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马铃薯抗旱相关microRNA的鉴定及分析

缩略语表第1-3页
摘要第3-4页
Summary第4-6页
目录第6-8页
第一章 文献综述第8-23页
 1 miRNA第8-17页
   ·miRNA的发现及研究第8页
   ·miRNA的特征第8-9页
   ·miRNA的生物合成第9-10页
     ·动物miRNA的生物合成第9-10页
     ·植物miRNA的生物合成第10页
   ·miRNA的作用机制第10-11页
     ·miRNA介导mRNA的翻译抑制第10-11页
     ·miRNA介导mRNA的特异性切割第11页
     ·miRNA介导mRNA的快速脱腺苷酸化第11页
   ·miRNA的生物学功能第11-13页
     ·miRNA在植物中的作用第11-13页
       ·miRNA与植物的生长发育第11-12页
       ·miRNA与植物的激素调节及信号转导第12-13页
       ·miRNA与植物病害和应答环境胁迫第13页
     ·miRNA在动物中的作用第13页
   ·miRNA的鉴定第13-16页
     ·实验RNA组学研究miRNA第14-15页
       ·遗传筛选法第14页
       ·定向克隆法第14页
       ·实时定量PCR检测法第14-15页
       ·基因芯片第15页
     ·计算机RNA组学研究miRNA第15-16页
       ·利用靶序列反向搜寻法第15页
       ·基因搜寻法第15页
       ·同源性搜寻法第15-16页
   ·miRNA靶基因的鉴定第16-17页
     ·植物miRNA靶基因的预测第16页
     ·动物miRNA靶基因的预测第16-17页
 2 植物抗旱耐盐性机制概述第17-21页
   ·植物抗旱耐盐性的研究现状第17-18页
   ·抗旱生理机制研究第18-19页
   ·马铃薯抗旱性研究第19-21页
 3 本研究的目的和意义第21-23页
第二章 材料与方法第23-30页
   ·材料第23-25页
     ·马铃薯第23页
     ·数据库及分析软件第23页
     ·主要仪器及设备第23-24页
     ·主要的试剂第24页
     ·主要缓冲液的试剂成分及配制方法第24-25页
   ·方法第25-30页
     ·总RNA的获得第25-26页
     ·SRNA的排序和序列处理第26-27页
     ·已知的miRNAs生物信息学分析第27页
     ·GenBank及Rfam比对、外显子和内含子比对及小RNA分类注释第27-28页
     ·预测新的miRNA第28页
     ·已知miRNA差异分析第28-29页
     ·新miRNA靶基因的预测第29-30页
第三章 结果与分析第30-57页
   ·miRNA 的测序数量及长度分布第30-31页
     ·miRNA的测序数量第30页
     ·miRNA的测序长度分布第30-31页
   ·样品间small RNA公共及特有序列分析第31-33页
   ·miRNA与基因组比对第33-34页
   ·已知miRNA表达谱第34页
   ·小RNA与GenBank比对第34-35页
   ·Rfam比对第35-36页
   ·外显子、内含子比对第36页
   ·siRNA鉴定第36-37页
   ·miRNA分类注释第37-40页
   ·候选miRNA预测第40-46页
     ·表达谱信息第40-43页
     ·统计信息第43-46页
   ·miRNA 的差异表达分析第46-56页
   ·新miRNA靶基因预测第56-57页
第四章 讨论第57-60页
   ·计算机法来预测和鉴定miRNA第57页
   ·马铃薯抗旱相关miRNA的差异性分析第57-58页
   ·马铃薯抗旱相关miRNA的靶基因的分析第58-60页
参考文献第60-67页
致谢第67-68页
作者简介第68-69页
导师简介第69页

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