| CONTENTS | 第5-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 研究的目的与意义 | 第12页 |
| 1.2 文献综述 | 第12-17页 |
| 1.2.1 盐、碱胁迫及盐碱混合胁迫对植物的影响 | 第12-14页 |
| 1.2.2 植物耐盐碱机制 | 第14页 |
| 1.2.3 植物对盐、碱逆境不同的响应途径 | 第14-15页 |
| 1.2.4 转录组学研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2.5 新一代测序技术在植物转录组研究中的应用 | 第16页 |
| 1.2.6 野生大豆耐盐碱研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 主要研究内容 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第18页 |
| 2.1.2 测序平台 | 第18页 |
| 2.1.3 生化试剂及耗材 | 第18页 |
| 2.1.4 PCR引物 | 第18页 |
| 2.1.5 数据库 | 第18页 |
| 2.1.6 生物软件 | 第18-19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-23页 |
| 2.2.1 植物材料处理与转录组测序 | 第19页 |
| 2.2.2 转录组测序结果的Realtime-PCR验证 | 第19-21页 |
| 2.2.3 测序数据处理 | 第21-22页 |
| 2.2.4 NaHCO_3胁迫应答基因的筛选 | 第22-23页 |
| 3 结果与分析 | 第23-56页 |
| 3.1 转录组数据的获得 | 第23-35页 |
| 3.1.1 野生大豆G07256盐碱胁迫处理及RNA的提取 | 第23-31页 |
| 3.1.2 测序评估结果分析 | 第31页 |
| 3.1.3 数据定位统计 | 第31页 |
| 3.1.4 A/T/G/C含量分别检测 | 第31-34页 |
| 3.1.5 基因表达量统计 | 第34页 |
| 3.1.6 差异表达基因统计 | 第34-35页 |
| 3.2 NaHCO_3胁迫下差异表达基因分析 | 第35-53页 |
| 3.2.1 NaHCO_3胁迫应答基因表达模式聚类分析 | 第35-36页 |
| 3.2.2 NaHCO_3胁迫应答基因功能聚类分析 | 第36-45页 |
| 3.2.3 共差异表达基因功能聚类分析 | 第45-49页 |
| 3.2.4 Realtime-PCR验证 | 第49-53页 |
| 3.2.5 NaHCO_3胁迫下后续研究相关基因的筛选 | 第53页 |
| 3.3 NaHCO_3胁迫下野生大豆G07256转录本特性相关分析 | 第53-56页 |
| 3.3.1 新转录本的预测 | 第53-54页 |
| 3.3.2 可变剪接分析 | 第54-55页 |
| 3.3.3 SNP分析与插入或缺失(Indel)分析 | 第55-56页 |
| 4 讨论 | 第56-60页 |
| 4.1 NaHCO_3胁迫下差异表达基因的筛选 | 第57-58页 |
| 4.2 差异表达基因功能分类及通路分析 | 第58-60页 |
| 4.2.1 信号转导 | 第58-59页 |
| 4.2.2 转录因子 | 第59-60页 |
| 5 结论 | 第60-62页 |
| 5.1 获得野生大豆G07256在NaHCO_3胁迫下根基因表达谱 | 第60页 |
| 5.2 分析得出了差异表达基因特征 | 第60页 |
| 5.3 分析出了NaHCO_3胁迫下野生大豆G07256转录本特征 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 附录 | 第70-82页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第82页 |
