缩略语表 | 第1-3页 |
摘要 | 第3-4页 |
Summary | 第4-6页 |
目录 | 第6-8页 |
第一章 文献综述 | 第8-23页 |
1 miRNA | 第8-17页 |
·miRNA的发现及研究 | 第8页 |
·miRNA的特征 | 第8-9页 |
·miRNA的生物合成 | 第9-10页 |
·动物miRNA的生物合成 | 第9-10页 |
·植物miRNA的生物合成 | 第10页 |
·miRNA的作用机制 | 第10-11页 |
·miRNA介导mRNA的翻译抑制 | 第10-11页 |
·miRNA介导mRNA的特异性切割 | 第11页 |
·miRNA介导mRNA的快速脱腺苷酸化 | 第11页 |
·miRNA的生物学功能 | 第11-13页 |
·miRNA在植物中的作用 | 第11-13页 |
·miRNA与植物的生长发育 | 第11-12页 |
·miRNA与植物的激素调节及信号转导 | 第12-13页 |
·miRNA与植物病害和应答环境胁迫 | 第13页 |
·miRNA在动物中的作用 | 第13页 |
·miRNA的鉴定 | 第13-16页 |
·实验RNA组学研究miRNA | 第14-15页 |
·遗传筛选法 | 第14页 |
·定向克隆法 | 第14页 |
·实时定量PCR检测法 | 第14-15页 |
·基因芯片 | 第15页 |
·计算机RNA组学研究miRNA | 第15-16页 |
·利用靶序列反向搜寻法 | 第15页 |
·基因搜寻法 | 第15页 |
·同源性搜寻法 | 第15-16页 |
·miRNA靶基因的鉴定 | 第16-17页 |
·植物miRNA靶基因的预测 | 第16页 |
·动物miRNA靶基因的预测 | 第16-17页 |
2 植物抗旱耐盐性机制概述 | 第17-21页 |
·植物抗旱耐盐性的研究现状 | 第17-18页 |
·抗旱生理机制研究 | 第18-19页 |
·马铃薯抗旱性研究 | 第19-21页 |
3 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
第二章 材料与方法 | 第23-30页 |
·材料 | 第23-25页 |
·马铃薯 | 第23页 |
·数据库及分析软件 | 第23页 |
·主要仪器及设备 | 第23-24页 |
·主要的试剂 | 第24页 |
·主要缓冲液的试剂成分及配制方法 | 第24-25页 |
·方法 | 第25-30页 |
·总RNA的获得 | 第25-26页 |
·SRNA的排序和序列处理 | 第26-27页 |
·已知的miRNAs生物信息学分析 | 第27页 |
·GenBank及Rfam比对、外显子和内含子比对及小RNA分类注释 | 第27-28页 |
·预测新的miRNA | 第28页 |
·已知miRNA差异分析 | 第28-29页 |
·新miRNA靶基因的预测 | 第29-30页 |
第三章 结果与分析 | 第30-57页 |
·miRNA 的测序数量及长度分布 | 第30-31页 |
·miRNA的测序数量 | 第30页 |
·miRNA的测序长度分布 | 第30-31页 |
·样品间small RNA公共及特有序列分析 | 第31-33页 |
·miRNA与基因组比对 | 第33-34页 |
·已知miRNA表达谱 | 第34页 |
·小RNA与GenBank比对 | 第34-35页 |
·Rfam比对 | 第35-36页 |
·外显子、内含子比对 | 第36页 |
·siRNA鉴定 | 第36-37页 |
·miRNA分类注释 | 第37-40页 |
·候选miRNA预测 | 第40-46页 |
·表达谱信息 | 第40-43页 |
·统计信息 | 第43-46页 |
·miRNA 的差异表达分析 | 第46-56页 |
·新miRNA靶基因预测 | 第56-57页 |
第四章 讨论 | 第57-60页 |
·计算机法来预测和鉴定miRNA | 第57页 |
·马铃薯抗旱相关miRNA的差异性分析 | 第57-58页 |
·马铃薯抗旱相关miRNA的靶基因的分析 | 第58-60页 |
参考文献 | 第60-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
作者简介 | 第68-69页 |
导师简介 | 第69页 |