| 摘要 | 第2-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 引言 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-22页 |
| 1.1 BLUP育种技术 | 第14-16页 |
| 1.1.1 BLUP方法的原理 | 第15页 |
| 1.1.2 BLUP法的基本步骤 | 第15-16页 |
| 1.1.3 BLUP育种值估计的优点 | 第16页 |
| 1.2 基因组选择育种 | 第16-22页 |
| 1.2.1 GS的基本思想 | 第18页 |
| 1.2.2 GS的技术路线 | 第18-19页 |
| 1.2.3 GS育种的优点 | 第19-20页 |
| 1.2.4 前景展望与存在的问题 | 第20-22页 |
| 第二章 半滑舌鳎形态性状与体质量的相关性及通径分析 | 第22-33页 |
| 2.1 数据与方法 | 第23-24页 |
| 2.1.1 数据组成及来源 | 第23页 |
| 2.1.2 研究方法 | 第23-24页 |
| 2.2 结果与分析 | 第24-31页 |
| 2.2.1 表型参数汇总 | 第24-25页 |
| 2.2.2 模型拟合结果 | 第25-27页 |
| 2.2.3 模型检验结果 | 第27-28页 |
| 2.2.4 通径分析结果 | 第28-31页 |
| 2.3 讨论 | 第31-32页 |
| 2.3.1 模型拟合 | 第31页 |
| 2.3.2 通径分析 | 第31-32页 |
| 2.4 结论 | 第32-33页 |
| 第三章 半滑舌鳎成鱼生长性状遗传参数估计 | 第33-41页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-35页 |
| 3.1.1 家系构建 | 第34页 |
| 3.1.2 数据采集及整理 | 第34页 |
| 3.1.3 遗传分析 | 第34-35页 |
| 3.2 结果与分析 | 第35-39页 |
| 3.2.1 描述性统计 | 第35-36页 |
| 3.2.2 固定效应 | 第36-37页 |
| 3.2.3 遗传力和相关性估计 | 第37-38页 |
| 3.2.4 正常雄鱼和伪雄鱼后代的育种值估计 | 第38-39页 |
| 3.3 讨论 | 第39-40页 |
| 3.3.1 表型参数 | 第39页 |
| 3.3.2 遗传力和相关性 | 第39-40页 |
| 3.4 结论 | 第40-41页 |
| 第四章 半滑舌鳎幼鱼生长及腹部颜色性状的遗传参数估计 | 第41-54页 |
| 4.1 材料与方法 | 第41-44页 |
| 4.1.1 家系构建和养殖 | 第41-42页 |
| 4.1.2 数据采集 | 第42-43页 |
| 4.1.3 统计分析 | 第43-44页 |
| 4.2 结果与分析 | 第44-50页 |
| 4.2.1 描述性统计 | 第44-48页 |
| 4.2.2 方差组分和遗传参数 | 第48-49页 |
| 4.2.3 育种性能比较 | 第49-50页 |
| 4.3 讨论 | 第50-52页 |
| 4.3.1 表型参数 | 第51页 |
| 4.3.2 遗传力 | 第51-52页 |
| 4.3.3 相关性 | 第52页 |
| 4.3.4 育种值 | 第52页 |
| 4.4 结论 | 第52-54页 |
| 第五章 半滑舌鳎抗病性状遗传参数估计 | 第54-65页 |
| 5.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 5.1.1 家系构建和养殖 | 第55页 |
| 5.1.2 感染实验及数据采集 | 第55-56页 |
| 5.1.3 数据分析 | 第56-57页 |
| 5.2 结果与分析 | 第57-62页 |
| 5.2.1 存活率统计分析 | 第57-59页 |
| 5.2.2 方差组分估计 | 第59-60页 |
| 5.2.3 遗传相关 | 第60-61页 |
| 5.2.4 家系选择 | 第61页 |
| 5.2.5 模型比较 | 第61-62页 |
| 5.3 讨论 | 第62-64页 |
| 5.3.1 人工感染 | 第62-63页 |
| 5.3.2 遗传力 | 第63页 |
| 5.3.3 相关性 | 第63-64页 |
| 5.3.4 分析模型 | 第64页 |
| 5.4 结论 | 第64-65页 |
| 第六章 半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病性状遗传参数研究 | 第65-73页 |
| 6.1 材料和方法 | 第65-66页 |
| 6.1.1 家系构建 | 第65页 |
| 6.1.2 哈维氏弧菌人工感染 | 第65-66页 |
| 6.1.3 分析方法 | 第66页 |
| 6.2 结果与分析 | 第66-70页 |
| 6.2.1 描述性统计 | 第66-68页 |
| 6.2.2 遗传参数估计 | 第68-69页 |
| 6.2.3 优良家系选留 | 第69-70页 |
| 6.3 讨论 | 第70-71页 |
| 6.3.1 表型分析 | 第70-71页 |
| 6.3.2 遗传力 | 第71页 |
| 6.4 结论 | 第71-73页 |
| 第七章 半滑舌鳎经济性状基因组选择育种方案设计 | 第73-84页 |
| 7.1 参考群体构建及表型采集 | 第73-74页 |
| 7.2 基因组DNA的提取及质量评定 | 第74-77页 |
| 7.2.1 基因组DNA提取 | 第74-75页 |
| 7.2.2 基因组DNA质量检测 | 第75-76页 |
| 7.2.3 样本个体遗传性别鉴定 | 第76-77页 |
| 7.3 基因组测序流程 | 第77-78页 |
| 7.4 数据预处理 | 第78-79页 |
| 7.4.1 表型数据的预处理及矫正 | 第78-79页 |
| 7.4.2 测序数据的预处理 | 第79页 |
| 7.5 统计分析 | 第79-82页 |
| 7.5.1 GBLUP | 第80页 |
| 7.5.2 Bayes方法 | 第80-82页 |
| 7.6 交叉验证 | 第82页 |
| 7.7 亲本选择 | 第82页 |
| 7.8 讨论 | 第82-83页 |
| 7.9 结论 | 第83-84页 |
| 第八章 基因组选择中SNP数量及分析模型筛选的模拟研究 | 第84-93页 |
| 8.1 材料与方法 | 第85-86页 |
| 8.1.1 数据模拟 | 第85页 |
| 8.1.2 分析方法 | 第85-86页 |
| 8.2 结果 | 第86-90页 |
| 8.2.1GEBV预测准确性 | 第86-87页 |
| 8.2.2 模型适合性比较 | 第87-90页 |
| 8.2.3 预测候选群体GEBV的准确性 | 第90页 |
| 8.3 讨论 | 第90-92页 |
| 8.4 结论 | 第92-93页 |
| 小结 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-115页 |
| 附录 | 第115-116页 |
| 博士期间发表论文列表 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117页 |
