| 1.引言 | 第1-17页 |
| ·前言 | 第10页 |
| ·肉类质量的遗传分析 | 第10-11页 |
| ·钙激活蛋白酶系 | 第11-13页 |
| ·钙激活蛋白酶系概述 | 第11页 |
| ·钙激活蛋白酶系的主要成员及特性 | 第11页 |
| ·Calpain家族的在动物组织中的分布 | 第11-12页 |
| ·钙激活蛋白酶对肌肉的嫩化机理 | 第12页 |
| ·牛Calpainl基因的研究现状 | 第12-13页 |
| ·单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNP)技术的发展 | 第13-15页 |
| ·SNPs定义 | 第13页 |
| ·SNP检测方法 | 第13-14页 |
| ·基于生物信息学的SNPs的筛查检测方法 | 第14-15页 |
| ·本研究的主要内容 | 第15-17页 |
| ·牛的CAPN1基因SNPs的筛查 | 第15页 |
| ·牛CAPN1基因各位点的群体遗传学分析、连锁不平衡分析和单体型分析 | 第15-16页 |
| ·牛CAPN1基因的各位点与肉质性状的相关性分析 | 第16-17页 |
| 2.材料与方法 | 第17-30页 |
| ·试验材料 | 第17-20页 |
| ·实验牛来源及采样方法 | 第17页 |
| ·实验牛肉样的采集 | 第17-18页 |
| ·主要仪器设备 | 第18页 |
| ·工具酶及主要试剂 | 第18-19页 |
| ·主要药品及试剂的配制 | 第19-20页 |
| ·主要分析工具软件 | 第20页 |
| ·实验方法 | 第20-26页 |
| ·实验牛血液DNA的提取和检测 | 第20-21页 |
| ·CAPN1基因候选SNP位点的确定 | 第21页 |
| ·PCR反应 | 第21-23页 |
| ·PCR-RFLP限制性内切酶消化 | 第23-25页 |
| ·PCR-RFLP基因型的回收测序 | 第25-26页 |
| ·牛肉大理石纹的评定 | 第26页 |
| ·牛肉嫩度的测定 | 第26页 |
| ·牛肉肉色的测定 | 第26页 |
| ·牛肉酸度的测定 | 第26页 |
| ·统计分析 | 第26-30页 |
| 3.结果与分析 | 第30-61页 |
| ·牛基因组DNA样品的提取结果 | 第30页 |
| ·CAPN1基因的突变位置及类型 | 第30-31页 |
| ·CAPN1基因的序列分析及试验验证 | 第31-41页 |
| ·CAPN1基因A3717G位点的序列分析及其实验验证 | 第31-32页 |
| ·CAPN1基因A3854G位点的序列分析及实验验证 | 第32-34页 |
| ·CAPN1基因C4789T位点的序列分析及实验验证 | 第34-36页 |
| ·CAPN1基因A5688G位点的序列分析及实验验证 | 第36-37页 |
| ·CAPN1基因C5709G位点的序列分析及实验验证 | 第37-39页 |
| ·CAPN1基因A6270G位点的序列分析及实验验证 | 第39-41页 |
| ·不同位点的群体遗传学分析 | 第41-51页 |
| ·CAPN1基因A3717G位点的群体遗传学分析 | 第41-42页 |
| ·CAPN1基因A3854G位点的群体遗传学分析 | 第42-43页 |
| ·CAPN1基因C4789T位点的群体遗传学分析 | 第43-44页 |
| ·CAPN1基因A5688G位点的群体遗传学分析 | 第44-45页 |
| ·CAPN1基因C5709G位点的群体遗传学分析 | 第45-46页 |
| ·CAPN1基因A6270G位点的群体遗传学分析 | 第46-48页 |
| ·CAPN1基因各位点的不同品种基因型差异分析 | 第48-51页 |
| ·CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第51-56页 |
| ·安格斯杂种牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第51页 |
| ·晋南牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第51-52页 |
| ·利木赞杂种牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第52页 |
| ·鲁西牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第52-53页 |
| ·秦川牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第53页 |
| ·大厂西杂牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第53-54页 |
| ·夏洛来杂种牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第54-55页 |
| ·通辽西杂牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第55页 |
| ·安格斯牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第55-56页 |
| ·海福特牛的CAPN1基因各位点的连锁不平衡分析 | 第56页 |
| ·CAPN1基因的单体型分析 | 第56-57页 |
| ·牛CAPN1基因各位点对牛肉质性状的影响 | 第57-61页 |
| 4.讨论 | 第61-66页 |
| ·DNA的提取 | 第61页 |
| ·基于生物信息学的SNIPs的筛查方法 | 第61-62页 |
| ·PCR的扩增 | 第62页 |
| ·CAPN1基因各位点遗传学特征 | 第62-63页 |
| ·CAPN1基因的连锁不平衡分析和单体型分析 | 第63-64页 |
| ·牛CAPN1基因各位点对牛肉质性状的影响 | 第64-65页 |
| ·品种和年龄因素对牛肉质性状的影响 | 第65-66页 |
| 5.结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 在读期间发表的论文 | 第71-72页 |
| 附录 | 第72-77页 |
| 作者简历 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
