| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 PPI网络和蛋白质复合物 | 第10-11页 |
| 1.3 研究内容 | 第11-12页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第12-13页 |
| 2 蛋白质复合物识别方法研究进展 | 第13-20页 |
| 2.1 基于传统静态Pn网络的蛋白质复合物识别方法 | 第13-17页 |
| 2.1.1 稠密子图聚类算法 | 第13-15页 |
| 2.1.2 层次聚类算法 | 第15-16页 |
| 2.1.3 其他聚类算法 | 第16-17页 |
| 2.2 集成生物信息的蛋白质复合物识别方法 | 第17-18页 |
| 2.3 基于动态网络的蛋白质复合物识别方法 | 第18-19页 |
| 2.4 本章小结 | 第19-20页 |
| 3 基于时间片相关性的蛋白质复合物识别方法TACD | 第20-33页 |
| 3.1 方法设计 | 第20-25页 |
| 3.1.1 动态PF[网络的构建及簇的识别 | 第20-22页 |
| 3.1.2 簇的融合 | 第22-24页 |
| 3.1.3 过滤处理 | 第24-25页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第25-32页 |
| 3.2.1 匹配已知复合物 | 第25-31页 |
| 3.2.2 参数影响分析 | 第31-32页 |
| 3.3 本章小结 | 第32-33页 |
| 4 基于基因表达谱和PPI网络的蛋白质复合物识别方法DPC | 第33-44页 |
| 4.1 方法设计 | 第33-37页 |
| 4.1.1 复合物核的识别 | 第33-35页 |
| 4.1.2 潜在蛋白质复合物的识别 | 第35-36页 |
| 4.1.3 假阳性过滤处理 | 第36-37页 |
| 4.2 实验结果与分析 | 第37-43页 |
| 4.2.1 蛋白质复合物核分析 | 第37-39页 |
| 4.2.2 匹配已知复合物 | 第39-40页 |
| 4.2.3 功能注释分析 | 第40-41页 |
| 4.2.4 动态性分析 | 第41-43页 |
| 4.3 本章小结 | 第43-44页 |
| 5 总结与展望 | 第44-47页 |
| 5.1 研究工作总结 | 第44-45页 |
| 5.2 研究展望 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
