| 摘要 | 第9-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 缩略词表 | 第16-18页 |
| 前言 | 第18-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-40页 |
| 1 镉是生物毒性极强的重金属元素 | 第20页 |
| 2 镉对植物的毒害效应 | 第20-23页 |
| 2.1 镉影响植物生长发育 | 第21页 |
| 2.2 镉影响植物光合作用和呼吸作用 | 第21页 |
| 2.3 镉影响水分吸收和营养平衡 | 第21-22页 |
| 2.4 镉诱导产生氧化胁迫 | 第22-23页 |
| 3 植物镉胁迫响应分子机制 | 第23-29页 |
| 3.1 限制Cd吸收和外排作用 | 第23页 |
| 3.2 螯合作用 | 第23-25页 |
| 3.3 液泡区室化 | 第25-26页 |
| 3.4 重金属运载蛋白的转运与调控 | 第26-29页 |
| 3.5 抗氧化防御系统 | 第29页 |
| 4 作物Cd吸收累积相关性状QTLs定位分析 | 第29-34页 |
| 4.1 植物遗传连锁图谱构建 | 第29-31页 |
| 4.2 QTLs定位基本原理与方法 | 第31-32页 |
| 4.3 萝卜遗传连锁图谱构建与重要性状QTLs定位分析 | 第32-33页 |
| 4.4 作物Cd吸收累积性状遗传模式与QTLs定位分析 | 第33-34页 |
| 5 植物miRNA重金属胁迫响应调控机制 | 第34-37页 |
| 5.1 植物miRNA生物合成 | 第35页 |
| 5.2 植物miRNA分离鉴定方法 | 第35-36页 |
| 5.3 植物miRNA重金属胁迫响应调控机制 | 第36-37页 |
| 6 本研究目的和意义 | 第37-40页 |
| 第二章 萝卜高密度遗传连锁图谱构建与Cd吸收累积性状QTLs定位分析 | 第40-68页 |
| 1 材料与方法 | 第41-44页 |
| 1.1 实验材料 | 第41-42页 |
| 1.2 营养液培养与镉胁迫处理 | 第42页 |
| 1.3 基因组DNA提取 | 第42页 |
| 1.4 分子标记分析 | 第42-43页 |
| 1.5 数据整理与连锁分析 | 第43-44页 |
| 1.6 镉含量测定 | 第44页 |
| 1.7 数据统计分析 | 第44页 |
| 1.8 QTLs定位分析 | 第44页 |
| 2 结果与分析 | 第44-61页 |
| 2.1 萝卜基因组DNA提取 | 第44-45页 |
| 2.2 分子标记分析 | 第45-50页 |
| 2.3 遗传连锁图谱构建 | 第50-53页 |
| 2.4 Cd吸收累积性状表型值及遗传分布 | 第53-55页 |
| 2.5 相关性分析 | 第55页 |
| 2.6 Cd累积相关农艺性状QTLs定位 | 第55-58页 |
| 2.7 肉质根和地上部Cd累积量QTLs定位 | 第58-60页 |
| 2.8 紧密连锁标记筛选 | 第60-61页 |
| 3 讨论 | 第61-68页 |
| 3.1 亲本与作图群体选配 | 第61页 |
| 3.2 本研究遗传连锁图谱特征分析 | 第61-62页 |
| 3.3 萝卜Cd累积性状QTLs位点检测 | 第62-63页 |
| 3.4 萝卜Cd累积量与重要农艺性状相关性 | 第63-66页 |
| 3.5 紧密连锁标记应用 | 第66-68页 |
| 第三章 萝卜Cd胁迫响应相关基因表达谱分析 | 第68-90页 |
| 1 材料与方法 | 第69-73页 |
| 1.1 植物材料与胁迫处理 | 第69页 |
| 1.2 试验方法 | 第69-73页 |
| 1.2.1 总RNA提取 | 第69页 |
| 1.2.2 总RNA质量检测 | 第69-70页 |
| 1.2.3 数字基因表达谱测序 | 第70页 |
| 1.2.4 基因表达量分析 | 第70-71页 |
| 1.2.5 差异表达基因筛选 | 第71页 |
| 1.2.6 差异基因功能注释 | 第71页 |
| 1.2.7 qRT-PCR 验证 | 第71-72页 |
| 1.2.8 萝卜RsMT1和RsMT3基因克隆 | 第72页 |
| 1.2.9 RsMT1启动子序列克隆与分析 | 第72-73页 |
| 2 结果与分析 | 第73-87页 |
| 2.1 测序结果统计分析 | 第73-74页 |
| 2.2 Unigene功能注释 | 第74-75页 |
| 2.3 Cd胁迫差异基因筛选 | 第75页 |
| 2.4 差异基因功能注释 | 第75-79页 |
| 2.5 qRT-PCR验证 | 第79-80页 |
| 2.6 RsMT1和RsMT3基因特异性扩增 | 第80-81页 |
| 2.7 萝卜RsMT1和RsMT3基因克隆及序列分析 | 第81-82页 |
| 2.8 RsMT1和RsMT3氨基酸序列分析 | 第82-83页 |
| 2.9 萝卜RsMT1基因启动子序列克隆与分析 | 第83-85页 |
| 2.10 萝卜RsMT1和RsMT3基因表达特性分析 | 第85-87页 |
| 3 讨论 | 第87-90页 |
| 3.1 RNA-Seq技术在转录组学研究等方面应用 | 第87页 |
| 3.2 DGE技术分离鉴定重金属胁迫响应基因 | 第87-88页 |
| 3.3 萝卜金属硫蛋白基因表达特性与启动子分析 | 第88-90页 |
| 第四章 萝卜RsPCS2基因克隆与启动子分析 | 第90-108页 |
| 1 材料与方法 | 第91-96页 |
| 1.1 试验材料 | 第91-92页 |
| 1.2 试验方法 | 第92-96页 |
| 1.2.1 总RNA提取与检测 | 第92页 |
| 1.2.2 cDNA合成 | 第92页 |
| 1.2.3 RsPCS2基因克隆 | 第92-95页 |
| 1.2.4 RsPCS2基因启动子克隆与分析 | 第95-96页 |
| 1.2.5 RsPCS2基因表达特征分析 | 第96页 |
| 2 结果与分析 | 第96-105页 |
| 2.1 萝卜总RNA提取 | 第96页 |
| 2.2 扩增和克隆结果 | 第96-97页 |
| 2.3 萝卜RsPCS2基因DNA和cDNA序列克隆及分析 | 第97-99页 |
| 2.4 萝卜RsPCS2基因蛋白特征分析 | 第99-100页 |
| 2.5 RsPCS2氨基酸序列同源性及系统树分析 | 第100-102页 |
| 2.6 萝卜RsPCS2基因启动子序列克隆与分析 | 第102-104页 |
| 2.7 萝卜RsPCS2基因表达特性分析 | 第104-105页 |
| 3 讨论 | 第105-108页 |
| 3.1 萝卜RsPCS2基因序列特征与表达特性 | 第105-106页 |
| 3.2 萝卜RsPCS2基因启动子序列分析 | 第106-107页 |
| 3.3 植物PCS基因重金属胁迫响应分子特征 | 第107-108页 |
| 第五章 萝卜RsIRT2与RsNramp3基因克隆与表达分析 | 第108-124页 |
| 1 材料与方法 | 第109-110页 |
| 1.1 植物材料与胁迫处理 | 第109页 |
| 1.2 试验方法 | 第109-110页 |
| 1.2.1 萝卜不同组织总RNA提取与与cDNA合成 | 第109页 |
| 1.2.2 RsIRT2与RsNramp3基因克隆 | 第109-110页 |
| 1.2.3 RsIRT2和RsNramp3基因表达特征分析 | 第110页 |
| 2 结果与分析 | 第110-120页 |
| 2.1 扩增和克隆结果 | 第110-111页 |
| 2.2 萝卜RsIRT2和RsNramp3基因的克隆及序列分析 | 第111-114页 |
| 2.3 萝卜RsIRT2和RsNramp3蛋白特征分析 | 第114-116页 |
| 2.4 萝卜RsIRT2和RsNramp3氨基酸序列分析 | 第116-118页 |
| 2.5 萝卜RsIRT2和RsNramp3基因表达特性分析 | 第118-120页 |
| 3 讨论 | 第120-124页 |
| 3.1 萝卜RsIRT2基因重金属胁迫响应分子特征 | 第120-121页 |
| 3.2 萝卜RsNramp3基因重金属胁迫响应分子特征 | 第121-124页 |
| 第六章 萝卜ZIP家族基因克隆与表达分析 | 第124-136页 |
| 1 材料与方法 | 第125-126页 |
| 1.1 植物材料与胁迫处理 | 第125页 |
| 1.2 试验方法 | 第125-126页 |
| 1.2.1 萝卜不同组织总RNA提取与cDNA合成 | 第125页 |
| 1.2.2 萝卜RsZIP1和RsZIP4基因克隆 | 第125-126页 |
| 1.2.3 RsZIP1和RsZIP4基因表达特征分析 | 第126页 |
| 2 结果与分析 | 第126-133页 |
| 2.1 扩增和克隆结果 | 第126页 |
| 2.2 萝卜RsZIP1和RsZIP4基因克隆及序列分析 | 第126-129页 |
| 2.3 RsZIP1和RsZIP4蛋白特征分析 | 第129-130页 |
| 2.4 RsZIP1和RsZIP4氨基酸序列同源性及系统树分析 | 第130-132页 |
| 2.5 萝卜RsZIP1和RsZIP4基因表达特性分析 | 第132-133页 |
| 3 讨论 | 第133-136页 |
| 3.1 萝卜ZIP家族基因序列特征分析 | 第133页 |
| 3.2 ZIP家族基因重金属胁迫响应分子特征 | 第133-136页 |
| 第七章 萝卜Cd胁迫响应microRNA分离与鉴定 | 第136-164页 |
| 1 材料与方法 | 第137-141页 |
| 1.1 植物材料与胁迫处理 | 第137页 |
| 1.2 试验方法 | 第137-141页 |
| 1.2.1 总RNA提取 | 第137页 |
| 1.2.2 总RNA质量检测 | 第137页 |
| 1.2.3 小分子RNA文库构建和测序 | 第137-138页 |
| 1.2.4 测序数据分析流程 | 第138页 |
| 1.2.5 Cd胁迫响应miRNA差异分析 | 第138-139页 |
| 1.2.6 降解组测序 | 第139页 |
| 1.2.7 qRT-PCR分析验证 | 第139-141页 |
| 2 结果与分析 | 第141-160页 |
| 2.1 萝卜肉质根小RNA文库序列分析 | 第141-144页 |
| 2.2 已知miRNA分离鉴定 | 第144-149页 |
| 2.3 新型miRNA鉴定 | 第149-151页 |
| 2.4 Cd胁迫响应miRNA分离鉴定 | 第151-153页 |
| 2.5 降解组测序验证差异miRNA靶基因 | 第153-156页 |
| 2.6 Cd胁迫响应miRNA qRT-PCR验证 | 第156-160页 |
| 3 讨论 | 第160-164页 |
| 3.1 萝卜Cd胁迫响应miRNA分离鉴定 | 第160页 |
| 3.2 植物Cd胁迫响应miRNA分子特征 | 第160-161页 |
| 3.3 Cd胁迫响应miRNA及其靶基因调控机制 | 第161-164页 |
| 全文结论 | 第164-166页 |
| 本文创新之处 | 第166-168页 |
| 参考文献 | 第168-180页 |
| 博士在读期间发表学术论文 | 第180-182页 |
| 致谢 | 第182页 |
