| 致谢 | 第1-6页 |
| 中文摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-15页 |
| ·选题背景和研究意义 | 第10-11页 |
| ·选题的背景 | 第10-11页 |
| ·选题的研究意义 | 第11页 |
| ·国内外研究现状和发展 | 第11-13页 |
| ·内源siRNA预测的现状和进展 | 第11-12页 |
| ·内源SiRNA靶标预测的研究现状和进展 | 第12页 |
| ·GO功能注释研究的现状和发展 | 第12-13页 |
| ·论文主要研究内容 | 第13-15页 |
| ·内源性SiRNA预测研究 | 第13页 |
| ·内源性SIRNA靶标预测研究 | 第13-14页 |
| ·本地GO分子功能注释软件开发和应用 | 第14-15页 |
| 第2章 实验的原理与方法 | 第15-19页 |
| ·内源SiRNA预测的原理与方法 | 第15-16页 |
| ·同源片段搜索方法 | 第15页 |
| ·基于序列和结构特征打分的预测方法 | 第15页 |
| ·基于机器学习的预测方法 | 第15-16页 |
| ·siRNA靶标预测原理和方法 | 第16-17页 |
| ·基于种子互补规则的方法 | 第16页 |
| ·基于机器学习的方法 | 第16-17页 |
| ·GO富集度分析方法 | 第17-19页 |
| ·Bottom—up方法 | 第17-18页 |
| ·Top-down方法 | 第18-19页 |
| 第3章 线虫基因组siRNA研究的问题描述及相关机理 | 第19-21页 |
| ·线虫及其基因组 | 第19页 |
| ·线虫简介 | 第19页 |
| ·线虫基因组 | 第19页 |
| ·线虫RNAi及其原理 | 第19-21页 |
| ·线虫RNA干扰 | 第20页 |
| ·线虫内源RNA干扰机理 | 第20-21页 |
| 第4章 线虫内源siRNA及其靶标预测和功能注释实验 | 第21-34页 |
| ·实验软件介绍 | 第21页 |
| ·siRNA预测软件Srnaloop | 第21页 |
| ·siRNA靶标预测软件Si-Fi | 第21页 |
| ·本地线虫GO分子注释系统构建 | 第21-23页 |
| ·基因和GO数据来源 | 第21-22页 |
| ·基因和GO数据来源 | 第22-23页 |
| ·程序流程设计步骤 | 第23页 |
| ·实验设备及方法 | 第23-24页 |
| ·实验设备 | 第23页 |
| ·实验方法 | 第23-24页 |
| ·结果与讨论 | 第24-33页 |
| ·线虫基因组内前体siRNA茎环结构结果与讨论 | 第24-26页 |
| ·siRNA及其靶标预测结果分析与讨论 | 第26-27页 |
| ·siRNA源基因与其靶标基因GO分析 | 第27-33页 |
| ·本章小结 | 第33-34页 |
| 第5章 结论 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-38页 |
| 作者简历 | 第38-40页 |
| 学位论文数据集 | 第40页 |