摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-8页 |
第1章 绪论 | 第12-17页 |
1.1 研究背景与意义 | 第12-13页 |
1.2 国内外研究现状 | 第13-15页 |
1.3 本文的主要工作 | 第15页 |
1.4 本文的组织结构 | 第15-17页 |
第2章 生物标记识别相关基础 | 第17-30页 |
2.1 差异网络 | 第17-18页 |
2.2 相关生物数据介绍 | 第18-23页 |
2.2.1 基因表达数据 | 第18-20页 |
2.2.2 TCGA-Assembler | 第20-21页 |
2.2.3 GO数据 | 第21-22页 |
2.2.4 癌症基因数据 | 第22-23页 |
2.3 SAM算法 | 第23-24页 |
2.4 WGCNA算法 | 第24-29页 |
2.4.1 WGCNA理论基础 | 第24-26页 |
2.4.2 WGCNA算法基础 | 第26-29页 |
2.5 支持向量机(SVM) | 第29页 |
2.6 小结 | 第29-30页 |
第3章 生物标记识别方法研究及实验结果分析 | 第30-45页 |
3.1 研究背景 | 第30-31页 |
3.2 生物标记识别方法 | 第31-34页 |
3.2.1 算法思想 | 第31-32页 |
3.2.2 算法实现详细描述 | 第32-34页 |
3.3 实验过程 | 第34-38页 |
3.3.1 实验数据 | 第34-35页 |
3.3.2 实验方法 | 第35-38页 |
3.4 实验结果分析与验证 | 第38-44页 |
3.4.1 生物意义分析 | 第40-43页 |
3.4.2 分类器模型分析 | 第43-44页 |
3.5 小结 | 第44-45页 |
第4章 基于共表达网络的乳腺癌生物标记识别系统设计与实现 | 第45-55页 |
4.1 系统开发环境与运行环境 | 第45页 |
4.2 系统工作的功能模块 | 第45-47页 |
4.3 系统的实现 | 第47-54页 |
4.3.1 系统主界面的实现 | 第47页 |
4.3.2 上传数据界面的实现 | 第47-48页 |
4.3.3 数据分析处理界面的实现 | 第48-49页 |
4.3.4 SAM筛选差异基因界面的实现 | 第49-50页 |
4.3.5 筛选差异共表达基因界面的实现 | 第50-52页 |
4.3.6 识别基因模块界面的实现 | 第52-54页 |
4.3.7 识别生物标记界面的实现 | 第54页 |
4.4 小结 | 第54-55页 |
第5章 总结与展望 | 第55-57页 |
5.1 总结 | 第55-56页 |
5.2 展望 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-61页 |
作者简介 | 第61-62页 |
致谢 | 第62页 |