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编码CK2激酶底物的c1orf109基因结构与功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-15页
第1章 绪论第15-39页
   ·课题背景及研究的目的和意义第15-16页
   ·c1orf109 基因研究概况第16-17页
   ·真核基因的转录调控第17-27页
     ·染色质结构与基因表达调控第17-21页
     ·转录因子第21-27页
   ·蛋白激酶CK2 及其底物第27-30页
     ·蛋白激酶CK213第27-28页
     ·蛋白激酶CK2 的底物第28-29页
     ·蛋白激酶CK2 与细胞凋亡、肿瘤第29-30页
   ·蛋白质相互作用的检测方法第30-37页
     ·酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid system)第30-31页
     ·免疫共沉淀第31-32页
     ·表面等离子共振第32-33页
     ·串联亲和纯化分析(tandem affinity purification,TAP)第33页
     ·荧光共振能量转移第33-35页
     ·Far-Western blot第35-36页
     ·等温滴定量热技术第36-37页
   ·本文的主要研究内容和技术路线第37-39页
     ·研究内容第37-38页
     ·技术路线第38-39页
第2章 实验材料与方法第39-60页
   ·实验材料第39-45页
     ·细胞系第39-40页
     ·菌株第40页
     ·肝癌临床病例第40页
     ·核酸合成第40-42页
     ·载体第42页
     ·抗体第42页
     ·其他试剂第42-44页
     ·实验仪器第44-45页
     ·生物信息学网站第45页
   ·实验方法第45-59页
     ·细胞培养与细胞转染第45-46页
     ·双荧光素酶活性分析(Dual-luciferase assay)第46页
     ·染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)第46-47页
     ·凝胶电泳迁移率(electrophoretic mobility shift assay,EMSA )第47-50页
     ·免疫共沉淀(co-immunoprecipitation)第50-51页
     ·CK2 激酶对C1ORF109 重组蛋白磷酸化作用分析第51-52页
     ·免疫荧光定位分析第52-53页
     ·细胞组分分离第53页
     ·GST-pull down分析C1ORF109 相互作用分子第53-55页
     ·实时定量PCR(Quantitiative Real-time PCR)第55-56页
     ·Western印迹第56-57页
     ·MTT实验第57页
     ·集落形成实验第57页
     ·侵袭小室分析第57-58页
     ·划痕分析第58页
     ·细胞周期分析第58页
     ·统计学分析第58-59页
   ·本章小结第59-60页
第3章 c1orf109 基因启动子活性分析第60-74页
   ·引言第60页
   ·近端启动子区顺式作用元件的生物信息学预测第60页
   ·近端启动子活性分析第60-64页
   ·远端启动子区顺式作用元件的生物信息学预测第64页
   ·远端启动子的活性分析第64-68页
   ·c1orf109 启动子区与Sp1 结合情况分析第68-72页
   ·讨论第72-73页
   ·本章小结第73-74页
第4章 c1orf109 基因产物结构预测与亚细胞定位分析第74-88页
   ·引言第74页
   ·C1ORF109 蛋白的生物信息学预测第74-78页
     ·C1ORF109 蛋白亲疏水性/跨膜区分析第74-76页
     ·C1ORF109 蛋白质二级结构预测第76页
     ·C1ORF109 蛋白质三级结构预测第76-77页
     ·C1ORF109 蛋白功能域预测第77-78页
   ·C1ORF109 蛋白的磷酸化状态分析第78-79页
   ·C1ORF109 蛋白体外磷酸化分析第79-80页
   ·C1ORF109 的亚细胞定位第80-83页
   ·CK2 激酶磷酸化C1ORF109 蛋白对后者亚细胞定位的影响第83页
   ·讨论第83-87页
   ·本章小结第87-88页
第5章 c1orf109 基因在肿瘤中的表达分析与功能研究第88-101页
   ·前言第88页
   ·c1orf109 基因在肿瘤病例组织中的表达分析第88-89页
   ·C1ORF109 在肿瘤细胞系中的表达分析第89-91页
   ·c1orf109 基因对肿瘤细胞增殖能力的影响第91-96页
   ·c1orf109 基因对肿瘤细胞侵袭能力的影响第96-97页
   ·讨论第97-100页
   ·本章小结第100-101页
第6章 C1ORF109 相互作用因子分析第101-111页
   ·前言第101页
   ·C1ORF109 与MARVELD1 的相互作用分析第101-102页
   ·C1ORF109 磷酸化对其与MARVELD1 间相互作用的影响第102-103页
   ·GST pull-down筛选C1ORF109 的候选相互作用因子第103-109页
   ·讨论第109-110页
   ·本章小结第110-111页
结论第111-113页
参考文献第113-127页
附录Ⅰ第127-128页
附录 II第128-129页
附录Ⅲ第129-131页
附录Ⅳ第131-133页
攻读博士学位期间发表的学术论文及其它成果第133-135页
致谢第135-136页
个人简历第136-137页

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