水稻野栽远源杂交来源的温敏核雄性不育基因tms7的精细定位
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第9-22页 |
| ·水稻雄性不育的研究进展 | 第9-16页 |
| ·水稻雄性不育的分类 | 第9-10页 |
| ·水稻环境敏感性和雄性不育与两系育种 | 第10-11页 |
| ·水稻光温敏雄性核不育的研究进展 | 第11-12页 |
| ·水稻(光)温敏雄性核不育基因的定位与相关克隆 | 第12-15页 |
| ·水稻核雄性不育的细胞学与分子生物学机理 | 第15-16页 |
| ·图位克隆技术与基因定位 | 第16-18页 |
| ·图位克隆技术的原理 | 第16页 |
| ·图位克隆的技术环节 | 第16-18页 |
| ·水稻全基因组重测序 | 第18-21页 |
| ·基因组重测序的技术路线 | 第19-20页 |
| ·全基因组测序后的生物信息学分析 | 第20-21页 |
| ·单核苷酸多态性的生物信息学分析 | 第20页 |
| ·Indel的生物信息学分析 | 第20页 |
| ·结构变异的生物信息学分析 | 第20-21页 |
| ·全基因组测序在育种应用中的优势 | 第21页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-30页 |
| ·材料与试剂 | 第22页 |
| ·植物材料 | 第22页 |
| ·试剂 | 第22页 |
| ·仪器设备 | 第22页 |
| ·方法与步骤 | 第22-27页 |
| ·技术路线 | 第23页 |
| ·温敏雄性不育基因tms7的精细定位 | 第23-27页 |
| ·用于精细定位的F_2代不育群体的构建 | 第23页 |
| ·群体基因组DNA提取 | 第23-24页 |
| ·SSR标记选择 | 第24-26页 |
| ·亲本多态性分析与不育群体分析 | 第26页 |
| ·新的分子标记开发与进一步定位 | 第26-27页 |
| ·遗传图谱构建 | 第27页 |
| ·基因预测与候选基因确定 | 第27-28页 |
| ·突变个体的重测序 | 第28-30页 |
| ·测序流程 | 第28-29页 |
| ·生物信息分析流程 | 第29-30页 |
| 3. 结果与分析 | 第30-45页 |
| ·Tb2s不育基因tms7的精细定位 | 第30-34页 |
| ·F_2代分离群体分析 | 第30页 |
| ·亲本与定位群体材料的总DNA提取 | 第30-31页 |
| ·tms7的精细定位 | 第31-34页 |
| ·遗传图谱的构建 | 第34页 |
| ·定位区间的基因预测和候选基因确定 | 第34-39页 |
| ·定位区间的基因预测与基因注释 | 第34-36页 |
| ·候选基因的寻找 | 第36-39页 |
| ·Tb2s的全基因组重测序 | 第39-45页 |
| ·测序结果的质量确定 | 第39页 |
| ·测序结果与分析 | 第39-41页 |
| ·指定区域比对结果与BAC区域SNP结果 | 第41-42页 |
| ·精细定位区问的重测序序列分析 | 第42-45页 |
| 4 讨论 | 第45-47页 |
| ·定位群体选择和不育单株鉴定 | 第45-46页 |
| ·广亲和性材料在基因定位中的优势 | 第46-47页 |
| ·后续研究工作 | 第47页 |
| 5 结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-55页 |
| 缩略词 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
