| 第一章 导论 | 第1-36页 |
| 第一节 土壤微生物和氮循环微生物的多样性 | 第14-19页 |
| 1 土壤微生物的多样性及其重要性 | 第14-15页 |
| 2 土壤微生物的固氮作用及固氮微生物的多样性 | 第15-16页 |
| 3 土壤微生物的反硝化作用及反硝化细菌的多样性 | 第16-18页 |
| 4 土壤微生物的硝化作用及其硝化细菌的多样性 | 第18页 |
| 5 土壤微生物的氨化作用及氨化细菌的多样性 | 第18-19页 |
| 第二节 环境变化对土壤微生物的影响 | 第19-23页 |
| 1 大气CO_2浓度升高对土壤微生物的影响 | 第19-20页 |
| 2 植被变化对土壤微生物的影响 | 第20-21页 |
| 3 环境污染对土壤微生物的影响 | 第21-23页 |
| 第三节 土壤微生物多样性的研究方法 | 第23-29页 |
| 1 土壤微生物多样性的表示方法 | 第23-24页 |
| 2 传统的微生物培养法 | 第24页 |
| 3 PLFA分析法 | 第24-25页 |
| 4 BIOLOG微量分析法 | 第25-26页 |
| 5 核酸杂交分析技术 | 第26页 |
| 6 基于PCR的分子生物学方法 | 第26-28页 |
| 6．1 PCR-RFLP分析方法 | 第26-27页 |
| 6．2 PCR-RAPD分析方法 | 第27页 |
| 6．3 PCR-SSCP分析方法 | 第27页 |
| 6．4 PCR-DGGE分析方法 | 第27-28页 |
| 7 基因芯片技术 | 第28-29页 |
| 第四节 环境微生物分子生态学的研究进展 | 第29-34页 |
| 1 环境微生物DNA的获得 | 第29-30页 |
| 2 环境微生物物种多样性的研究 | 第30页 |
| 3 环境微生物种群结构和动力学的研究 | 第30-31页 |
| 4 环境微生物代谢活性的研究 | 第31-32页 |
| 5 前景展望 | 第32-34页 |
| 第五节 本研究的立题背景和技术路线 | 第34-36页 |
| 1 本研究的立题背景和研究意义 | 第34-35页 |
| 2 本研究的主要内容和技术路线 | 第35-36页 |
| 第二章 可用于分子生态学研究的土壤微生物DNA提取方法 | 第36-44页 |
| 1 前言 | 第36-37页 |
| 2 材料和方法 | 第37-40页 |
| 2．1 土壤的采集 | 第37页 |
| 2．2 主要试剂 | 第37页 |
| 2．3 主要仪器 | 第37-38页 |
| 2．4 DNA的提取方法 | 第38-39页 |
| 2．5 DNA的纯化 | 第39页 |
| 2．6 DNA的纯度和定量检测 | 第39页 |
| 2．7 DNA的PCR检测 | 第39-40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-43页 |
| 3．1 DNA的提取 | 第40-41页 |
| 3．2 DNA的纯化效果 | 第41-42页 |
| 3．3 PCR扩增结果 | 第42-43页 |
| 4 讨论 | 第43页 |
| 5 结论 | 第43-44页 |
| 第三章 三江源地区土壤固氮微生物的分子多样性研究 | 第44-62页 |
| 1 前言 | 第44-45页 |
| 2 材料和方法 | 第45-51页 |
| 2．1 材料 | 第45-46页 |
| 2．1．1 土壤样品的采集 | 第45页 |
| 2．1．2 主要试剂和仪器 | 第45-46页 |
| 2．2 样品化学性状的测定 | 第46页 |
| 2 . 3 DNA的提取和纯化 | 第46页 |
| 2．4 固氮基因(nifH)的PCR扩增 | 第46-48页 |
| 2．5 扩增产物的克隆和RFLP分析 | 第48-51页 |
| 2．5．1 扩增产物的回收 | 第48页 |
| 2．5．2 nifH片断的克隆 | 第48-49页 |
| 2．5．3 阳性克隆的鉴定 | 第49页 |
| 2．5．4 PCR扩增产物的纯化 | 第49-50页 |
| 2．5．5 限制性酶切 | 第50页 |
| 2．5．6 8％非变性聚丙烯酰氨凝胶电泳 | 第50页 |
| 2．5．7 银染 | 第50-51页 |
| 2．5．8 数据统计 | 第51页 |
| 2．6 基因测序和系统发育分析 | 第51页 |
| 2．7 统计分析方法 | 第51页 |
| 2．8 核苷酸序列登录 | 第51页 |
| 3 结果与分析 | 第51-59页 |
| 3．1 主要植被物种 | 第51-52页 |
| 3．2 土壤的生物地理化学性状 | 第52-53页 |
| 3．3 nifH的克隆和RFLP分析 | 第53-55页 |
| 3．4 nifH基因的测序和系统发育分析 | 第55-59页 |
| 4 讨论 | 第59-62页 |
| 4．1 固氮微生物的多样性 | 第59-60页 |
| 4．2 生物地理化学性状与固氮微生物多样性的关系 | 第60页 |
| 4．3 植被类型对固氮微生物群落结构和多样性的影响 | 第60页 |
| 4．4 海拔高度对固氮微生物群落结构和多样性的影响 | 第60-61页 |
| 4．5 其它环境因子对固氮微生物群落结构和多样性的影响 | 第61-62页 |
| 第四章 三江源地区高寒草甸土反硝化细菌的分子多样性研究 | 第62-77页 |
| 1 前言 | 第62-63页 |
| 2 材料和方法 | 第63-67页 |
| 2．1 材料 | 第63-64页 |
| 2．1．1 样地概况及样品的采集 | 第63页 |
| 2．1．2 主要试剂和仪器 | 第63-64页 |
| 2．2 样品化学性状的测定 | 第64页 |
| 2．3 DNA的提取和纯化 | 第64-65页 |
| 2．4 nirK和nosZ基因的扩增 | 第65-66页 |
| 2．5 克隆和RFLP分析 | 第66-67页 |
| 2．6 测序和系统发育分析 | 第67页 |
| 2．7 统计分析方法 | 第67页 |
| 2．8 核苷酸序列登录号 | 第67页 |
| 3 结果与分析 | 第67-75页 |
| 3．1 土壤的生物地理化学性状 | 第67-68页 |
| 3．2 nirK和nosZ的克隆和RFLP分析 | 第68-71页 |
| 3．3 nirK和nosZ基因的测序结果和系统发育分析 | 第71-75页 |
| 4 讨论 | 第75-77页 |
| 第五章 三江源地区植被变化对土壤微生物数量和多样性的影响 | 第77-88页 |
| 1 前言 | 第77-78页 |
| 2 材料和方法 | 第78-80页 |
| 2．1 材料 | 第78-79页 |
| 2．1．1 样品概况及样品的采集 | 第78页 |
| 2．1．2 主要试剂和仪器 | 第78-79页 |
| 2．2 样品化学性状的测定 | 第79页 |
| 2．3 土壤微生物的测定 | 第79页 |
| 2．4 土壤DNA的提取和纯化 | 第79页 |
| 2．5 16S rDNA的扩增 | 第79页 |
| 2．6 克隆和RFLP分析 | 第79页 |
| 2．7 测序和系统发育分析 | 第79-80页 |
| 2．8 核苷酸序列登录号 | 第80页 |
| 3 结果与分析 | 第80-86页 |
| 3．1 不同样地培养微生物数量分布 | 第80-81页 |
| 3．2 RFLP分析 | 第81-82页 |
| 3．3 测序和系统发育分析 | 第82-86页 |
| 4 讨论 | 第86-88页 |
| 4．1 植被变化对土壤微生物数量的影响 | 第86页 |
| 4．2 植被变化对土壤微生物多样性的影响 | 第86-88页 |
| 第六章 主要结论和创新之处 | 第88-90页 |
| 1 主要结论 | 第88-89页 |
| 2 创新之处 | 第89页 |
| 3 下一步工作设想 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-106页 |
| 附录1 nifH克隆文库核苷酸序列在GenBank中的登录号 | 第106-107页 |
| 附录2 nirK克隆文库核苷酸序列在GenBank中的登录号 | 第107-108页 |
| 附录3 nosZ克隆文库核苷酸序列在GenBank中的登录号 | 第108-109页 |
| 附录4 16S rDNA克隆文库核苷酸序列在GenBank中的登录号 | 第109-110页 |
| 附录5 部分克隆文库测序结果图谱 | 第110-113页 |
| 附录6 三江源国家自然保护区位置图 | 第113-114页 |
| 附录7 三江源国家自然保护区植被分布图 | 第114-115页 |
| 附录8 部分培养基和试剂的配制 | 第115-117页 |
| 论文缩略词表 | 第117-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 作者简历 | 第119-120页 |
