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斜卧青霉基因表达谱的差异分析研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-14页
符号说明及缩略词第14-16页
第一章 前言第16-36页
   ·丝状真菌纤维素酶的表达调控研究进展第16-25页
     ·丝状真菌纤维素酶表达的调控机制第17-22页
     ·丝状真菌纤维素酶基因的表达调控因子第22-25页
   ·丝状真菌转化系统研究进展第25-29页
     ·丝状真菌转化方法第26-27页
     ·丝状真菌转化系统的选择标记第27-28页
     ·丝状真菌转化系统在纤维素酶研究中的应用第28-29页
   ·全基因组基因表达的转录分析方法第29-34页
     ·基因芯片技术第30-31页
     ·cDNA扩增片段长度多态性分析第31-32页
     ·基因表达系列分析第32-33页
     ·基于新一代Solexa测序技术的数字表达谱分析第33-34页
   ·本研究的主要目的和主要研究内容第34-36页
第二章 斜卧青霉114-2表达谱分析第36-64页
   ·引言第36页
   ·材料和方法第36-42页
     ·菌株和培养基第36-37页
     ·菌株的培养方法第37页
     ·常用储备液和缓冲液第37页
     ·主要试剂和仪器第37-38页
     ·总RNA的提取和处理第38-39页
     ·表达谱测序第39-40页
     ·数据分析第40-42页
   ·结果与分析第42-61页
     ·总RNA提取结果第42-43页
     ·表达谱数据库的构建与差异表达标签的统计第43-45页
     ·基于斜卧青霉基因组数据库的表达标签注释第45-48页
     ·表达谱差异基因的筛选第48-60页
     ·基因功能显著性富集分析第60-61页
   ·讨论第61-63页
   ·小结第63-64页
第三章 实时荧光定量PCR检测斜卧青霉部分基因转录水平变化第64-80页
   ·引言第64页
   ·材料和方法第64-71页
     ·菌株、质粒和引物第64-66页
     ·培养基第66页
     ·常用缓冲液、主要试剂和仪器第66-67页
     ·RT-qPCR标准曲线的制作第67-69页
     ·斜卧青霉的培养与RNA的提取第69页
     ·cDNA的合成第69页
     ·对斜卧青霉已克隆基因的实时荧光定量PCR分析第69页
     ·破碎斜卧青霉菌丝获取胞内蛋白第69-70页
     ·纤维素酶活力测定第70页
     ·SDS-PAGE及银染第70-71页
   ·结果与分析第71-77页
     ·RT-qPCR标准曲线的制作第71页
     ·RT-qPCR对9种基因在诱导与阻遏条件下的转录分析第71-77页
   ·讨论第77-78页
   ·小结第78-80页
第四章 斜卧青霉遗传操作系统的建立及瑞氏木霉内切葡聚糖酶Ⅱ的异源表达第80-96页
   ·引言第80页
   ·材料和方法第80-86页
     ·菌株和质粒第80-81页
     ·培养基第81页
     ·常用缓冲液、主要试剂、工具酶和仪器第81-83页
     ·斜卧青霉114-2尿嘧啶缺陷型菌株的筛选第83页
     ·整合型表达载体ANIp7-cel5A的构建第83-84页
     ·斜卧青霉M12原生质体的制备和转化第84页
     ·斜卧青霉转化子的染色体基因组小量提取第84-85页
     ·纤维素酶活力测定第85页
     ·SDS-PAGE、内切葡聚糖酶活性染色第85页
     ·Western-blot第85-86页
   ·结果与分析第86-93页
     ·斜卧青霉114-2尿嘧啶营养缺陷型菌株的筛选第86-88页
     ·整合型表达载体ANIp7-cel5A的构建与转化第88-90页
     ·瑞氏木霉Ce15A在斜卧青霉中的表达第90-93页
   ·讨论第93-94页
   ·小结第94-96页
第五章 斜卧青霉114-2液泡型丝氨酸蛋白酶基因的敲除第96-114页
   ·引言第96-97页
   ·材料和方法第97-103页
     ·菌株和质粒第97页
     ·培养基第97页
     ·常用缓冲液、主要试剂、工具酶与仪器第97页
     ·简并引物设计与PCR扩增vsp基因第97-98页
     ·TAIL-PCR扩增vsp基因5’端和3’端第98-100页
     ·SEFA-PCR扩增vsp基因5’端和3’端第100-102页
     ·测序与序列分析第102页
     ·敲除载体pK-vsp的构建第102页
     ·敲除载体的转化与敲除子筛选第102-103页
   ·结果与分析第103-112页
     ·斜卧青霉液泡型丝氨酸蛋白酶基因片段的克隆第103-104页
     ·TAIL-PCR扩增液泡型丝氨酸蛋白酶基因5’端和3’端序列第104-105页
     ·SEFA-PCR扩增液泡型丝氨酸蛋白酶基因的5’和3’端序列第105-109页
     ·敲除载体pk-vsp的构建第109-110页
     ·敲除子的鉴定第110-112页
   ·讨论第112-113页
   ·小结第113-114页
全文总结与展望第114-116页
 1 本论文取得的创新性结果第114-115页
 2 本论文存在的问题及深入方向第115-116页
参考文献第116-136页
攻读学位期间发表的学术论文第136-138页
致谢第138-139页
学位论文评阅及答辩情况表第139页

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