| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一部分 前言 | 第10-30页 |
| ·直翅目的起源和系统发育研究 | 第10-19页 |
| ·直翅目的起源 | 第10-11页 |
| ·直翅目的系统发育研究 | 第11-19页 |
| ·线粒体基因组及其研究情况 | 第19-25页 |
| ·线粒体及其基因组 | 第20页 |
| ·线粒体基因组的研究进展 | 第20-25页 |
| ·线粒体基因组的研究方法 | 第25-26页 |
| ·获得动物mtDNA的方法 | 第25页 |
| ·mtDNA的测序 | 第25页 |
| ·序列的拼接及注释 | 第25-26页 |
| ·全线粒体基因组的应用 | 第26页 |
| ·斑腿蝗科 | 第26-28页 |
| ·斑腿蝗科的介绍 | 第26-27页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗的介绍 | 第27-28页 |
| ·研究目的及意义 | 第28-30页 |
| 第二部分 实验材料与方法 | 第30-39页 |
| ·实验材料 | 第30-31页 |
| ·实验标本的采集、保存与鉴定 | 第30页 |
| ·实验仪器及试剂 | 第30-31页 |
| ·实验方法 | 第31-35页 |
| ·线粒体基因组全序列测定 | 第31-34页 |
| ·线粒体基因组全序列的生物信息学分析 | 第34-35页 |
| ·系统发育分析方法 | 第35-39页 |
| ·分类单元取样 | 第35页 |
| ·建树所用的分子标记 | 第35-36页 |
| ·数据准备 | 第36-37页 |
| ·序列组成分析 | 第37页 |
| ·系统发育信号检验 | 第37页 |
| ·建树 | 第37-39页 |
| 第三部分 实验结果 | 第39-70页 |
| ·三个物种总DNA的提取 | 第39-40页 |
| ·PCR扩增 | 第40-41页 |
| ·L-PCR扩增及结果 | 第40页 |
| ·Sub-PCR扩增及结果 | 第40-41页 |
| ·Sub-PCR扩增片段测序 | 第41-42页 |
| ·获得全线粒体基因组序列 | 第42-43页 |
| ·斑角蔗蝗基因组形态的描述及分析 | 第43-51页 |
| ·斑角蔗蝗线粒体基因组的基本组成特征 | 第43-45页 |
| ·蛋白质编码基因及其密码子的使用 | 第45-46页 |
| ·tRNA基因及其二级结构的预测 | 第46-47页 |
| ·rRNA基因及其二级结构的预测 | 第47-49页 |
| ·A+T丰富区 | 第49-51页 |
| ·紫胫长夹蝗线粒体基因组形态的描述及分析 | 第51-60页 |
| ·紫胫长夹蝗线粒体基因组的基本组成特征 | 第51-54页 |
| ·蛋白质编码基因及其密码子的使用 | 第54-55页 |
| ·tRNA基因及其二级结构预测 | 第55-56页 |
| ·rRNA基因及其二级结构的预测 | 第56-59页 |
| ·A+T丰富区 | 第59-60页 |
| ·小卵翅蝗线粒体基因组形态的描述及分析 | 第60-70页 |
| ·小卵翅蝗线粒体基因组的基本组成特征 | 第60-63页 |
| ·蛋白质编码基因及其密码子的使用 | 第63-64页 |
| ·tRNA基因及其二级结构的预测 | 第64-65页 |
| ·rRNA基因及其二级结构的预测 | 第65-67页 |
| ·A+T丰富区 | 第67-70页 |
| 第四部分 蝗亚目系统发育关系的重建 | 第70-88页 |
| ·数据集系统发育信号的分析 | 第70-75页 |
| ·数据集的碱基组成 | 第70-71页 |
| ·数据集的碱基替换饱和性分析 | 第71-73页 |
| ·数据集的随机树长分析及其PTP检验 | 第73-75页 |
| ·蝗亚目系统发育关系 | 第75-88页 |
| ·简约法建树 | 第75-79页 |
| ·最大似然法建树 | 第79-82页 |
| ·贝叶斯法建树 | 第82-88页 |
| 第五部分 讨论 | 第88-96页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗线粒体基因组的比较分析。 | 第88-93页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗线粒体基因组蛋白质编码基因的AT偏向性 | 第88-90页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗COX1基因的起始密码子 | 第90-91页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗的基因重叠和基因间隔区 | 第91-92页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗的rRNA及其二级结构 | 第92页 |
| ·斑角蔗蝗、紫胫长夹蝗和小卵翅蝗的A+T丰富区及其二级结构 | 第92-93页 |
| ·蝗亚目系统发育分析结果 | 第93-96页 |
| ·9棵系统发育树共有的高支持度分支 | 第94页 |
| ·斑腿蝗科的单系性问题 | 第94页 |
| ·紫胫长夹蝗和意大利蝗的姐妹关系 | 第94-95页 |
| ·斑翅蝗科的4个物种间的系统发育关系 | 第95-96页 |
| 总结 | 第96-98页 |
| 参考文献 | 第98-112页 |
| 致谢 | 第112-114页 |
| 攻读硕士学位期间科研成果 | 第114页 |
