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珊瑚藻R-藻红蛋白的分子生物学

摘要(中文)第1-8页
摘要(英文)第8-9页
1 藻虹蛋白的研究背景与现状第9-21页
   ·藻红蛋白的基本性质第10-15页
     ·藻红蛋白的分类与命名第10页
     ·藻红蛋白的分子组成及其结构功能第10-13页
     ·藻红蛋白理化特性第13-15页
   ·藻类的光合捕光色素系统及藻红蛋白在其中的作用第15-17页
   ·藻红蛋白的分子生物学第17-19页
     ·藻红蛋白的脱辅基蛋白基因第17页
     ·藻红蛋白的脱辅基蛋白基因结构第17-18页
     ·藻红蛋白的脱辅基蛋白基因序列特征第18-19页
   ·存在的问题及本项目研究的目的和意义第19-21页
2 材料第21-23页
   ·供试菌种与载体第21页
   ·引物第21-22页
   ·试剂及酶类第22页
   ·试剂盒第22页
   ·供试仪器第22-23页
3 方法第23-31页
   ·珊瑚藻总DNA提取第23页
   ·珊瑚藻总RNA提取第23-24页
   ·cDNA第一链合成第24页
   ·基本分子生物学方法第24-26页
     ·琼脂糖凝胶电泳及DNA片段的回收第24页
     ·PCR产物的克隆第24页
     ·质粒连接第24页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第24-25页
     ·转化第25页
     ·质粒提取第25页
     ·重组克隆的酶切鉴定第25-26页
     ·序列测定第26页
   ·α和β亚基脱辅基蛋白的基因克隆第26-28页
     ·α和β亚基的DNA序列克隆策略第26页
     ·α和β亚基的DNA的片段扩增第26-27页
     ·α和β亚基cDNA序列克隆策略第27页
     ·α和β亚基cDNA的片段扩增第27-28页
   ·珊瑚藻R-藻红蛋白γ亚基的N-端氨基酸序列测定第28页
   ·γ亚基脱辅基蛋白的基因克隆第28-30页
     ·γ亚基cDNA序列克隆策略第28-29页
     ·γ亚基cDNA的片段扩增第29-30页
     ·γ亚基DNA序列克隆第30页
   ·生物信息学分析第30-31页
4 结果与分析第31-60页
   ·α和β亚基脱辅基蛋白的基因克隆及生物信息学分析第31-47页
     ·片段P1-P2的克隆第31页
     ·片段P3-P4的克隆第31-32页
     ·片段Gsp2-P5的克隆第32-33页
     ·α亚基3’RACE第33页
     ·α亚基5’RACE第33-34页
     ·β亚基3’RACE第34-35页
     ·β亚基5’RACE第35-36页
     ·α和β亚基脱辅基蛋白的基因生物信息学分析第36-47页
       ·α和β亚基DNA序列与序列分析第36-38页
       ·与已知PE基因序列比较第38-43页
         ·β亚基序列比较分析第38-40页
         ·α亚基序列比较分析第40-43页
       ·α和β亚基cDNA序列与序列分析第43-45页
       ·α和β亚基的氨基酸序列二级结构分析第45-46页
       ·α和β亚基的氨基酸序列同源模建第46-47页
   ·γ亚基脱辅基蛋白的基因克隆及生物信息学分析第47-60页
     ·γ亚基N-端序列测定结果第47-48页
     ·γ亚基3’RACE第48-50页
     ·γ亚基5’RACE第50页
     ·γ亚基的DNA克隆第50-51页
     ·γ亚基脱辅基蛋白的基因生物信息学分析第51-60页
       ·γ亚基的cDNA序列分析第51-53页
       ·γ亚基的cDNA序列同源性分析第53-55页
       ·信号肽第55-56页
       ·γ亚基不同克隆子3’末端的比较分析第56-57页
       ·γ亚基的色基结合位点分析第57-58页
       ·γ亚基氨基酸内部重复序列的比较分析第58页
       ·γ亚基的氨基酸序列二级结构分析第58-59页
       ·γ亚基的DNA序列分析第59-60页
5 结论与讨论第60-63页
参考文献第63-69页
附录1第69-71页
附录2第71-73页
附录3第73-76页
致谢第76页

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