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土壤活性颗粒与DNA的相互作用及其对DNA稳定性、细胞转化和PCR扩增的影响

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-18页
第一章 前言第18-41页
   ·细菌的自然遗传转化第19-23页
     ·DNA的释放及其活性第19-20页
     ·细菌感受态建立第20-22页
     ·感受态细胞对DNA的固定、吸收及基因表达第22-23页
   ·DNA在环境中归宿的研究进展第23-33页
     ·胞外DNA的浓度第23-24页
     ·土壤DNA的提取第24-26页
     ·固定态DNA的抗降解性第26-27页
     ·DNA在土壤颗粒表面吸附的影响因素第27-31页
       ·pH第27-28页
       ·电解质第28-29页
       ·粘土矿物类型第29-30页
       ·DNA分子构型和性质第30-31页
     ·环境中DNA的转化第31-32页
     ·细胞间发生的自然遗传转化第32-33页
   ·DNA研究技术简介第33-40页
     ·原子力显微(AFM)分析第33-35页
     ·微量热分析第35-36页
     ·傅立叶变换红外光谱(FTIR)分析第36-37页
     ·荧光光谱分析第37-38页
     ·圆二色光谱(CD)分析第38页
     ·聚合酶链式反应(PCR)技术第38-40页
   ·论文研究目标和思路第40-41页
第二章 土壤胶体及矿物表面DNA吸附、解吸与结合机制第41-61页
   ·引言第41-42页
   ·材料与方法第42-45页
     ·DNA第42页
     ·土壤胶体和矿物的提取第42页
     ·不同类型棕壤活性颗粒的制备第42页
     ·土壤胶体及矿物基本性质的测定第42-43页
     ·土壤胶体及矿物悬液的制备第43页
     ·不同时间下DNA的吸附第43页
     ·等温吸附第43页
     ·不同pH值下DNA的吸附第43-44页
     ·不同电解质及浓度下DNA的吸附第44页
     ·土壤胶体及矿物表面DNA的解吸第44页
     ·光谱分析第44页
     ·DNA在土壤胶体及矿物表面吸附焓变的测定第44-45页
     ·DNA等温吸附数据分析-Langmuir方程第45页
   ·结果与分析第45-59页
     ·土壤胶体及矿物的表面性质第45-46页
     ·时间对DNA吸附的影响第46-47页
     ·等温吸附曲线第47-48页
     ·pH对DNA吸附的影响第48-49页
     ·电解质对DNA吸附的影响第49-51页
     ·吸附态DNA的解吸第51-52页
     ·DNA构型的变化第52-55页
     ·DNA在土壤胶体或矿物表面吸附的焓变第55-57页
     ·pH对DNA在高岭石和蒙脱石表面吸附焓变的影响第57-58页
     ·MgCl_2浓度对DNA在高岭石和蒙脱石表面吸附焓变的影响第58-59页
   ·讨论第59页
   ·结论第59-61页
第三章 低分子量有机酸和磷酸对DNA吸附的影响第61-67页
   ·引言第61页
   ·材料与方法第61-62页
     ·土壤胶体、矿物及DNA第61页
     ·DNA的吸附实验第61-62页
   ·结果与讨论第62-66页
     ·配体浓度对DNA吸附的影响第62页
     ·配体类型对DNA吸附的影响第62-64页
     ·配体加入顺序对DNA吸附的影响第64-66页
   ·结论第66-67页
第四章 细菌对土壤胶体及矿物体系吸附DNA的影响第67-75页
   ·引言第67页
   ·材料与方法第67-69页
     ·土壤胶体、矿物及DNA第67页
     ·细菌和培养基第67-68页
     ·细菌悬液制备第68页
     ·细菌表面性质的测定第68页
     ·细菌对DNA的吸附第68页
     ·土壤胶体、矿物及其与细菌复合体对DNA的吸附第68页
     ·细菌表面吸附态DNA的解吸第68-69页
     ·土壤胶体、矿物及其与细菌复合体表面吸附态DNA的解吸第69页
   ·结果与讨论第69-74页
     ·细菌的表面性质第69页
     ·DNA在细菌表面的吸附第69-70页
     ·DNA在细菌-土壤胶体或矿物体系中的吸附第70-72页
     ·DNA在细菌表面的解吸第72-73页
     ·DNA在细菌-土壤胶体或矿物体系中的解吸第73-74页
   ·结论第74-75页
第五章 羟基铝包被对DNA在蒙脱石表面吸附的影响第75-88页
   ·引言第75页
   ·材料与方法第75-77页
     ·DNA第75页
     ·粘土矿物第75-76页
     ·羟基铝-蒙脱石复合物基本性质的测定第76页
     ·羟基铝-蒙脱石复合物或蒙脱石悬液的制备第76页
     ·吸附实验第76页
     ·解吸实验第76-77页
     ·DNA在蒙脱石和羟基铝-蒙脱石复合物表面吸附焓变的测定第77页
     ·傅立叶变换红外(FTIR)和扫描电镜(SEM)实验第77页
   ·结果与讨论第77-86页
     ·羟基铝-蒙脱石复合物的分析第77-78页
     ·等温吸附曲线第78-81页
     ·CaCl_2浓度对DNA吸附的影响第81页
     ·pH对DNA吸附的影响第81-82页
     ·DNA解吸第82-83页
     ·DNA在蒙脱石及羟基铝-蒙脱石复合物表面吸附的焓变第83-84页
     ·FTIR分析第84-86页
     ·SEM分析第86页
   ·结论第86-88页
第六章 土壤胶体和矿物表面固定态染色体DNA的降解第88-98页
   ·引言第88页
   ·材料与方法第88-89页
     ·土壤胶体、矿物或DNA第88页
     ·DNase I第88页
     ·凝胶电泳法检测核酸酶对染色体DNA的降解第88-89页
     ·DNase I的吸附第89页
     ·微量热研究游离态和固定态染色体DNA的降解第89页
       ·固定态染色体DNA的制备第89页
       ·DNA的降解第89页
   ·结果与分析第89-96页
     ·土壤胶体和矿物体系中染色体DNA的降解第89-91页
     ·DNase I在土壤胶体和矿物表面的吸附第91-93页
     ·游离态和固定态染色体DNA降解的热力学曲线第93-96页
   ·讨论第96-97页
   ·结论第97-98页
第七章 土壤胶体和矿物表面固定态质粒DNA对大肠杆菌的转化及其对核酸酶降解的抗性第98-105页
   ·引言第98页
   ·材料与方法第98-100页
     ·土壤胶体或矿物第98页
     ·细菌、培养基和质粒DNA第98页
     ·质粒DNA的提取第98-99页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备第99页
     ·土壤胶体或矿物-质粒DNA复合物的制备第99页
     ·游离态和固定态质粒DNA的大肠杆菌转化第99页
     ·游离态和固定态质粒DNA的降解第99-100页
   ·结果与分析第100-103页
     ·不同Ca~(2+)浓度下质粒DNA在土壤胶体和矿物表面的吸附第100页
     ·土壤胶体和矿物表面质粒DNA的解吸第100-101页
     ·土壤胶体和矿物表面固定态质粒DNA对大肠杆菌的转化第101-102页
     ·土壤胶体和矿物对质粒DNA的保护第102-103页
   ·讨论第103-104页
   ·结论第104-105页
第八章 土壤胶体和矿物表面固定态质粒DNA的PCR扩增第105-110页
   ·引言第105页
   ·材料与方法第105-107页
     ·土壤胶体或矿物第105页
     ·针铁矿的合成第105-106页
     ·细菌、培养基和质粒DNA第106页
     ·碱法提取大肠杆菌质粒DNA所用溶液第106页
     ·质粒DNA的提取第106页
     ·土壤胶体或矿物-质粒DNA复合物的制备第106-107页
     ·PCR扩增第107页
   ·结果与讨论第107-109页
     ·质粒DNA在土壤胶体和矿物表面的固定第107-108页
     ·游离态和固定态质粒DNA的PCR扩增第108-109页
   ·结论第109-110页
第九章 微量热技术研究土壤胶体和矿物对大肠杆菌细胞代谢活性的影响第110-114页
   ·引言第110页
   ·材料与方法第110-111页
     ·细菌和培养基第110-111页
     ·大肠杆菌生长的热动力学检测第111页
   ·结果与分析第111-113页
     ·大肠杆菌的生长代谢产热曲线第111-112页
     ·大肠杆菌的生长速率常数第112-113页
   ·结论第113-114页
第十章 研究结论第114-116页
参考文献第116-139页
攻读博士学位期间发表的论文第139-141页
致谢第141页

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