| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第12-24页 |
| 1.1 引言 | 第12页 |
| 1.2 circRNA简介 | 第12-18页 |
| 1.2.1 circRNA的发现 | 第13页 |
| 1.2.2 circRNA的形成与特征 | 第13-15页 |
| 1.2.3 circRNA的功能 | 第15-17页 |
| 1.2.4 circRNA与疾病 | 第17-18页 |
| 1.3 细胞因子TNF-α | 第18-20页 |
| 1.3.1 TNF-α的生物结构 | 第18页 |
| 1.3.2 TNF-α的分子生物学功能 | 第18-19页 |
| 1.3.4 TNF-α相关信号通路 | 第19-20页 |
| 1.4 转录组测序技术 | 第20-22页 |
| 1.5 研究内容 | 第22-23页 |
| 1.6 研究目的及意义 | 第23-24页 |
| 第二章 TNF-α 处理前后的HepG2肝癌细胞及HL-7702 正常人肝细胞circRNA预测 | 第24-42页 |
| 2.1 引言 | 第24页 |
| 2.2 试验材料与方法 | 第24-35页 |
| 2.2.1 材料 | 第24页 |
| 2.2.2 细胞培养及TNF-α 诱导 | 第24页 |
| 2.2.3 Total RNA提取 | 第24-25页 |
| 2.2.4 Total RNA样本质量检测 | 第25页 |
| 2.2.5 转录组测序流程 | 第25-28页 |
| 2.2.6 测序数据质量分析 | 第28-32页 |
| 2.2.7 测序数据过滤 | 第32-35页 |
| 2.3 circRNA的预测 | 第35-40页 |
| 2.3.1 预测方法 | 第35-36页 |
| 2.3.2 预测结果 | 第36-40页 |
| 2.4 本章小结 | 第40-42页 |
| 第三章 TNF-α 处理前后的HepG2肝癌细胞及HL-7702 正常人肝细胞的circRNA表达谱差异分析 | 第42-50页 |
| 3.1 引言 | 第42页 |
| 3.2 circRNA表达差异分析 | 第42-45页 |
| 3.2.1 circRNA表达水平归一化 | 第42-43页 |
| 3.2.2 差异表达数据筛选 | 第43-45页 |
| 3.3 circRNA对应host gene的功能注释 | 第45-48页 |
| 3.3.1 功能注释分析方法 | 第45-47页 |
| 3.3.2 功能注释结果 | 第47-48页 |
| 3.4 本章小结 | 第48-50页 |
| 第四章 TNF-α 处理前后的HepG2肝癌细胞及HL-7702 正常人肝细胞的circRNA-miRNA-mRNA关联分析 | 第50-58页 |
| 4.1 circRNA和miRNA的相互作用关系预测 | 第50-52页 |
| 4.1.1 circRNA和miRNA的相互作用关系预测方法 | 第50-51页 |
| 4.1.2 circRNA和miRNA的相互作用关系预测结果 | 第51-52页 |
| 4.2 circRNA-miRNA-mRNA调控通路分析 | 第52-55页 |
| 4.2.1 miRNA的KEGG通路分析 | 第52-55页 |
| 4.3 本章小结 | 第55-58页 |
| 第五章 总结 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 附表一 表达上调circRNA的host gene的GO功能注释结果 | 第66-72页 |
| 附表二 表达下调circRNA的host gene的GO功能注释结果 | 第72-84页 |
| 附表三 circRNA相互作用的miRNAs富集的KEGG通路 | 第84-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 作者简介 | 第90页 |
