| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 1 前言 | 第12-38页 |
| ·分子标记与 SNP | 第12-21页 |
| ·分子标记 | 第12页 |
| ·分子标记的种类 | 第12-14页 |
| ·SNP 的开发技术及应用 | 第14-21页 |
| ·SNP 在遗传学中的应用 | 第21-32页 |
| ·SNP 在遗传作图与 QTL 定位中的应用 | 第21-26页 |
| ·SNP 在关联分析中的应用 | 第26-30页 |
| ·SNP 在群体遗传与进化中的应用 | 第30-32页 |
| ·单倍型的构建方法 | 第32-36页 |
| ·实验方法 | 第32页 |
| ·统计算法 | 第32-34页 |
| ·系谱推断 | 第34-35页 |
| ·基于测序和生物信息学的方法 | 第35-36页 |
| ·本实验的目的及意义 | 第36-38页 |
| ·栉孔扇贝(Chlamys farreri)概述 | 第36页 |
| ·栉孔扇贝(Chlamys farreri)养殖现状 | 第36页 |
| ·栉孔扇贝(Chlamys farreri)遗传学研究进展 | 第36-38页 |
| 2 栉孔扇贝（Chlamys farreri）cSNP 的开发 | 第38-54页 |
| ·实验材料 | 第38页 |
| ·实验方法 | 第38-45页 |
| ·栉孔扇贝基因组 DNA 的提取 | 第38-39页 |
| ·基因组 DNA 的定量 | 第39-40页 |
| ·引物和探针的设计 | 第40页 |
| ·引物产物大小的检测 | 第40-41页 |
| ·探针的检验 | 第41-43页 |
| ·SNP 位点的检测 | 第43-45页 |
| ·SNP 位点主要遗传学参数的估计 | 第45页 |
| ·实验结果 | 第45-52页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第45-46页 |
| ·产物大小的检测 | 第46页 |
| ·探针的验证 | 第46-47页 |
| ·SNP 的检测 | 第47-48页 |
| ·SNP位点主要遗传学参数的估计 | 第48-52页 |
| ·讨论 | 第52-54页 |
| ·引物的验证 | 第52页 |
| ·探针的验证 | 第52页 |
| ·SNP 的检测 | 第52-53页 |
| ·SNP 位点主要遗传学参数的估计 | 第53-54页 |
| 3 SNP 在栉孔扇贝（Chlamys farreri）单倍型构建中的应用 | 第54-63页 |
| ·实验材料 | 第54页 |
| ·实验方法 | 第54-55页 |
| ·SNP 位点的选择 | 第54页 |
| ·Block 长度的确定 | 第54-55页 |
| ·单倍型的推算 | 第55页 |
| ·两点间的 LD 分析 | 第55页 |
| ·实验结果 | 第55-60页 |
| ·Contig 顺序及位点顺序的确定 | 第55-56页 |
| ·Block 扩增产物的 PAGE 检测 | 第56-57页 |
| ·单倍型的推算 | 第57-60页 |
| ·两点间的LD分析 | 第60页 |
| ·讨论 | 第60-63页 |
| ·Contig 顺序的确定及位点顺序的确定 | 第60-61页 |
| ·Block 扩增产物的 PAGE 检测 | 第61页 |
| ·单倍型的推算 | 第61-62页 |
| ·两点间的 LD 分析 | 第62-63页 |
| 结语 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-79页 |
| 附表 | 第79-108页 |
| 个人简历 | 第108页 |
| 发表的学术论文 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109页 |
