Dedication | 第1-5页 |
Acknowledgements | 第5-7页 |
Certification | 第7-8页 |
Source of projects | 第8-9页 |
Table of contents | 第9-13页 |
Abstract | 第13-17页 |
Abstract(Chinese) | 第17-20页 |
Introduction | 第20-23页 |
Part Ⅰ Literature review | 第23-57页 |
Chapter Ⅰ Vibrio parahaemolyticus as a foodborne pathogen | 第24-40页 |
·Biological and pathogenic features | 第25-27页 |
·General characteristics of Vibrio parahaemolyticus | 第25页 |
·Antigenic structures | 第25-26页 |
·Major virulence factors | 第26-27页 |
·Distribution | 第27-28页 |
·In marine environments | 第27-28页 |
·In seafoods | 第28页 |
·Detection of Vibrio parahaemolyticus | 第28-32页 |
·Conventional method | 第28-30页 |
·Polymerase chain reaction(PCR) | 第30-31页 |
·DNA hybridization | 第31-32页 |
·Incidence of foodborne Vibrio parahaemolyticus infections | 第32-34页 |
·Incidence in Asia | 第32页 |
·In cidence in the United States | 第32-33页 |
·Incidence in European and African countries | 第33-34页 |
·Emerging of new pandemic clone of Vibrio parahaemolyticus | 第34页 |
·Conclusion | 第34页 |
References | 第34-40页 |
Chapter Ⅱ Genome structures and molecular typing of Vibrio parahaemolyticus | 第40-57页 |
·Genome structures of Vibrio parahaemolyticus | 第40-47页 |
·Major virulence genes | 第42-45页 |
·Virulence associated genes | 第45-47页 |
·Molecular typing of Vibrio parahaemolyticus | 第47-51页 |
·Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) | 第47-49页 |
·Restriction fragment 1 ength polymorphism (RFLP) | 第49页 |
·Ribotyping) | 第49-50页 |
·Random amplified polymorphism DNA (RAPD)-PCR | 第50-51页 |
·Enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC)-PCR | 第51页 |
·Multi locus sequence typing (MLST) | 第51页 |
·Conclusion | 第51-52页 |
References | 第52-57页 |
Part Ⅱ Experimental section | 第57-129页 |
Chapter Ⅲ Prevalence of Vibrio parahaemolyticus in seafoods in Zhejiang province | 第58-68页 |
Abstract | 第58页 |
·Introduction | 第58-59页 |
·Materials | 第59页 |
·Bacterial strains | 第59页 |
·Culture medium and reagents | 第59页 |
·Methods | 第59-63页 |
·Collection and transportation of samples | 第59-61页 |
·Preliminary identification of Vibrio parahaemolyticus | 第61页 |
·Identification of Vibrio parahaemolyticus by duplex PCR | 第61-63页 |
·Results | 第63-65页 |
·Discussion | 第65-66页 |
References | 第66-68页 |
Chapter Ⅳ Molecular typing of Vibrio parahaemolyticus isolates from clinical and seafood by pulse-fieldgelelectrophoresis | 第68-80页 |
Abstract | 第68页 |
·Introduction | 第68-69页 |
·Materials | 第69-71页 |
·Bacterial strains and culture condition | 第69页 |
·Reagents | 第69-71页 |
·Instruments | 第71页 |
·Methods | 第71-75页 |
·Preparation of DNA into agarose | 第71-72页 |
·Genomic DNA extraction | 第72-73页 |
·Separation of DNA fragments | 第73-75页 |
·Results | 第75-76页 |
·Discussion | 第76-78页 |
References | 第78-80页 |
Chapter Ⅴ Occurrence of pandemic clones of Vibrio parahaemolyticus isolates | 第80-96页 |
Abstract | 第80页 |
·Introduction | 第80-81页 |
·Materials | 第81-83页 |
·Bacterial strains and culture condition | 第81-82页 |
·Culture medium and reagents | 第82-83页 |
·Methods | 第83-85页 |
·Determination of Kanagawa phenomenon | 第83页 |
·Determination of urease production | 第83-84页 |
·Detection of tdh and trh genes | 第84页 |
·Detection of virulence associated genes | 第84-85页 |
·DNA sequencing of partial toxRS gene fragments | 第85页 |
·Serotyping | 第85页 |
·Results | 第85-90页 |
·Kanagawa phenomenon phenotype | 第85-86页 |
·Urease production | 第86-87页 |
·Prevalence of virulence and virulence associated genes | 第87页 |
·Nucleotide sequence analysis | 第87-90页 |
·Serotypes | 第90页 |
·Discussion | 第90-93页 |
References | 第93-96页 |
Chapter Ⅵ Comparison of pathogenicity of selected Vibrio parahaemolyticus isolates | 第96-113页 |
Abstract | 第96页 |
·Introduction | 第96-97页 |
·Materials | 第97-98页 |
·Bacterial strains and culture condition | 第97-98页 |
·Reagents | 第98页 |
·Animals and cell lines | 第98页 |
·Methods | 第98-102页 |
·Enteropathogenicity assay | 第98-99页 |
·Virulence to mice | 第99-100页 |
·Adhesion assay | 第100-101页 |
·Cytotoxicity assay | 第101-102页 |
·Statistical analysis | 第102页 |
·Results | 第102-108页 |
·Enteropathogenicity in suckling mice | 第102-104页 |
·Virulence to mice | 第104-105页 |
·Adherence to HeLa and Caco-2 cells | 第105-106页 |
·Cytotoxic activity in HeLa cells | 第106-108页 |
·Discussion | 第108-109页 |
References | 第109-113页 |
Chapter Ⅷ Genetic characterization of tdh-adjacent loci in tdh-positive Vibrio parahaemolyticus isolates from seafoods | 第113-129页 |
Abstract | 第113页 |
·Introduction | 第113-114页 |
·Materials | 第114-115页 |
·Bacterial strains and culture condition | 第114-115页 |
·Reagents | 第115页 |
·Methods | 第115-120页 |
·Preparation of genomic DNA | 第115-117页 |
·Detection of full-lengh tdh gene and tdh-adjacent loci | 第117页 |
·DNA sequencing of full-lengh tdh gene | 第117页 |
·DNA sequencing of tdh-adjacent loci | 第117-118页 |
·Amplification of 5'and 3'end regions of tdh gene | 第118-120页 |
·Results | 第120-125页 |
·Distribution of different agments in tdh-adjacent locus | 第120-121页 |
·Full-lengh tdh sequence analysis | 第121-123页 |
·Sequence analysis of tdh-adjacent locus | 第123-125页 |
·Discussion | 第125-127页 |
Refernces | 第127-129页 |
Conclusions and perspectives | 第129-130页 |
攻读博士期间的发表-已投稿或者撰稿的学术论文 | 第130页 |