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95条新的水稻microRNA的计算机鉴定

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-9页
第一部分 综述miRNA的研究进展第9-32页
 1.引言第9-10页
 2.miRNA的特征第10-11页
 3.miRNA和siRNA的区别与联系第11-12页
 4.miRNA的功能第12-14页
 5.miRNA生成与作用机制第14-18页
     ·动物miRNA的生成第14-15页
     ·动物miRNA的作用机制—翻译抑制第15-17页
     ·植物miRNA的作用机制—切割降解第17-18页
 6.miRNA的其他研究进展第18-19页
     ·miRNA与生物进化第18-19页
     ·新技术探索miRNA的功能第19页
     ·由病毒编码的miRNA被确认第19页
 7.研究microRNA的实验方法第19-24页
     ·应用杂交方法的miRNA表达检测第20-23页
     ·应用PCR方法的miRNA表达检测第23-24页
 8.研究miRNA的生物信息学方法第24-27页
     ·miRNA基因预测第24-25页
     ·miRNA靶基因预测第25-27页
 9.结语第27-28页
 参考文献第28-32页
第二部分 碱基序列特征分析法预测水稻95个全新microRNA第32-57页
 摘要第32-33页
 1.引言第33-34页
 2.方法第34-37页
     ·数据库及数据处理第34页
     ·预测miRNAs的二级结构第34-35页
     ·序列特征分析第35-36页
     ·保守性分析第36页
     ·RT-PCR检测microRNA第36-37页
 3.结果第37-49页
     ·miRNA寻找策略第37-39页
     ·水稻pre-miRNA的碱基使用频率第39-40页
     ·水稻中三联碱基与四联碱基的"相对熵"第40-44页
     ·确定miRNAs及其前体第44-46页
     ·寻找结果中的已知miRNAs与新的miRNA第46-48页
     ·miRNAs的靶目标分析第48页
     ·realtimePCR结果第48-49页
 4.讨论第49-52页
     ·本预测方法的评价第49-50页
     ·miRNAs的保守性第50页
     ·与其他研究的比较第50-51页
     ·在人类基因组中用非保守性方法寻找miRNA第51页
     ·结论第51-52页
 参考文献第52-57页
第三部分 一种简单高效的土壤微生物RNA提取方法第57-66页
 摘要第57页
 引言第57-58页
 1.材料和方法第58-60页
     ·材料第58页
     ·试剂及用具处理第58页
     ·RNA提取方法第58-59页
     ·RNA分析第59-60页
 2.结果与分析第60-62页
     ·RNA完整性分析第60-61页
     ·RNA纯度和产量第61-62页
     ·RT-PCR检测结果第62页
 3.讨论第62-63页
 参考文献第63-66页
结论第66-67页
致谢第67-68页
在读期间发表论文情况第68-70页
附1 预测到的miRNA,osa-MlR表示其相对应的已知水稻中的miRNA第70-92页
附2 成熟miRNA及其对应的靶目标,大写表示为已知的成熟miRNA第92-98页
附3 预测到miRNA及其靶基因功能第98页

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