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利用CRISPR/Cas9系统介导的基因敲入构建R778L类型肝豆状核变性疾病小鼠模型

中文摘要第5-6页
Abstract第6-7页
前言第8-13页
    1. 肝豆状核变性是一类高度异质性的常染色体隐性遗传病第8-9页
    2. 目前肝豆状核变性治疗手段有限第9-10页
    3. R778L是亚洲地区肝豆状核变性最普遍的突变类型第10页
    4. 构建针对R778L类型突变的小鼠模型十分必要第10-11页
    5. CRISPR/Cas9介导的基因敲入为构建精准动物模型提供了可能第11-13页
实验材料第13-16页
    1. 细胞第13页
    2. 菌株第13页
    3. 载体第13页
    4. 实验小鼠和饲料第13页
    5. 试剂和耗材第13-14页
        5.1 细胞试剂和耗材第13-14页
        5.2 生化试剂第14页
    6. 主要的仪器设备第14页
    7. 引物第14-15页
    8. 主要培养基的配制第15页
    9. 生物信息学分析软件及网站第15-16页
实验方法第16-34页
    1. 载体构建相关实验第16-17页
        1.1 常规连接产物的转化第16页
        1.2 快速转化现有质粒第16页
        1.3 质粒小量提取第16-17页
        1.4 质粒大量提取第17页
    2. 细胞培养第17-20页
        2.1 原代MEF细胞的分离和培养第17-19页
        2.2 培养胚胎干细胞用滋养层细胞MEF的制备和培养第19页
        2.3 小鼠ES细胞培养第19-20页
    3. CRISPR/Cas9系统的设计第20-22页
        3.1 sgRNA的设计第20页
        3.2 同源重组模板单链寡聚核苷酸(ssODN)的设计第20页
        3.3 PX330载体的构建第20-21页
        3.4 小鼠ES细胞的电穿孔第21-22页
        3.5 T7E I酶切实验第22页
    4. 体外转录RNA第22-25页
        4.1 体外转录模板DNA的准备第22-23页
        4.2 体外转录guide RNA第23页
        4.3 体外转录获取Cas9 mRNA第23-25页
        4.4 显微注射工作液的配置第25页
    5. 小鼠受精卵显微注射第25-26页
    6. 小鼠基因型鉴定第26-27页
        6.1 小鼠基因组的提取第26页
        6.2 PCR鉴定小鼠基因型第26-27页
        6.3 TA克隆第27页
    7. 血清生化指标检测第27页
        7.1 小鼠血清的提取第27页
        7.2 血清谷丙转氨酶/谷草转氨酶的检测第27页
    8. 小鼠肝脏相关指标检测第27-29页
        8.1 小鼠肝脏的收集第27-28页
        8.2 石蜡包埋切片第28页
        8.3 H&E染色第28页
        8.4 干的肝脏铜离子检测第28-29页
    9. 小鼠呼吸交换率的检测第29页
        9.1 代谢笼第29页
        9.2 呼吸交换率的检测第29页
    10. 脱靶效应的检测和评估第29-34页
        10.1 Deep sequence的建库第30-33页
        10.2 Deep sequence的分析第33-34页
实验结果第34-42页
    1. ATP7B基因在人和小鼠中是高度保守的第34-35页
    2. 利用CRISPR/Cas9介导的基因敲入获得R780L突变小鼠第35-37页
    3. R780L纯合小鼠肝脏有明显的病理改变第37-38页
    4. R780L纯合小鼠肝脏有明显的铜离子淤积且肝脏损伤明显第38-41页
    5. R780L突变纯合模型鼠并未检测到脱靶情况第41-42页
讨论第42-44页
    1. 本研究概述第42页
    2. R780L小鼠是研究R778L类型肝豆状核变性发病机制的理想模型第42页
    3. R780L小鼠是基因治疗R778L类型肝豆状核变性的合适载体第42-43页
    4. 本研究的不足:R778L类型肝豆状核变性的发病机制有待后续阐明第43页
    5. CRISPR/Cas9技术在疾病模型构建中的应用第43页
    6. 本研究的展望:R780L模型小鼠有望解释一部分肝豆状核变性基因型与表型不匹配这一领域难题第43-44页
参考文献第44-48页
文献综述第48-63页
    参考文献第57-63页
英文名词及缩写第63-64页
致谢第64-65页
个人简历第65-66页

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