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人泛素类相关修饰蛋白质SUMO-3 C47S的溶液结构测定及其与SUMO化路径中的缀合酶Ubc9的相互作用研究

目录第1-7页
中文摘要第7-9页
英文摘要第9-11页
第一章 综述:SUMO化修饰及其生物学功能第11-42页
 1.蛋白质的翻译后修饰第12-13页
 2.SUMO是一类泛素家族的修饰蛋白质第13-17页
 3.SUMO化修饰第17-25页
     ·SUMO化修饰的生化反应过程及酶第18-20页
     ·SUMO化中底物的选择机制第20-23页
     ·对SUMO化修饰的调控第23-24页
     ·SUMO化与泛素化过程的异同之处第24-25页
 4.SUMO化的生物学功能第25-34页
     ·调节蛋白质的核质运输第25-26页
     ·调节蛋白质在细胞内的定位第26-28页
     ·转录活性调控第28-29页
     ·拮抗泛素化第29-30页
     ·细胞周期调控第30-31页
     ·维持基因组完整性第31-33页
     ·信号转导调控第33-34页
 5.SUMO化修饰对靶蛋白的调控机理第34-35页
     ·与泛素化竞争以提高蛋白质稳定性第34页
     ·调节蛋白质—蛋白质相互作用第34页
     ·改变靶蛋白构象从而改变其功能第34-35页
 6.总结第35-36页
 参考文献第36-42页
第二章 SUMO-3 C47S的溶液结构测定及其与SUMO化路径中的缀合酶Ubc9的相互作用研究第42-98页
 第一部分:引言第42-44页
 第二部分:材料和方法第44-64页
  1.人SUMO-3 C47S蛋白基因的克隆第44-47页
     ·目标基因的选取与获得第44-45页
     ·PCR产物连入pMD 18-T载体进行目的片段的扩增第45页
     ·载体pET-22b(+)的中量制备第45-46页
     ·pET-22b(+)与pMD 18-T重组质粒的酶切,回收及pET-22b(+)与目标基因的连接第46页
     ·将47位的Cys突变成Ser第46-47页
  2.人SUMO-3 C47S蛋白质的表达与纯化第47-48页
  3.人SUMO-3 C47S蛋白质的稳定性研究第48页
  4.人Ubc9蛋白质的表达与纯化第48-49页
  5.蛋白质浓度的测定第49-50页
  6.NMR波谱解析人SUMO-3 C47S蛋白质的三维溶液空间结构第50-60页
     ·~(15)N-标记和~(15)N,~(13)C双标记SUMO-3 C47S蛋白质的生产第50页
     ·NMR实验与数据变换第50-54页
     ·主链顺序认证及侧链化学位移的获得第54-57页
     ·二级结构的确定第57页
     ·三维结构计算第57-60页
  7.化学位移干扰实验第60页
  8.人SUMO-3 C47S与Ubc9相互作用时的复合物结构计算第60-64页
     ·AIRs的定义第61-62页
     ·HADDOCK计算第62-63页
     ·数据分析第63-64页
 第三部分:结果和讨论第64-95页
  1.人SUMO-3 C47S蛋白基因的克隆第64页
  2.人SUMO-3 C47S蛋白质的表达和纯化第64-66页
  3.人SUMO-3 C47S蛋白质的稳定性研究第66-67页
  4.人Ubc9蛋白质的表达与纯化第67-68页
  5.NMR波谱解析人SUMO-3 C47S蛋白质的三维溶液结构第68-81页
     ·SUMO-3 C47S化学位移的认证和二级结构预测第68-74页
     ·SUMO-3 C47S结构计算第74-77页
     ·SUMO-3 C47S的溶液结构第77-78页
     ·SUMO-3 C47S与同源蛋白的序列和结构比较第78-81页
  6.SUMO-3 C47S的化学位移干扰实验第81-83页
  7.SUMO-3 C47S同Ubc9的相互作用表面第83-85页
  8.SUMO-3 C47S同Ubc9的复合物模型第85-90页
  9.复合物结构同自由态结构的比较第90-92页
  10.SUMO-E2相互作用时的蛋白质定向机制第92-93页
  11.总结第93-95页
 参考文献第95-98页
致谢第98-99页
发表论文第99页
学术会议第99-131页

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