三种鳜属鱼类GH基因的序列及多态性研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 前言 | 第10-18页 |
| ·鳜鱼养殖及研究现状 | 第10-11页 |
| ·生长激素基因研究进展 | 第11-14页 |
| ·生长激素蛋白质结构及生理机能 | 第11-12页 |
| ·生长激素基因序列 | 第12-13页 |
| ·生长激素基因多态性研究现状 | 第13-14页 |
| ·基因多态性研究方法 | 第14-16页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第16-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-28页 |
| ·实验材料 | 第18-20页 |
| ·材料 | 第18页 |
| ·所用仪器设备 | 第18页 |
| ·主要生化试剂 | 第18-19页 |
| ·主要试剂配制 | 第19-20页 |
| ·实验方法 | 第20-28页 |
| ·基因组DNA提取与纯化 | 第20页 |
| ·引物设计 | 第20-21页 |
| ·PCR扩增 | 第21页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第21页 |
| ·PCR产物回收 | 第21页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第21-22页 |
| ·连接反应 | 第22页 |
| ·转化反应 | 第22页 |
| ·阳性菌落培养及鉴定 | 第22-23页 |
| ·测序及序列验证、提交 | 第23页 |
| ·序列比较分析 | 第23-24页 |
| ·多态性研究采用方法及引物设计 | 第24-25页 |
| ·多态性研究的PCR扩增 | 第25-26页 |
| ·SSCP分析 | 第26页 |
| ·RFLP分析 | 第26-27页 |
| ·微卫星多态性分析 | 第27页 |
| ·内含子长度多态性分析 | 第27页 |
| ·多态性研究的数据分析 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-64页 |
| ·三种鳜鱼GH基因克隆与测序结果 | 第28-30页 |
| ·基因组DNA的提取与检测结果 | 第28页 |
| ·PCR扩增与产物纯化结果 | 第28-29页 |
| ·连接、转化及阳性克隆筛选结果 | 第29-30页 |
| ·序列比较验证结果 | 第30页 |
| ·序列提交及注册结果 | 第30页 |
| ·GH基因序列分析 | 第30-47页 |
| ·三种鳜鱼GH基因序列结构 | 第30页 |
| ·GH基因核苷酸组成及序列长度比较 | 第30-32页 |
| ·GH基因DNA碱基序列及其比对结果 | 第32-42页 |
| ·GH基因mRNA序列及比较 | 第42-44页 |
| ·GH氨基酸序列及比较 | 第44-46页 |
| ·三种鳜鱼GH基因系统发育及亲缘关系分析 | 第46-47页 |
| ·三种鳜鱼GH基因多态性检测结果 | 第47-59页 |
| ·5’端侧翼区至第二外显子多态性检测结果 | 第47-49页 |
| ·第二内含子前段多态性检测结果 | 第49-50页 |
| ·第二内含子中微卫星多态性检测结果 | 第50-51页 |
| ·第三外显子及邻近区域多态性检测结果 | 第51-53页 |
| ·第三内含子多态性检测结果 | 第53-55页 |
| ·第四外显子至第五外显子多态性检测结果 | 第55-57页 |
| ·第五外显子至3’侧翼区多态性检测结果 | 第57-59页 |
| ·多态性检测结果的群体遗传学分析 | 第59-64页 |
| ·等位基因分布情况分析 | 第59-61页 |
| ·遗传多样性分析 | 第61-62页 |
| ·物种分化程度分析 | 第62页 |
| ·三种鳜鱼遗传距离及聚类分析 | 第62-64页 |
| 4 讨论与结论 | 第64-74页 |
| ·讨论 | 第64-71页 |
| ·长片段PCR扩增获得较长的完整基因DNA序列 | 第64页 |
| ·DNA大片段的T-A克隆 | 第64-65页 |
| ·菌液PCR检测 | 第65页 |
| ·内含子与外显子的不同保守性 | 第65页 |
| ·序列差异表现形式及形成 | 第65-66页 |
| ·三种鳜鱼生长激素氨基酸序列种内及种间差异 | 第66-67页 |
| ·第三内含子与第四外显子交界处序列的重复 | 第67页 |
| ·三种鳜鱼进化及亲缘关系分析 | 第67-68页 |
| ·鳜鱼基因组DNA提取的方法 | 第68-69页 |
| ·SSCP分析条件的优化 | 第69页 |
| ·RFLP分析中酶的选用 | 第69-70页 |
| ·GH基因中多态性微卫星位点的意义 | 第70页 |
| ·内含子长度差异检测在实践中的应用 | 第70页 |
| ·统计分析结果的讨论 | 第70-71页 |
| ·主要结论 | 第71-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 附录A 英文缩写词注释表 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 作者简介 | 第84页 |
