| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 目录 | 第10-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-34页 |
| ·引言 | 第14-15页 |
| ·生物膜概述 | 第15-24页 |
| ·生物膜的形成模型与结构特点 | 第15-17页 |
| ·金属离子对生物膜形成的作用机理 | 第17-20页 |
| ·群体感应对生物膜形成的调节机制 | 第20-22页 |
| ·蛋白分泌系统对生物膜形成的作用机理 | 第22-24页 |
| ·希瓦氏菌及其生物膜的概述 | 第24-31页 |
| ·希瓦氏菌的铁呼吸原理 | 第25-27页 |
| ·希瓦氏菌固体表面生物膜的研究进展 | 第27-29页 |
| ·希瓦氏菌的应用研究 | 第29-31页 |
| ·研究背景和主要内容 | 第31-34页 |
| 第二章 奥柰达希瓦氏菌MR-1气液界面生物膜的形成与特征研究 | 第34-47页 |
| ·引言 | 第34-35页 |
| ·材料和方法 | 第35-37页 |
| ·菌株和培养基 | 第35页 |
| ·S.oneidensis MR-1生物膜的形成与定量 | 第35-36页 |
| ·S.oneidensis MR-1气液界面生物膜细胞的表面形态分析 | 第36页 |
| ·S.oneidensis MR-1静置培养时溶解氧的测定 | 第36页 |
| ·S.oneidensis MR-1气液界面生物膜的酶处理 | 第36页 |
| ·S.oneidensis MR-1浮游细胞与气液界面生物膜细胞周质空间蛋白的分析 | 第36-37页 |
| ·实验结果与分析 | 第37-43页 |
| ·S.oneidensis MR-1生物膜的形成及生长动力学测定 | 第37-39页 |
| ·S.oneidensis MR-1气液界面生物膜表面形态的观察 | 第39-40页 |
| ·S.oneidensis MR-1的趋氧性研究 | 第40-41页 |
| ·S.oneidensis MR-1气液界面生物膜胞外基质成分分析 | 第41-42页 |
| ·S.oneidensis MR-1浮游细胞与气液界面生物膜细胞周质空间蛋白分析 | 第42-43页 |
| ·讨论 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 第三章 基因芯片研究奥柰达希瓦氏菌MR-1浮游细胞与气液界面生物膜细胞的差异表达 | 第47-61页 |
| ·引言 | 第47页 |
| ·材料和方法 | 第47-50页 |
| ·菌株和培养基 | 第47页 |
| ·浮游细胞与生物膜细胞的培养与分离 | 第47-48页 |
| ·S.oneidensis MR-1全基因组cDNA芯片的构建与后处理 | 第48页 |
| ·RNA的提取与荧光标记 | 第48页 |
| ·基因芯片杂交 | 第48-49页 |
| ·图象处理和数据分析 | 第49页 |
| ·芯片数据登录号 | 第49页 |
| ·实时荧光定量PCR分析 | 第49-50页 |
| ·实验结果与分析 | 第50-58页 |
| ·S.oneidensis MR-1生物膜细胞与浮游细胞中差异表达基因总概 | 第50-51页 |
| ·S.oneidensis MR-1中能量代谢基因的表达 | 第51-54页 |
| ·S.oneidensis MR-1中蛋白运输基因的表达 | 第54-56页 |
| ·S.oneidensis MR-1中调控基因的表达 | 第56-57页 |
| ·S.oneidensis MR-1中细胞解毒基因的表达 | 第57页 |
| ·q-RT-PCR检测基因芯片数据的可靠性 | 第57-58页 |
| ·讨论 | 第58-59页 |
| ·本章小结 | 第59-61页 |
| 第四章 金属离子对奥柰达希瓦氏菌MR-1气液界面生物膜形成的影响 | 第61-75页 |
| ·引言 | 第61页 |
| ·材料和方法 | 第61-67页 |
| ·实验菌株、质粒及培养条件 | 第61页 |
| ·S.oneidensis MR-1突变体的构建 | 第61-66页 |
| ·突变株生物膜的形成与定量 | 第66-67页 |
| ·EDTA对S.oneidensis MR-1生物膜的影响 | 第67页 |
| ·金属离子对S.oneidensis MR-1生物膜形成的影响 | 第67页 |
| ·实验结果与分析 | 第67-71页 |
| ·S.oneidensis MR-1铁运输基因突变株的构建结果 | 第67页 |
| ·突变体与生物膜的形成 | 第67-68页 |
| ·EDTA对S.oneidensis MR-1生物膜形成的影响 | 第68-70页 |
| ·金属离子对S.oneidensis MR-1生物膜形成的影响 | 第70-71页 |
| ·讨论 | 第71-73页 |
| ·本章小结 | 第73-75页 |
| 第五章 奥柰达希瓦氏菌MR-1的Ⅰ型蛋白分泌系统对生物膜形成的影响 | 第75-89页 |
| ·引言 | 第75页 |
| ·材料和方法 | 第75-79页 |
| ·实验菌株 | 第75-76页 |
| ·反转录PCR | 第76-78页 |
| ·S.oneidensis MR-1突变体的构建 | 第78页 |
| ·S.oneidensis MR-1 ΔaggA突变株的互补 | 第78页 |
| ·S.oneidensis MR-1突变体生物膜的形成及其动力学分析 | 第78页 |
| ·S.oneidensis MR-1固体表面生物膜的形成与定量 | 第78-79页 |
| ·群集运动实验 | 第79页 |
| ·SEM分析细胞表面结构 | 第79页 |
| ·S.oneidensis MR-1培养物上清液互补实验 | 第79页 |
| ·实验结果与分析 | 第79-85页 |
| ·S.oneidensis MR-1的rtxB操纵子中开放阅读框的共转录分析 | 第79-81页 |
| ·S.oneidensis MR-1 Ⅰ型蛋白分泌系统基因突变株的构建结果 | 第81页 |
| ·S.oneidensis MR-1 Ⅰ型蛋白分泌系统对生物膜形成的影响 | 第81-83页 |
| ·S.oneidensis MR-1 Ⅰ型蛋白分泌系统突变株生物膜形成相关表型分析 | 第83-84页 |
| ·S.oneidensis MR-1 Ⅰ型蛋白分泌系统分泌的Rtx毒素蛋白影响生物膜形成 | 第84-85页 |
| ·S.neidensis MR-1培养液对突变株的互补实验 | 第85页 |
| ·讨论 | 第85-87页 |
| ·本章小结 | 第87-89页 |
| 第六章 奥柰达希瓦氏菌MR-1的c型细胞色素对气液界面生物膜形成的影响. | 第89-100页 |
| ·引言 | 第89页 |
| ·材料和方法 | 第89-92页 |
| ·实验菌株 | 第89-90页 |
| ·突变株生物膜的形成 | 第90页 |
| ·q-PCR分析竞争生长中12株c型细胞色素突变株生长相对适合度 | 第90-92页 |
| ·群集运动实验 | 第92页 |
| ·SEM分析细胞表面形态 | 第92页 |
| ·结果与分析 | 第92-97页 |
| ·S.oneidensis MR-1的c型细胞色素突变株气液界面生物膜的形成 | 第92-94页 |
| ·S.oneidensis MR-1的12株c型细胞色素突变株静置培养时的竞争生长 | 第94-96页 |
| ·S.oneidensis MR-1的ΔSO4666与野生株的群集运动 | 第96页 |
| ·S.oneidensis MR-1的ΔSO4666与野生株细胞结构SEM分析 | 第96-97页 |
| ·讨论 | 第97-98页 |
| ·本章小结 | 第98-100页 |
| 第七章 结论 | 第100-104页 |
| 参考文献 | 第104-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 攻读学位期间主要研究工作及成果 | 第119-120页 |
