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西瓜与枯萎病菌互作的组织学和转录组学初步分析

摘要第1-8页
Abstract第8-15页
第一章 绪论第15-32页
   ·研究目的和意义第15-16页
   ·寄主植物与枯萎病菌互作机理的研究进展第16-20页
     ·寄主植物与枯萎病菌互作的组织病理学研究第16-17页
     ·寄主植物与枯萎病菌互作的生理生化病理学研究第17-19页
     ·寄主植物与枯萎病菌互作的分子生物学研究第19-20页
   ·表达序列标签(EST)分析方法及在植物抗病研究中的应用第20-26页
     ·EST简介第20-21页
     ·EST序列分析第21-24页
     ·EST技术在植物抗病研究中的应用第24-26页
   ·基因芯片技术第26-29页
     ·基因芯片的种类第26-27页
     ·基因芯片数据分析第27-28页
     ·基因芯片技术的应用第28-29页
   ·研究内容和方法第29-32页
第二章 枯萎病菌在西瓜根系侵染和定殖动态的组织学观察第32-48页
   ·前言第32-33页
   ·材料和方法第33-36页
     ·材料第33-34页
     ·方法第34-36页
   ·结果与分析第36-45页
     ·FON1-sGFP转化株的PCR和荧光检测第36-37页
     ·FON1-sGFP的致病力检测第37-38页
     ·FON1-sGFP转化子在西瓜感病寄主上侵染和定殖过程观察第38-41页
     ·FON1-sGFP转化子在抗病寄主中的激光共聚焦的显微镜观察第41-44页
     ·枯萎病菌在西瓜寄主上侵染位点第44-45页
   ·讨论第45-47页
     ·绿色荧光蛋白稳定表达第45页
     ·亲和互作(感病)与非亲和互作(抗病)的差异第45-46页
     ·侵染结构第46-47页
     ·枯萎病菌在西瓜寄主上侵染位点第47页
   ·结论第47-48页
第三章 西瓜与枯萎病菌非亲和互作的表达序列标签分析第48-63页
   ·引言第48页
   ·材料和方法第48-50页
     ·抑制性差减(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)cDNA文库的构建第48-49页
     ·EST序列的聚类与拼接第49-50页
     ·EST序列注释第50页
     ·EST序列功能分类第50页
   ·结果与分析第50-62页
     ·西瓜枯萎病抗感寄主发病进程第50-51页
     ·文库的基本特征第51页
     ·EST 注释与分类第51-52页
     ·参与西瓜与枯萎病非亲和互作过程的基因第52-58页
     ·参与西瓜与枯萎病菌非亲和互作的途径第58-62页
   ·讨论第62页
   ·结论第62-63页
第四章 西瓜与枯萎病菌非亲和互作的基因表达谱分析第63-90页
   ·前言第63页
   ·材料与方法第63-69页
     ·植物材料与接种方法第63-64页
     ·RNA提取第64-65页
     ·定制Agilent 喷墨原位合成芯片第65-66页
     ·荧光定量PCR(Quantitative Real-Time RT-PCR)第66-69页
   ·结果与分析第69-84页
     ·鉴别寄主的抗病指数第69页
     ·差异表达的基因在不同时间点的分布第69-71页
     ·西瓜与枯萎病菌非亲合互作中差异表达基因的功能分类第71-72页
     ·西瓜与枯萎病菌非亲合互作中基因表达的时序性第72-80页
     ·部分基因芯片数据的QRT-PCR验证第80页
     ·参与西瓜与枯萎病菌非亲和互作的茉莉酸(JA)生物合成途径第80-82页
     ·参与西瓜与枯萎病菌非亲和互作的莽草酸-苯丙烷-木质素生物合成途径第82-84页
   ·讨论第84-89页
     ·基因表达的特性第84-85页
     ·转录因子第85-86页
     ·信号与调控基因第86页
     ·细胞壁修饰基因第86-87页
     ·活性氧(Reactive oxygen species)在寄主与病原菌互作中的作用第87页
     ·病程相关蛋白(PR-protein)第87-88页
     ·茉莉酸(JA)在植物与真菌互作中作用第88页
     ·木质素与植物抗病性第88-89页
   ·结论第89-90页
第五章 西瓜与枯萎病菌非亲和互作中相关基因克隆及表达分析第90-107页
   ·引言第90页
   ·材料与方法第90-92页
     ·总RNA的提取与cDNA合成第90页
     ·基因的电子克隆第90-91页
     ·基因的RT-PCR验证第91页
     ·基因的序列分析方法第91页
     ·实时定量QRT-PCR表达分析第91-92页
     ·基因的DNA序列和SNP位点第92页
   ·结果与分析第92-105页
     ·ClPR5 基因的cDNA克隆、序列分析和表达分析第92-100页
     ·ClMYB基因的DNA克隆、序列和表达分析第100-105页
   ·讨论第105-106页
     ·类甜蛋白(thaumatin-like protein)第105-106页
     ·MYB转录因子第106页
   ·结论第106-107页
结论第107-108页
参考文献第108-130页
附录第130-133页
致谢第133-134页
作者简历第134页

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