| 缩略词对照表 | 第5-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| SUMMARY | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-27页 |
| 1. 牦牛相关研究进展 | 第15-18页 |
| 1.1 牦牛基础研究 | 第15-17页 |
| 1.2 牦牛分子育种研究 | 第17页 |
| 1.3 牦牛基因组学的研究 | 第17-18页 |
| 2 CNV的研究进展 | 第18-22页 |
| 2.1 CNV的定义 | 第18-19页 |
| 2.2 CNV的研究过程 | 第19页 |
| 2.3 CNV的功能及其机理 | 第19页 |
| 2.4 CNV的研究方法 | 第19-22页 |
| 3 家畜CNV的研究进展 | 第22-25页 |
| 3.1 牛CNV研究进展 | 第22-23页 |
| 3.2 羊CNV研究进展 | 第23页 |
| 3.3 猪CNV研究进展 | 第23-24页 |
| 3.4 马CNV研究进展 | 第24-25页 |
| 3.5 其他家畜和家禽CNV研究进展 | 第25页 |
| 4 本项研究的目的与意义 | 第25-27页 |
| 第二章 秦川牛CNV研究 | 第27-47页 |
| 1. 引言 | 第27-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-36页 |
| 2.1 材料 | 第28-29页 |
| 2.2 方法 | 第29-36页 |
| 3. 结果与分析 | 第36-44页 |
| 3.1 秦川牛CNV检测 | 第36-37页 |
| 3.2 秦川牛CNVRs的鉴定 | 第37-38页 |
| 3.3 根据秦川牛CNVRs绘制其染色体位置图谱 | 第38-40页 |
| 3.4 秦川牛CNVRs功能富集分析 | 第40-43页 |
| 3.5 秦川牛CNVRs与疾病相关候选基因的筛选鉴定 | 第43页 |
| 3.6 秦川牛CNVRs与已报道其他牛种CNVRs文献比对分析 | 第43-44页 |
| 4. 讨论 | 第44-46页 |
| 5. 小结 | 第46-47页 |
| 第三章天祝白牦牛和青海牦牛CNV研究 | 第47-66页 |
| 1. 引言 | 第47-48页 |
| 2. 材料与方法 | 第48-51页 |
| 2.1 材料 | 第49页 |
| 2.2 试剂与仪器 | 第49页 |
| 2.3 方法 | 第49-51页 |
| 3. 结果与分析 | 第51-62页 |
| 3.1 不同品种牦牛CNV的筛选鉴定 | 第52页 |
| 3.2 不同品种牦牛CNVR的筛选鉴定 | 第52-53页 |
| 3.3 不同品种牦牛CNVR染色体图谱构建 | 第53-55页 |
| 3.4 不同品种牦牛CNVR功能富集分析 | 第55-58页 |
| 3.5 不同品种牦牛CNVR与疾病相关基因筛选 | 第58页 |
| 3.6 不同品种牦牛CNVR与牛CNVR比对分析 | 第58-60页 |
| 3.7 荧光定量PCR验证牦牛CNVR | 第60-62页 |
| 4. 讨论 | 第62-64页 |
| 5. 小结 | 第64-66页 |
| 第四章 天祝白牦牛高原适应性候选基因-血红素加氧酶 1(HO1)的克隆、表达检测及生物信息学分析 | 第66-99页 |
| 1. 引言 | 第66-67页 |
| 2. 材料与方法 | 第67-86页 |
| 2.1 材料 | 第67页 |
| 2.2 试剂与仪器 | 第67-70页 |
| 2.3 方法 | 第70-86页 |
| 3. 结果与分析 | 第86-96页 |
| 3.1 天祝白牦牛HO1 基因序列的克隆与测序 | 第86-88页 |
| 3.2 天祝白牦牛HO1 蛋白氨基酸结构和二级结构预测 | 第88-89页 |
| 3.3 不同物种间HO1 氨基酸序列比对分析 | 第89-91页 |
| 3.4 天祝白牦牛HO1 蛋白 3D结构预测 | 第91-92页 |
| 3.5 天祝白牦牛、人和大鼠HO1 蛋白 3D结构比对分析 | 第92-94页 |
| 3.6 免疫组织化学染色对不同牦牛组织中HO1 蛋白的定位检测 | 第94-95页 |
| 3.7 荧光定量PCR检测不同牦牛组织中HO1 基因的表达 | 第95页 |
| 3.8 Western blot检测不同牦牛组织中HO1 蛋白表达 | 第95-96页 |
| 4 讨论 | 第96-98页 |
| 5 小结 | 第98-99页 |
| 第五章 总结与展望 | 第99-101页 |
| 1. 总结 | 第99-100页 |
| 2. 展望 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-108页 |
| 个人简介 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 导师简介 | 第110-113页 |
| 附件 | 第113-148页 |
| 附件 1:秦川牛CNVRS及起始位置、终止位置、片段大小和SNP数目等 | 第113-122页 |
| 附件 2:秦川牛筛选获得的基因分类及其候选基因 | 第122页 |
| 附件 3:不同品种牦牛CNVRS及起始位置、终止位置、片段大小和SNP数目等 | 第122-143页 |
| 附件 4:不同品种牦牛筛选获得的基因分类及其候选基因 | 第143-148页 |
