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水稻光敏雄性核不育基因pms3的精细定位

中文摘要第1-7页
Abstract第7-9页
1 文献综述第9-23页
   ·植物基因组研究第9-16页
     ·作图群体与遗传图谱第10-12页
     ·大片段基因组文库与物理图谱第12-14页
     ·模式生物基因组测序概况第14-15页
     ·功能基因组与生物信息学第15-16页
   ·植物雄性不育研究第16-18页
   ·水稻光温敏雄性不育研究进展第18-21页
     ·代表性光、温敏雄性不育水稻材料的发现及光、温作用模式研究第18-19页
     ·光、温敏雄性不育水稻的育性转换与生理生化特性第19-20页
     ·光、温敏雄性不育基因的等位性研究与定位第20-21页
   ·未知产物的植物基因克隆方法第21-23页
     ·转座子与T-DNA标签法第21-22页
     ·图位克隆法第22-23页
2 本研究的意义与目标第23-25页
3 材料和方法第25-33页
   ·材料第25-26页
     ·定位群体第25页
     ·BAC文库第25-26页
     ·遗传转化系统第26页
   ·方法第26-33页
     ·水稻总DNA的抽提第26-27页
     ·DNA浓度测定、酶切转膜、探针制备及Southern杂交第27-28页
     ·分子标记与pms3基因间距离的计算第28页
     ·BAC文库的构建第28-31页
       ·pBeloBAC11载体制备第28-30页
       ·水稻品种农垦58大片段基因组DNA的制备第30页
       ·载体与外源DNA最佳连接体系的摸索第30页
       ·文库质量评估第30-31页
     ·BAC克隆之间重叠关系的确定方法第31页
     ·BAC克隆的“鸟枪法”(shotgun)测序第31-32页
     ·携带候选基因的DNA片段生物信息学分析第32-33页
4 结果与分析第33-57页
   ·极端不育重组单株的获得第33页
   ·携带pms3基因的BAC重叠群的确定第33-35页
   ·BAC克隆71J16的序列测定第35-36页
   ·目标基因区段范围的进一步缩小第36页
   ·农垦58基因组BAC文库的构建与筛选第36-40页
     ·农垦58基因组BAC文库插入片段检测第37-38页
     ·基因组覆盖率估算第38页
     ·农垦58基因组BAC文库的筛选第38-40页
   ·日本晴BAC 71J16、农垦58 BAC 10K14的shotgun随机文库构建与部分克隆的测序第40-43页
   ·28.4 kb DNA片段基因预测与同源性BLAST第43-45页
   ·28.4 kb DNA片段的比较测序及序列分析第45-49页
   ·基于突变位点的分子标记的发展第49-50页
   ·M36-C751区间重组事件频率分析第50-53页
   ·pms3候选基因的载体构建与遗传转化第53-57页
     ·正义转化载体构建第53-54页
     ·RNAi抑制载体构建第54页
     ·启动子的载体构建与表达第54-57页
5 讨论第57-63页
   ·本研究结果对基因克隆及育种的贡献第57页
   ·本研究中遇到的问题与困难第57-58页
   ·BAC文库构建中的一些体会第58-60页
     ·联合多种酶切构建基因组文库第58-59页
     ·高质量载体的制备与保存第59-60页
     ·大片段基因组文库构建在水稻基因研究中的应用前景第60页
   ·公共数据库信息对本研究的帮助第60-61页
   ·关于pms3基因候选基因作用模式的一些思考第61-63页
参考文献第63-80页
附录Ⅰ 试剂配方与实验方法第80-85页
附录Ⅱ 个人简历第85-86页
致谢第86页

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