| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-22页 |
| ·C3 与 C4 植物的比较 | 第11-16页 |
| ·C3 与 C4 植物叶片解剖结构方面的比较 | 第11-12页 |
| ·C3 与 C4 植物的碳同化途径 | 第12-15页 |
| ·C3 与 C4 植物的生理特点 | 第15-16页 |
| ·代谢网络的研究现状 | 第16-21页 |
| ·流平衡分析 | 第17-20页 |
| ·拓扑结构分析 | 第20-21页 |
| ·目的及意义 | 第21-22页 |
| 第二章 C3 与 C4 植物全基因组规模代谢网络的比较分析 | 第22-38页 |
| ·C3 与 C4 植物全基因组代谢网络的拓扑结构分析 | 第23-24页 |
| ·C3 与 C4 植物全基因组代谢网络的流值分析 | 第24-36页 |
| ·通过设置 Rubisco 催化 CO_2/O_2的比值优化模型 | 第24-28页 |
| ·敲除酶对模型流值的影响 | 第28-32页 |
| ·不同环境条件下的比较 | 第32-34页 |
| ·协同变化反应集合 | 第34-36页 |
| ·本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基于约束的 C4 核心代谢模型的构建 | 第38-50页 |
| ·C4 核心代谢无约束模型的构建 | 第38-43页 |
| ·有关 C4 植物玉米的文献和数据库信息整合 | 第38-40页 |
| ·C4 核心代谢无约束模型的构建过程 | 第40-43页 |
| ·整合蛋白质组学数据 | 第43-44页 |
| ·整合组学数据方法的选择 | 第43页 |
| ·整合组学数据到 C4 核心代谢模型 | 第43-44页 |
| ·C4 核心代谢模型的验证 | 第44-48页 |
| ·整合蛋白质组学数据的验证 | 第45-47页 |
| ·环境 CO_2浓度对模型 CO_2固定的影响 | 第47-48页 |
| ·光强对模型光合作用影响曲线的模拟 | 第48页 |
| ·本章小结 | 第48-50页 |
| 第四章 C3 与 C4 植物核心代谢网络的比较分析 | 第50-67页 |
| ·C3PMM 和 C4PMM 的拓扑结构比较 | 第50-54页 |
| ·C3PMM 和 C4PMM 拓扑结构图 | 第50-51页 |
| ·C3PMM 和 C4PMM 的拓扑参数比较 | 第51-52页 |
| ·C3PMM 和 C4PMM 的 K-core 节点群 | 第52-54页 |
| ·C3PMM 与 C4PMM 的流平衡分析 | 第54-58页 |
| ·整合转录组学数据到 C3PMM 模型 | 第54-55页 |
| ·酶对 C3PMM 和 C4PMM 碳固定流值的影响 | 第55-57页 |
| ·网络模块化分析结果 | 第57-58页 |
| ·C4PMM 的拓扑结构分析和流平衡分析 | 第58-61页 |
| ·关键酶的拓扑分析结果 | 第59-60页 |
| ·K-core 节点的流平衡分析结果 | 第60-61页 |
| ·不同环境条件下 C3PMM 和 C4PMM 的比较 | 第61-65页 |
| ·CO_2浓度对 CO_2固定的影响 | 第61-62页 |
| ·O_2浓度对 CO_2固定的影响 | 第62-64页 |
| ·光照强度对 CO_2固定的影响 | 第64-65页 |
| ·本章小结 | 第65-67页 |
| 第五章 结束语 | 第67-69页 |
| ·主要工作与创新点 | 第67-68页 |
| ·主要工作 | 第67-68页 |
| ·主要创新点 | 第68页 |
| ·后续研究工作 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第75-77页 |
