摘要 | 第1-3页 |
ABSTRACT | 第3-7页 |
第一章 文献综述 | 第7-29页 |
·研究背景 | 第7-8页 |
·青蒿素的结构和性质 | 第8页 |
·青蒿素的衍生物及类似物 | 第8-14页 |
·青蒿素衍生物 | 第8-12页 |
·醚类青蒿素衍生物 | 第9页 |
·羧酸酯、碳酸酯类青蒿素衍生物 | 第9-10页 |
·芳胺类青蒿素衍生物 | 第10-11页 |
·C-16 取代的青蒿素衍生物 | 第11页 |
·C-10 修饰的三环1,2,4-三噁烷 | 第11-12页 |
·青蒿素类似物—螺金刚烷臭氧化物(1,2,4- trioxolanes) | 第12-14页 |
·青蒿素类药物抗疟机制 | 第14-16页 |
·二价铁离子依赖的抗疟作用 | 第14-15页 |
·青蒿素类似物与受体PfATP6 结合增加钙离子水平的抗疟机制 | 第15-16页 |
·影响疟原虫组氨酸蛋白的抗疟机制 | 第16页 |
·计算机辅助药物分子设计 | 第16-26页 |
·药物发现的途径与过程 | 第16-18页 |
·计算机辅助药物设计的策略及方法 | 第18-22页 |
·基于配体的药物设计方法 | 第19页 |
·基于受体的药物设计方法 | 第19-20页 |
·与组合化学相结合的药物设计方法 | 第20-22页 |
·计算机辅助药物设计所涉及到的相关技术 | 第22-26页 |
·分子动力学 | 第22页 |
·分子对接方法 | 第22-25页 |
·CoMFA 定量构效关系方法 | 第25-26页 |
·青蒿素CADD 研究现状 | 第26-27页 |
·本课题研究内容及选题意义 | 第27-29页 |
第二章 青蒿素衍生物三维定量结构—活性关系研究 | 第29-57页 |
·实验材料 | 第29-31页 |
·计算平台 | 第31-32页 |
·硬件平台 | 第31-32页 |
·软件平台-Syby16.92 | 第32页 |
·CoMFA QSAR 的实验建立过程 | 第32-40页 |
·受体蛋白PfATP6 的序列采集与结构模建 | 第34页 |
·青蒿素衍生物生物活性数据的采集 | 第34页 |
·衍生物分子构型的优化 | 第34-36页 |
·初始构象的获得 | 第34-35页 |
·全局构象搜索 | 第35-36页 |
·活性构象的确定与分子的叠合 | 第36-40页 |
·基于公共骨架的叠合 | 第36-37页 |
·基于对接的叠合 | 第37-40页 |
·CoMFA QSAR 的建立和PLS 数理统计 | 第40页 |
·CoMFA QSAR 的实验结果 | 第40-56页 |
·受体蛋白PfATP6 的序列采集与结构模建的结果 | 第40页 |
·青蒿素衍生物生物活性数据 | 第40-41页 |
·青蒿素衍生物分子构型的优化结果 | 第41-42页 |
·活性构象和分子叠合的结果与分析 | 第42-45页 |
·基于公共骨架的叠合 | 第42页 |
·基于对接的叠合 | 第42-44页 |
·两种叠合的比较 | 第44-45页 |
·CoMFA QSAR 的建立和PLS 数理统计 | 第45-56页 |
·初始CoMFA 模型参数的选取 | 第45-47页 |
·Energy Cutoff 值对CoMFA 结果的影响 | 第47-48页 |
·电荷定义方式对CoMFA 结果的影响 | 第48-49页 |
·空间网格间距对CoMFA 结果的影响 | 第49-51页 |
·最佳CoMFA 模型的建立 | 第51-56页 |
·小结 | 第56-57页 |
第三章 螺金刚烷臭氧化物的三维定量结构—活性关系研究 | 第57-70页 |
·实验材料 | 第57-59页 |
·计算平台 | 第59-60页 |
·硬件平台 | 第59页 |
·软件平台-Syby16.92 | 第59-60页 |
·CoMFA QSAR 的实验建立过程 | 第60-64页 |
·受体蛋白PfATP6 的结构采集 | 第60页 |
·1,2,4-trioxolane 类似物分子生物活性数据的采集 | 第60-61页 |
·类似物分子构型的优化 | 第61-62页 |
·活性构象的确定 | 第62-64页 |
·对接分析 | 第62-63页 |
·打分函数的确定 | 第63-64页 |
·Database Align 叠合 | 第64页 |
·CoMFA QSAR 的建立和PLS 数理统计 | 第64页 |
·CoMFA QSAR 的实验结果与讨论 | 第64-69页 |
·受体蛋白PfATP6 的结构采集 | 第64页 |
·1,2,4-trioxolane 类似物分子生物活性数据 | 第64-65页 |
·1,2,4-trioxolane 类似物分子构象的优化结果 | 第65页 |
·活性构象和分子叠合的结果与分析 | 第65-66页 |
·CoMFA QSAR 的建立和PLS 数理统计 | 第66-69页 |
·初始CoMFA 模型参数的选取 | 第66-67页 |
·搜索最佳的Energy Cutoff 值 | 第67-69页 |
·小结 | 第69-70页 |
第四章 结论 | 第70-71页 |
参考文献 | 第71-76页 |
发表论文和科研情况说明 | 第76-77页 |
附录 | 第77-81页 |
致谢 | 第81页 |