | 第14页 |
| ·水稻黑条矮缩病毒的形态与分类 | 第14页 |
| ·病毒与介体昆虫的关系 | 第14-15页 |
| ·寄主范围 | 第15页 |
| ·水稻黑条矮缩病表形性状 | 第15页 |
| ·抗病毒水稻资源的筛选和发掘 | 第15页 |
| ·转基因技术培育新水稻品种 | 第15-19页 |
| ·转基因技术的发展 | 第15-16页 |
| ·RBSDV病害控制的基因工程策略 | 第16页 |
| ·RNA沉默 | 第16-17页 |
| ·RNA介导病毒抗性的特点 | 第17页 |
| ·农杆菌介导的水稻转化技术研究 | 第17页 |
| ·转化过程中的选择性标记基因 | 第17-18页 |
| ·RNAi在抗水稻黑条矮缩病毒方面的应用 | 第18-19页 |
| ·转基因作物安全性评价 | 第19-25页 |
| ·转基因作物可能带来的食品安全性风险 | 第19-20页 |
| ·转基因作物可能带来的环境安全性风险 | 第20-21页 |
| ·转基因安全性评价的原则 | 第21-22页 |
| ·我国转基因作物食用安全性评价程序 | 第22-23页 |
| ·我国目前转基因作物应用现状 | 第23-24页 |
| ·人们对转基因作物看法 | 第24-25页 |
| ·转基因水稻插入位点确认 | 第25-26页 |
| ·TAIL-PCR | 第25页 |
| ·反向PCR | 第25-26页 |
| ·染色体步移 | 第26页 |
| ·高通量测序 | 第26-28页 |
| ·RNA-seq | 第27-28页 |
| ·RNA-seq的采集数据的处理 | 第28页 |
| ·SWATH技术在蛋白组学的应用 | 第28-29页 |
| ·SWATH测序 | 第28-29页 |
| ·SWATH技术与其他数据采集策略的比较 | 第29页 |
| ·本研究的目的意义 | 第29-31页 |
| 2 材料与方法 | 第31-53页 |
| ·材料 | 第31页 |
| ·水稻材料 | 第31页 |
| ·菌株与质粒 | 第31页 |
| ·酶和生化试剂 | 第31页 |
| ·引物合成 | 第31页 |
| ·转基因水稻的抗性分析 | 第31-33页 |
| ·转基因植株的PPT抗性检测 | 第31页 |
| ·转基因植株的抗病性鉴定 | 第31-32页 |
| ·bar基因PCR检测 | 第32-33页 |
| ·转基因水稻植株的农艺性状测定 | 第33页 |
| ·田间管理 | 第33页 |
| ·测定方法 | 第33页 |
| ·种子中营养因子含量测定 | 第33-38页 |
| ·水分测定方法 | 第33-34页 |
| ·灰分测定 | 第34页 |
| ·维生素VE测定 | 第34-35页 |
| ·维生素VB1测定 | 第35页 |
| ·维生素VB2测定 | 第35页 |
| ·原子吸收法测定样品中矿物质含量 | 第35页 |
| ·电感耦合等离子体质谱法测定样品中金属元素含量 | 第35-36页 |
| ·水稻种子蛋白质含量测定 | 第36-37页 |
| ·SDS-PAGE电泳 | 第37页 |
| ·胰蛋白酶抑制活性测定 | 第37-38页 |
| ·植酸含量测定 | 第38页 |
| ·转基因水稻插入基因拷贝数确认 | 第38-41页 |
| ·植物总DNA的酶切 | 第38-39页 |
| ·DNA凝胶电泳 | 第39页 |
| ·转膜 | 第39-40页 |
| ·探针标记 | 第40页 |
| ·预杂交与杂交 | 第40页 |
| ·洗膜与显影 | 第40-41页 |
| ·插入基因在水稻染色体上的定位 | 第41-45页 |
| ·hiTAIL-PCR反应体系 | 第41-42页 |
| ·hiTAIL-PCR三轮反应的步骤 | 第42-43页 |
| ·Genome walking方法获得侧翼序列 | 第43-45页 |
| ·RNA提取 | 第45-47页 |
| ·植物组织破碎 | 第45-46页 |
| ·RNA的抽提 | 第46页 |
| ·小分子RNA的抽提 | 第46-47页 |
| ·NORTHERN杂交 | 第47-48页 |
| ·RNA-SEQ数据采集 | 第48-50页 |
| ·样品RNA前处理 | 第48-49页 |
| ·信息分析流程 | 第49-50页 |
| ·测序数据质量评估 | 第50页 |
| ·数据处理 | 第50页 |
| ·基因表达定量方法 | 第50页 |
| ·SWATH分析蛋白质组 | 第50-53页 |
| ·蛋白前处理程序 | 第50-51页 |
| ·仪器方法 | 第51-52页 |
| ·数据处理步骤 | 第52-53页 |
| 3 结果与分析 | 第53-73页 |
| ·转基因水稻的PPT抗性及病毒抗性分析 | 第53-55页 |
| ·转基因植株的PPT抗性鉴定 | 第53-54页 |
| ·转基因植株的病毒抗性鉴定 | 第54-55页 |
| ·转基因水稻的农艺性状调查 | 第55页 |
| ·种子中营养成分含量测定 | 第55-58页 |
| ·插入基因拷贝数及插入位点分析 | 第58-62页 |
| ·目的基因的拷贝数确定 | 第58页 |
| ·转基因水稻KRBSDV中插入的T-DNA的染色体定位 | 第58-62页 |
| ·RNA-SEQ测序 | 第62-64页 |
| ·SWATH数据采集结果与分析 | 第64-73页 |
| 4 讨论 | 第73-75页 |
| ·转基因插入的非预期效应分析 | 第73-74页 |
| ·抗RBSDV转基因水稻中目的基因和选择标记基因的表达 | 第74-75页 |
| ·转基因水稻的安全性分析 | 第75页 |
| 5 结论 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第93页 |