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酉州乌羊和渝东白山羊ASIP基因序列及表达差异分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
符号说明第9-13页
1. 文献综述第13-22页
    1.1 肤色的形成机制第13-14页
    1.2 肤色相关基因研究现状第14-21页
        1.2.1 ASIP基因的研究进展第14-17页
            1.2.1.1 ASIP基因的作用机理第14-15页
            1.2.1.2 ASIP基因研究现状第15-16页
            1.2.1.3 ASIP基因的表达第16页
            1.2.1.4 ASIP基因的突变第16-17页
        1.2.2 MC1R基因第17-19页
        1.2.3 酪氨酸酶关联蛋白家族基因第19-21页
    1.3 酉州乌羊和渝东白山羊第21-22页
    1.4 本研究的目的与意义第22页
2. 试验材料与方法第22-35页
    2.1 试验材料第22-23页
        2.1.1 试验血样第22-23页
        2.1.2 试验组织样品第23页
    2.2 仪器与试剂第23-27页
        2.2.1 主要仪器设备第23-24页
        2.2.2 主要试剂与试剂盒第24-25页
        2.2.3 常用试剂的配制第25页
        2.2.4 引物信息第25-27页
    2.3 试验方法第27-34页
        2.3.1 ASIP基因序列测定第27-30页
            2.3.1.1 山羊基因组DNA的提取第27-28页
            2.3.1.2 DNA浓度和纯度的检测及测定第28页
            2.3.1.3 引物设计第28页
            2.3.1.4 PCR反应条件的建立与优化第28-29页
            2.3.1.5 PCR产物的检测与测序第29页
            2.3.1.6 ASIP基因变异位点的测定第29-30页
        2.3.2 ASIP基因CDS区序列扩增分析第30-33页
            2.3.2.1 总RNA的提取与检测第30-31页
            2.3.2.2 cDNA第一条链的合成第31-32页
            2.3.2.3 序列扩增及测序第32页
            2.3.2.4 生物信息学分析第32-33页
        2.3.3 ASIP基因表达检测第33-34页
            2.3.3.1 半定量与定量引物设计第33页
            2.3.3.2 半定量RT-PCR扩增第33页
            2.3.3.3 电泳检测第33-34页
            2.3.3.4 实时荧光定量PCR第34页
        2.3.4 肌内脂肪含量的测定第34页
    2.4 数据处理第34-35页
        2.4.1 半定量数据分析第34页
        2.4.2 实时荧光定量PCR数据分析第34-35页
3 结果与分析第35-53页
    3.1 ASIP基因序列的扩增结果与分析第35-39页
        3.1.1 基因组DNA提取结果第35页
        3.1.2 ASIP基因序列扩增结果第35-37页
        3.1.3 ASIP基因测序结果第37-38页
        3.1.4 启动子区预测第38-39页
        3.1.5 ASIP基因的变异位点第39页
    3.2 ASIP基因编码区序列分析第39-46页
        3.2.1 总RNA的提取结果第39-40页
        3.2.2 扩增目的片段检测结果第40-41页
        3.2.3 基因生物信息学分析第41-46页
            3.2.3.1 CDS区序列分析第41-42页
            3.2.3.2 山羊ASIP蛋白理化性质分析第42-43页
            3.2.3.3 山羊ASIP基因磷酸化位点预测第43-44页
            3.2.3.4 山羊ASIP蛋白跨膜结构分析第44页
            3.2.3.5 山羊ASIP蛋白保守结构域分析第44页
            3.2.3.6 山羊ASIP蛋白二级结构的预测第44-45页
            3.2.3.7 ASIP基因的系统发育分析第45-46页
    3.3 ASIP基因在不同山羊中组织表达谱分析第46-50页
        3.3.1 ASIP基因半定量PCR试验循环数的确定第46-47页
        3.3.2 酉州乌羊不同组织中ASIP基因的相对表达量第47-48页
        3.3.3 渝东白山羊不同组织中ASIP基因mRNA相对表达量第48-49页
        3.3.4 酉州乌羊和渝东白山羊组织中ASIP基因的相对表达量第49-50页
    3.4 ASIP基因在不同品种山羊股四头肌中表达量与IMF的分析第50-53页
        3.4.1 ASIP基因在不同品种山羊股四头肌中的相对表达量第50-51页
        3.4.2 不同品种山羊股四头肌肌内脂肪含量第51-52页
        3.4.3 不同品种山羊ASIP基因与股四头肌IMF之间的联系第52-53页
4 讨论第53-55页
    4.1 ASIP基因序列分析第53页
    4.2 ASIP基因CDS区的扩增以及序列分析第53-54页
    4.3 ASIP基因的组织表达分析第54-55页
    4.4 ASIP基因与肌内脂肪沉积关系第55页
5 结论第55-56页
参考文献第56-61页
致谢第61-62页
附件第62-92页

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