| 中文摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 英文缩写说明 | 第9-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-20页 |
| ·研究背景 | 第10-14页 |
| ·免疫学背景 | 第10-13页 |
| ·免疫组学和免疫信息学背景 | 第13-14页 |
| ·国内外研究现状 | 第14-18页 |
| ·猪相关数据库研究现状 | 第14-16页 |
| ·免疫相关数据库研究现状 | 第16-18页 |
| ·选题依据和主要研究内容 | 第18-20页 |
| ·选题依据 | 第18页 |
| ·主要研究内容 | 第18-20页 |
| 第二章 相关生物信息学研究技术理论 | 第20-25页 |
| ·序列比对算法 | 第20-21页 |
| ·同源建模 | 第21-23页 |
| ·线性B细胞表位预测方法 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 LAMP开发平台概述及搭建 | 第25-29页 |
| ·LAMP开发平台概述 | 第25-28页 |
| ·Linux操作系统 | 第25-26页 |
| ·Web服务器Apache | 第26-27页 |
| ·MySQL数据库管理系统 | 第27页 |
| ·PHP后台脚本编程语言 | 第27-28页 |
| ·LAMP开发环境搭建 | 第28页 |
| ·Apache的编译与安装 | 第28页 |
| ·安装MySQL | 第28页 |
| ·安装PHP | 第28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第四章 猪免疫组学信息平台数据整合 | 第29-43页 |
| ·材料与方法 | 第29-34页 |
| ·数据来源 | 第29页 |
| ·整合抗体分子结构和序列数据 | 第29-30页 |
| ·整合抗体CDR区序列数据 | 第30-32页 |
| ·整合MHC分子结构和序列数据 | 第32页 |
| ·整合猪B细胞表位信息数据及构建MySQL数据库 | 第32-33页 |
| ·整合猪T细胞表位信息数据及构建MySQL数据库 | 第33-34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-41页 |
| ·抗体分子的结构库和序列库 | 第34-36页 |
| ·抗体CDR区的序列库 | 第36-39页 |
| ·MHC分子的结构库和序列库 | 第39-40页 |
| ·猪B细胞表位的详细信息和序列信息数据 | 第40-41页 |
| ·猪T细胞表位的详细信息和序列信息数据 | 第41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 第五章 猪免疫组学信息平台的实现 | 第43-54页 |
| ·材料和方法 | 第43-45页 |
| ·安装本地化BLAST工具并构建本地BLAST可用的数据库 | 第43页 |
| ·使用PHP语言调用Blast命令 | 第43页 |
| ·安装MODELLER程序 | 第43-44页 |
| ·使用PHP语言调用MODELLER命令 | 第44页 |
| ·使用PHP语言调用线性B细胞表位预测命令 | 第44-45页 |
| ·使用PHP语言与MySQL数据库交互进行数据查询 | 第45页 |
| ·结果与讨论 | 第45-53页 |
| ·BLAST序列比对功能与序列比对网页的实现 | 第45-50页 |
| ·MODELLER同源建模功能与同源建模网页的实现 | 第50-51页 |
| ·猪线性B细胞表位预测网页的实现 | 第51-52页 |
| ·信息查询功能网页的实现 | 第52-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第六章 猪免疫组学信息平台的应用实例 | 第54-75页 |
| ·材料和方法 | 第54-64页 |
| ·猪免疫球蛋白kappa可变区序列比对及同源建模 | 第54-57页 |
| ·中国荷包猪SLA-1分子序列比对及同源建模 | 第57-60页 |
| ·猪圆环病毒Ⅱ型衣壳蛋白的线性B细胞表位预测 | 第60-62页 |
| ·猪圆环病毒Ⅱ型衣壳蛋白B细胞线性表位信息查询 | 第62-64页 |
| ·猪圆环病毒相关T细胞表位信息查询 | 第64页 |
| ·结果与讨论 | 第64-74页 |
| ·猪免疫球蛋白kappa可变区序列的同源建模 | 第64-69页 |
| ·中国荷包猪SLA-1分子序列比对及同源建模 | 第69-71页 |
| ·猪圆环病毒Ⅱ型衣壳蛋白的线性B细胞表位预测 | 第71-72页 |
| ·猪圆环病毒Ⅱ型衣壳蛋白B细胞表位信息查询 | 第72-73页 |
| ·猪圆环病毒相关T细胞表位信息查询 | 第73-74页 |
| ·本章小结 | 第74-75页 |
| 总结与展望 | 第75-77页 |
| 总结 | 第75-76页 |
| 展望 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 个人简历 | 第83页 |
