| 中文摘要 | 第1-16页 |
| 英文摘要 | 第16-19页 |
| 英文缩写词表 | 第19-20页 |
| 第一章 绪论 | 第20-47页 |
| 1．1 基因芯片技术及其研究进展 | 第20-37页 |
| 1．1．1 基因芯片技术的概念 | 第20-21页 |
| 1．1．2 基因芯片的主要类型 | 第21-22页 |
| 1．1．3 基因芯片技术的基本原理与主要内容 | 第22-29页 |
| 1．1．3．1 基因芯片的制备 | 第23-26页 |
| 1．1．3．2 待测样品的准备 | 第26页 |
| 1．1．3．3 分子杂交 | 第26-27页 |
| 1．1．3．4 检测分析 | 第27-29页 |
| 1．1．4 基因芯片技术的应用 | 第29-37页 |
| 1．1．4．1 基因表达分析 | 第29-31页 |
| 1．1．4．2 DNA序列测定 | 第31页 |
| 1．1．4．3 突变检测与基因诊断 | 第31-33页 |
| 1．1．4．4 基因组研究 | 第33-35页 |
| 1．1．4．5 药物研究与开发 | 第35页 |
| 1．1．4．6 其它领域 | 第35页 |
| 1．1．5 基因表达谱芯片技术研究中存在的问题 | 第35-37页 |
| 1．2 K562细胞分化与基因表达研究进展 | 第37-44页 |
| 1．2．1 K562细胞红系分化的基因表达与调控 | 第37-42页 |
| 1．2．1．1 细胞因子 | 第37-40页 |
| 1．2．1．2 转录因子 | 第40-42页 |
| 1．2．2 K562细胞分化的药物诱导 | 第42-44页 |
| 1．2．3 诱导分化后K562细胞的分化方向 | 第44页 |
| 1．2．4 K562细胞分化过程中基因表达研究尚存在的问题 | 第44页 |
| 1．3 本文立论依据与研究内容 | 第44-46页 |
| 1．4 本项研究的创新之处 | 第46-47页 |
| 第二章 K562细胞限制性cDNA文库的构建 | 第47-63页 |
| 2．1 引言 | 第47页 |
| 2．2 材料与方法 | 第47-54页 |
| 2．2．1 实验材料 | 第47-48页 |
| 2．2．2 实验仪器 | 第48页 |
| 2．2．3 实验方法 | 第48-54页 |
| 2．2．3．1 基础培养基的配制 | 第48页 |
| 2．2．3．2 细胞培养及药物处理 | 第48页 |
| 2．2．3．3 生长曲线的绘制 | 第48-49页 |
| 2．2．3．4 K562细胞总RNA的提取 | 第49页 |
| 2．2．3．5 mRNA纯化 | 第49-50页 |
| 2．2．3．6 cDNA合成 | 第50-51页 |
| 2．2．3．7 K562细胞限制性cDNA文库的构建 | 第51-54页 |
| 2．3 结果与讨论 | 第54-62页 |
| 2．3．1 K562细胞的生长 | 第54-55页 |
| 2．3．2 总RNA的质量检测 | 第55-57页 |
| 2．3．3 mRNA的纯化 | 第57页 |
| 2．3．4 cDNA的合成 | 第57-59页 |
| 2．3．5 限制性cDNA文库的构建 | 第59-62页 |
| 2．4 小结 | 第62-63页 |
| 第三章 基因表达谱芯片探针的制备 | 第63-80页 |
| 3．1 引言 | 第63-64页 |
| 3．2 材料与方法 | 第64-69页 |
| 3．2．1 实验材料 | 第64-65页 |
| 3．2．2 实验仪器 | 第65页 |
| 3．2．3 实验方法 | 第65-69页 |
| 3．2．3．1 PAGE银染法制备基因芯片探针 | 第65-68页 |
| 3．2．3．2 应用限制性cDNA文库制备基因芯片探针 | 第68-69页 |
| 3．3 结果与讨论 | 第69-77页 |
| 3．3．1 RD-PCR反应产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果 | 第69-72页 |
| 3．3．2 PAGE回收 DNA片段的 PCR鉴定 | 第72-73页 |
| 3．3．3 差异表达的cDNA片段序列测定结果 | 第73-75页 |
| 3．3．4 cDNA克隆的快速鉴定 | 第75-77页 |
| 3．3．5 cDNA扩增片段的纯化 | 第77页 |
| 3．4 小结 | 第77-80页 |
| 第四章 K562细胞基因表达谱芯片的制作 | 第80-95页 |
| 4．1 引言 | 第80页 |
| 4．2 材料与方法 | 第80-83页 |
| 4．2．1 实验材料 | 第80-81页 |
| 4．2．1．1 主要试剂 | 第80-81页 |
| 4．2．1．2 玻片 | 第81页 |
| 4．2．1．3 设备 | 第81页 |
| 4．2．2 实验方法 | 第81-83页 |
| 4．2．2．1 预打印及上样量测试 | 第81页 |
| 4．2．2．2 玻片介质表面处理 | 第81-82页 |
| 4．2．2．3 DNA固定率的测定 | 第82页 |
| 4．2．2．4 基因探针的质量控制 | 第82页 |
| 4．2．2．5 基因芯片阵列设计 | 第82页 |
| 4．2．2．6 基因芯片的打印及后处理 | 第82页 |
| 4．2．2．7 样品的荧光标记 | 第82-83页 |
| 4．2．2．8 芯片扫描和信息分析 | 第83页 |
| 4．3 结果与讨论 | 第83-93页 |
| 4．3．1 预打印及上样量的确定 | 第83-86页 |
| 4．3．2 玻片进行不同的表面处理对 DNA固定率的影响 | 第86-89页 |
| 4．3．2．1 同种玻片进行不同的表面处理对 DNA固定率的影响 | 第86-87页 |
| 4．3．2．2 不同种玻片进行同种表面处理对 DNA固定率的影响 | 第87-89页 |
| 4．3．3 影响DNA固定率的因素 | 第89-90页 |
| 4．3．4 探针浓度优化 | 第90-91页 |
| 4．3．5 基因探针的质量控制 | 第91-92页 |
| 4．3．6 芯片的打印及杂交检验测 | 第92-93页 |
| 4．4 小结 | 第93-95页 |
| 第五章 K562细胞基因表达谱芯片杂交动力学的初步研究 | 第95-108页 |
| 5．1 引言 | 第95页 |
| 5．2 材料与方法 | 第95-98页 |
| 5．2．1 主要试剂 | 第95页 |
| 5．2．2 实验仪器 | 第95-96页 |
| 5．2．3 实验方法 | 第96-98页 |
| 5．2．3．1 基因芯片的制作 | 第96页 |
| 5．2．3．2 样品的荧光标记 | 第96-97页 |
| 5．2．3．3 杂交与检测分析 | 第97-98页 |
| 5．2．3．4 DNA结合程度检测 | 第98页 |
| 5．2．3．5 基因芯片重复使用检测 | 第98页 |
| 5．2．3．6 标记样品用量的确定 | 第98页 |
| 5．3 结果与讨论 | 第98-106页 |
| 5．3．1 探针长度及杂交时间对杂交结果的影响 | 第98-100页 |
| 5．3．2 DNA结合程度的检测 | 第100-101页 |
| 5．3．3 重复使用的可能性 | 第101-103页 |
| 5．3．4 基因表达谱芯片杂交结果的重复性 | 第103-104页 |
| 5．3．5 最适标记样品用量的确定 | 第104-105页 |
| 5．3．6 不同样品标记方法比较 | 第105-106页 |
| 5．4 小结 | 第106-108页 |
| 第六章 应用基因表达谱芯片研究药物对k562细胞基因表达的影响 | 第108-121页 |
| 6．1 引言 | 第108-109页 |
| 6．2 材料与方法 | 第109-112页 |
| 6．2．1 实验材料 | 第109-110页 |
| 6．2．2 实验仪器 | 第110页 |
| 6．2．3 实验方法 | 第110-112页 |
| 6．2．3．1 细胞培养 | 第110页 |
| 6．2．3．2 K562细胞形态学观察 | 第110页 |
| 6．2．3．3 总 RNA的提取 | 第110页 |
| 6．2．3．4 RT-PCR检测β-珠蛋白基因表达 | 第110-111页 |
| 6．2．3．5 基因芯片的制作 | 第111页 |
| 6．2．3．6 样品的荧光标记 | 第111页 |
| 6．2．3．7 杂交检测与信息分析 | 第111-112页 |
| 6．3 结果与讨论 | 第112-118页 |
| 6．3．1 K562细胞形态学观察 | 第112页 |
| 6．3．2 总RNA完整性检测 | 第112-113页 |
| 6．3．3 β-珠蛋白基因表达 | 第113页 |
| 6．3．4 K562细胞的基因表达谱 | 第113-118页 |
| 6．3．4．1 基因芯片扫描结果 | 第113-114页 |
| 6．3．4．2 基因表达谱散点图 | 第114-115页 |
| 6．3．4．3 差异表达基因分析 | 第115-118页 |
| 6．4 小结 | 第118-121页 |
| 第七章 结论与展望 | 第121-125页 |
| 7．1 结论 | 第121-123页 |
| 7．2 展望 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-137页 |
| 发表论文情况 | 第137-138页 |
| 附录 | 第138-140页 |
| 致谢 | 第140-141页 |
