| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 文献综述 | 第11-20页 |
| 1 我国生猪养殖业的发展现状 | 第11-12页 |
| 2 我国养猪业的主要饲养模式 | 第12-13页 |
| 2.1 传统农户散养 | 第12页 |
| 2.2 规模化养殖 | 第12-13页 |
| 2.3 林下养殖 | 第13页 |
| 3 不同饲养模式对猪生产性能的影响 | 第13-15页 |
| 3.1 不同饲养模式与猪生长性能之间的关系 | 第13-14页 |
| 3.2 不同饲养模式与猪胴体品质、肉质之间的关系 | 第14-15页 |
| 3.3 不同饲养模式与猪疾病之间的关系 | 第15页 |
| 4 猪肠道微生态及其作用 | 第15-19页 |
| 4.1 与动物肠道菌群多样性相关的因子 | 第16-18页 |
| 4.2 肠道菌群的作用 | 第18-19页 |
| 5 尚需探讨的科学问题 | 第19-20页 |
| 1 引言 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-25页 |
| 2.1 饲养试验 | 第21-22页 |
| 2.1.1 供试猪与分组 | 第21页 |
| 2.1.2 饲养模式设定 | 第21页 |
| 2.1.3 试验猪日常管理 | 第21-22页 |
| 2.2 粪便样品的采集与处理 | 第22页 |
| 2.3 样品DNA的提取 | 第22页 |
| 2.4 DNA样本纯度、浓度的检测 | 第22-23页 |
| 2.5 PCR扩增、文库构建 | 第23页 |
| 2.6 生物学信息学分析 | 第23-25页 |
| 2.6.1 OTU及其丰度分析 | 第24页 |
| 2.6.2 物种及其丰度分析 | 第24页 |
| 2.6.3 样品多样性分析 | 第24-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-35页 |
| 3.1 结果质控分析 | 第25-26页 |
| 3.1.1 DNA提取质控 | 第25页 |
| 3.1.2 测序结果质控 | 第25-26页 |
| 3.2 不同饲养模式下肠道微生物的丰度 | 第26-33页 |
| 3.2.1 OTU丰度 | 第26-28页 |
| 3.2.2 物种注释 | 第28-33页 |
| 3.3 不同饲养模式猪肠道菌群的多样性 | 第33-35页 |
| 3.3.1 Alpha多样性指数分析 | 第33-34页 |
| 3.3.2 PCA主坐标分析 | 第34-35页 |
| 4 讨论 | 第35-37页 |
| 4.1 不同饲养模式下肠道微生物群落结构组成 | 第35-36页 |
| 4.2 不同饲养模式下三元杂交猪与淮猪肠道菌群差异性分析 | 第36-37页 |
| 4.2.1 三元杂交猪比淮猪的肠道菌群更具有多样性 | 第36页 |
| 4.2.2 林下养殖的肠道菌群比三元杂交猪更具有多样性 | 第36-37页 |
| 5 结论 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-46页 |
| 个人简介 | 第46页 |
