中文摘要 | 第1-7页 |
英文摘要 | 第7-9页 |
第一部分 综述miRNA的研究进展 | 第9-32页 |
1.引言 | 第9-10页 |
2.miRNA的特征 | 第10-11页 |
3.miRNA和siRNA的区别与联系 | 第11-12页 |
4.miRNA的功能 | 第12-14页 |
5.miRNA生成与作用机制 | 第14-18页 |
·动物miRNA的生成 | 第14-15页 |
·动物miRNA的作用机制—翻译抑制 | 第15-17页 |
·植物miRNA的作用机制—切割降解 | 第17-18页 |
6.miRNA的其他研究进展 | 第18-19页 |
·miRNA与生物进化 | 第18-19页 |
·新技术探索miRNA的功能 | 第19页 |
·由病毒编码的miRNA被确认 | 第19页 |
7.研究microRNA的实验方法 | 第19-24页 |
·应用杂交方法的miRNA表达检测 | 第20-23页 |
·应用PCR方法的miRNA表达检测 | 第23-24页 |
8.研究miRNA的生物信息学方法 | 第24-27页 |
·miRNA基因预测 | 第24-25页 |
·miRNA靶基因预测 | 第25-27页 |
9.结语 | 第27-28页 |
参考文献 | 第28-32页 |
第二部分 碱基序列特征分析法预测水稻95个全新microRNA | 第32-57页 |
摘要 | 第32-33页 |
1.引言 | 第33-34页 |
2.方法 | 第34-37页 |
·数据库及数据处理 | 第34页 |
·预测miRNAs的二级结构 | 第34-35页 |
·序列特征分析 | 第35-36页 |
·保守性分析 | 第36页 |
·RT-PCR检测microRNA | 第36-37页 |
3.结果 | 第37-49页 |
·miRNA寻找策略 | 第37-39页 |
·水稻pre-miRNA的碱基使用频率 | 第39-40页 |
·水稻中三联碱基与四联碱基的"相对熵" | 第40-44页 |
·确定miRNAs及其前体 | 第44-46页 |
·寻找结果中的已知miRNAs与新的miRNA | 第46-48页 |
·miRNAs的靶目标分析 | 第48页 |
·realtimePCR结果 | 第48-49页 |
4.讨论 | 第49-52页 |
·本预测方法的评价 | 第49-50页 |
·miRNAs的保守性 | 第50页 |
·与其他研究的比较 | 第50-51页 |
·在人类基因组中用非保守性方法寻找miRNA | 第51页 |
·结论 | 第51-52页 |
参考文献 | 第52-57页 |
第三部分 一种简单高效的土壤微生物RNA提取方法 | 第57-66页 |
摘要 | 第57页 |
引言 | 第57-58页 |
1.材料和方法 | 第58-60页 |
·材料 | 第58页 |
·试剂及用具处理 | 第58页 |
·RNA提取方法 | 第58-59页 |
·RNA分析 | 第59-60页 |
2.结果与分析 | 第60-62页 |
·RNA完整性分析 | 第60-61页 |
·RNA纯度和产量 | 第61-62页 |
·RT-PCR检测结果 | 第62页 |
3.讨论 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-66页 |
结论 | 第66-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
在读期间发表论文情况 | 第68-70页 |
附1 预测到的miRNA,osa-MlR表示其相对应的已知水稻中的miRNA | 第70-92页 |
附2 成熟miRNA及其对应的靶目标,大写表示为已知的成熟miRNA | 第92-98页 |
附3 预测到miRNA及其靶基因功能 | 第98页 |